Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G166850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VTH0
Pfam PF00854
Panther DB PTHR11654 PTHR11654:SF90
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0006810transport GO:0005215transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19640 : Major facilitator superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g48570.1 : peptide transporter PTR2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045511
Brachypodium PNT78399 , PNT78398
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G022500 - -
2 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
3 Sobic.K032500 - K10908: POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial
4 Sobic.007G179100 - -
5 Sobic.009G258800 - -
6 Sobic.001G050650 - -
7 Sobic.001G180950 - -
8 Sobic.007G045750 - -
9 Sobic.009G025750 - -
10 Sobic.010G166201 - -
11 Sobic.010G207175 - -
12 Sobic.009G158150 - -
13 Sobic.010G259800 - -
14 Sobic.006G083050 - -
15 Sobic.001G527550 - -
16 Sobic.001G163500 - -
17 Sobic.005G075700 CHASE domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G041500 - -
19 Sobic.008G081100 - -
20 Sobic.002G062400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic010G166850--Sobic002G022500 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic010G166850--Sobic010G156300 SobicK032500 SobicK032500 Sobic010G166850--SobicK032500 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic010G166850--Sobic007G179100 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic010G166850--Sobic009G258800 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic010G166850--Sobic001G050650 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic010G166850--Sobic001G180950 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic010G166850--Sobic007G045750 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G166850--Sobic009G025750 Sobic002G022500--SobicK032500 Sobic002G022500--Sobic010G166850 Sobic002G022500--Sobic009G258800 Sobic002G022500--Sobic010G156300 Sobic002G022500--Sobic001G050650 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic002G022500--Sobic001G527550 Sobic002G022500--Sobic001G180950 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic002G022500--Sobic010G166201 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic002G022500--Sobic002G018200 Sobic010G156300--Sobic007G179100 Sobic010G156300--Sobic010G166850 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic010G156300--Sobic006G083050 Sobic010G156300--Sobic002G022500 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic010G156300--Sobic008G041500 Sobic010G156300--SobicK032500 Sobic010G156300--Sobic001G050650 Sobic010G156300--Sobic007G045750 Sobic010G156300--Sobic009G025750 SobicK032500--Sobic002G022500 SobicK032500--Sobic010G166850 SobicK032500--Sobic001G527550 SobicK032500--Sobic002G018200 Sobic004G334501 Sobic004G334501 SobicK032500--Sobic004G334501 SobicK032500--Sobic001G050650 SobicK032500--Sobic001G180950 SobicK032500--Sobic010G156300 SobicK032500--Sobic010G166201 Sobic007G179100--Sobic010G156300 Sobic007G179100--Sobic010G166850 Sobic007G179100--Sobic008G041500 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic007G179100--Sobic010G207175 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic007G179100--Sobic001G163500 Sobic007G179100--Sobic007G045750 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic007G179100--Sobic003G282400 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic007G179100--Sobic009G035000 Sobic007G179100--Sobic002G022500 Sobic009G258800--Sobic002G022500 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic009G258800--Sobic005G192350 Sobic009G258800--Sobic010G166850 Sobic009G258800--Sobic010G166201 Sobic009G258800--SobicK032500 Sobic008G081100 Sobic008G081100 Sobic009G258800--Sobic008G081100 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic009G258800--Sobic010G259800 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic009G258800--Sobic009G158150 Sobic009G258800--Sobic007G179100 Sobic001G050650--Sobic007G045750 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic001G050650--Sobic002G112200 Sobic001G050650--Sobic009G025750 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic001G050650--Sobic002G073000 Sobic001G050650--Sobic010G166201 Sobic001G050650--SobicK032500 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic001G050650--Sobic005G119400 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic001G050650--Sobic002G062400 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic001G050650--Sobic004G223700 Sobic001G180950--Sobic002G022500 Sobic001G180950--SobicK032500 Sobic001G180950--Sobic010G166850 Sobic001G180950--Sobic001G527550 Sobic001G180950--Sobic009G025750 Sobic001G180950--Sobic010G156300 Sobic001G180950--Sobic007G179100 Sobic001G180950--Sobic009G258800 Sobic001G180950--Sobic001G050650 Sobic007G045750--Sobic002G062400 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic007G045750--Sobic003G129700 Sobic007G045750--Sobic001G050650 Sobic007G045750--Sobic009G158150 Sobic007G045750--Sobic009G025750 Sobic007G045750--Sobic001G163500 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic007G045750--Sobic006G009200 Sobic007G045750--Sobic009G035000 Sobic007G045750--Sobic002G112200 Sobic009G025750--Sobic001G050650 Sobic009G025750--Sobic007G045750 Sobic009G025750--Sobic010G166201 Sobic009G025750--Sobic002G073000 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic009G025750--Sobic003G142500 Sobic009G025750--Sobic006G083050 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic009G025750--Sobic002G094100 Sobic009G025750--Sobic010G259800 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic009G025750--Sobic002G094000
Octagon: transcription factors


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