Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G014600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QGS9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G014600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G173700 expansin precursor, putative, expressed -
2 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
3 Sobic.006G235801 - -
4 Sobic.009G035000 expressed protein -
5 Sobic.005G187700 receptor kinase, putative, expressed -
6 Sobic.005G119400 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
7 Sobic.001G401750 - -
8 Sobic.009G025750 - -
9 Sobic.007G042700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20528920)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
10 Sobic.006G221500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@acyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.007G045750 - -
12 Sobic.003G142500 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
13 Sobic.010G100600 expressed protein -
14 Sobic.002G112200 - -
15 Sobic.006G009200 expressed protein -
16 Sobic.005G116800 - -
17 Sobic.003G162600 expressed protein -
18 Sobic.010G124100 - -
19 Sobic.006G083050 - -
20 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic001G014600--Sobic009G173700 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic001G014600--Sobic008G142500 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic001G014600--Sobic006G235801 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic001G014600--Sobic009G035000 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic001G014600--Sobic005G187700 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic001G014600--Sobic005G119400 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic001G014600--Sobic001G401750 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic001G014600--Sobic009G025750 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic001G014600--Sobic007G042700 Sobic009G173700--Sobic005G187700 Sobic009G173700--Sobic001G014600 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic009G173700--Sobic006G221500 Sobic009G173700--Sobic008G142500 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic009G173700--Sobic001G100300 Sobic009G173700--Sobic006G235801 Sobic003G341900 Sobic003G341900 Sobic009G173700--Sobic003G341900 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic009G173700--Sobic007G149500 Sobic009G173700--Sobic007G042700 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic008G142500--Sobic006G221500 Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic006G235801--Sobic010G100600 Sobic006G235801--Sobic001G014600 Sobic006G235801--Sobic007G042700 Sobic003G018150 Sobic003G018150 Sobic006G235801--Sobic003G018150 Sobic006G235801--Sobic009G173700 Sobic006G235801--Sobic006G221500 Sobic006G235801--Sobic001G100300 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic006G235801--Sobic001G278900 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic006G235801--Sobic010G089350 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic009G035000--Sobic008G041500 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic009G035000--Sobic002G062400 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic009G035000--Sobic007G045750 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic009G035000--Sobic003G129700 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic009G035000--Sobic006G009200 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic009G035000--Sobic003G282400 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic009G035000--Sobic006G193801 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic009G035000--Sobic010G002600 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic009G035000--Sobic001G163500 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic005G187700--Sobic003G072000 Sobic005G187700--Sobic009G173700 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic005G187700--Sobic003G142500 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic005G187700--Sobic009G213150 Sobic005G187700--Sobic003G341900 Sobic005G187700--Sobic007G149500 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic005G187700--Sobic002G202350 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic005G187700--Sobic001G527550 Sobic005G187700--Sobic001G014600 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic005G119400--Sobic001G050650 Sobic005G119400--Sobic007G045750 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic005G119400--Sobic002G112200 Sobic005G119400--Sobic009G025750 Sobic005G119400--Sobic001G401750 Sobic005G119400--Sobic009G035000 Sobic005G119400--Sobic001G014600 Sobic005G119400--Sobic002G062400 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic005G119400--Sobic010G124100 Sobic001G401750--Sobic002G112200 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic001G401750--Sobic004G272950 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic001G401750--Sobic004G223700 Sobic009G095720 Sobic009G095720 Sobic001G401750--Sobic009G095720 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic001G401750--Sobic003G168600 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic001G401750--Sobic007G098050 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic001G401750--Sobic001G081450 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic001G401750--Sobic006G264400 SobicK031300 SobicK031300 Sobic001G401750--SobicK031300 Sobic009G025750--Sobic001G050650 Sobic009G025750--Sobic007G045750 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic009G025750--Sobic010G166201 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic009G025750--Sobic002G073000 Sobic009G025750--Sobic003G142500 Sobic009G025750--Sobic006G083050 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic009G025750--Sobic002G094100 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic009G025750--Sobic010G259800 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic009G025750--Sobic002G094000 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic007G042700--Sobic001G497400 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic007G042700--Sobic002G000350 Sobic007G042700--Sobic001G278900 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic007G042700--Sobic003G085533 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic007G042700--Sobic004G252300 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic007G042700--Sobic004G072300 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic007G042700--Sobic001G471050 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic007G042700--Sobic004G249950 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic007G042700--Sobic006G097600
Octagon: transcription factors


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