Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G116800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PRT3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G083050 - -
2 Sobic.005G041150 - -
3 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
4 Sobic.003G261766 - -
5 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
6 Sobic.006G099400 - -
7 Sobic.009G025750 - -
8 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
9 Sobic.003G068100 receptor kinase, putative, expressed -
10 Sobic.005G119400 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
11 Sobic.005G116700 receptor kinase, putative, expressed -
12 Sobic.001G527550 - -
13 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
14 Sobic.001G065150 - -
15 Sobic.009G035000 expressed protein -
16 Sobic.001G014600 - -
17 Sobic.010G166850 - -
18 Sobic.007G179100 - -
19 Sobic.001G050650 - -
20 Sobic.003G142500 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic005G116800--Sobic006G083050 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic005G116800--Sobic005G041150 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic010G156300 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic005G116800--Sobic003G261766 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic005G116800--Sobic008G142500 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic006G099400 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G025750 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic005G116800--Sobic009G115800 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic005G116800--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic009G115800 Sobic005G041150--Sobic009G115800 Sobic005G041150--Sobic003G261766 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic005G041150--Sobic009G134700 Sobic005G041150--Sobic006G099400 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic005G041150--Sobic006G159500 Sobic005G041150--Sobic005G116800 Sobic005G041150--Sobic006G083050 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic005G041150--Sobic008G108100 Sobic006G135550 Sobic006G135550 Sobic005G041150--Sobic006G135550 Sobic010G156300--Sobic007G179100 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic010G156300--Sobic010G166850 Sobic010G156300--Sobic006G083050 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic010G156300--Sobic002G022500 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic010G156300--Sobic008G041500 SobicK032500 SobicK032500 Sobic010G156300--SobicK032500 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic010G156300--Sobic001G050650 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic010G156300--Sobic007G045750 Sobic010G156300--Sobic009G025750 Sobic003G261766--Sobic009G115800 Sobic003G261766--Sobic006G159500 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic003G261766--Sobic005G216833 Sobic003G261766--Sobic005G041150 Sobic003G261766--Sobic008G108100 Sobic003G261766--Sobic006G135550 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic003G261766--Sobic004G313000 Sobic003G261766--Sobic006G099400 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic003G261766--Sobic003G267150 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic008G142500--Sobic006G221500 Sobic006G099400--Sobic009G115800 Sobic006G099400--Sobic005G041150 Sobic006G099400--Sobic003G261766 Sobic006G099400--Sobic006G159500 Sobic004G264900 Sobic004G264900 Sobic006G099400--Sobic004G264900 Sobic006G099400--Sobic005G116800 Sobic006G099400--Sobic006G135550 Sobic006G099400--Sobic008G108100 Sobic006G099400--Sobic003G267150 Sobic009G025750--Sobic001G050650 Sobic009G025750--Sobic007G045750 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic009G025750--Sobic010G166201 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic009G025750--Sobic002G073000 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic009G025750--Sobic003G142500 Sobic009G025750--Sobic006G083050 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic009G025750--Sobic002G094100 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic009G025750--Sobic010G259800 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic009G025750--Sobic002G094000 Sobic009G115800--Sobic003G261766 Sobic009G115800--Sobic006G159500 Sobic009G115800--Sobic005G216833 Sobic009G115800--Sobic008G108100 Sobic009G115800--Sobic005G041150 Sobic009G115800--Sobic004G313000 Sobic009G115800--Sobic003G267150 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic009G115800--Sobic002G319900 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic009G115800--Sobic002G160500 Sobic003G067900 Sobic003G067900 Sobic003G068100--Sobic003G067900 Sobic003G068100--Sobic006G083050 Sobic001G534132 Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic008G142500 Sobic003G068100--Sobic005G116800 Sobic003G068100--Sobic001G326500 Sobic003G068100--Sobic002G421100 Sobic003G068100--Sobic006G159500 Sobic003G068100--Sobic009G115800
Octagon: transcription factors


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