Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G156300.1
Synonym
Functional annotation rp1, putative, expressed
UniProt A0A194YJI0
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF627
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14460 : LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g57340.1 : rp1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053792 , Zm00025a053795 , Zm00025a053794 , Zm00025a053796
Brachypodium PNT72981 , KQK10078 , PNT72980
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G179100 - -
2 Sobic.010G166850 - -
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11 Sobic.005G116800 - -
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13 Sobic.001G180950 - -
14 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
15 Sobic.001G163500 - -
16 Sobic.005G119400 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
17 Sobic.009G158150 - -
18 Sobic.002G062400 - -
19 Sobic.003G282400 OsMADS32 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
20 Sobic.003G129700 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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