Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G179100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PIC8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
2 Sobic.010G166850 - -
3 Sobic.008G041500 - -
4 Sobic.010G207175 - -
5 Sobic.001G163500 - -
6 Sobic.007G045750 - -
7 Sobic.003G282400 OsMADS32 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
8 Sobic.009G035000 expressed protein -
9 Sobic.002G022500 - -
10 Sobic.006G083050 - -
11 Sobic.009G158150 - -
12 Sobic.002G062400 - -
13 Sobic.003G261766 - -
14 Sobic.003G129700 - -
15 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
16 Sobic.001G050650 - -
17 Sobic.K032500 - K10908: POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial
18 Sobic.009G025750 - -
19 Sobic.002G319900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AAA family ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
20 Sobic.009G258800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic007G179100--Sobic010G156300 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic007G179100--Sobic010G166850 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic007G179100--Sobic008G041500 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic007G179100--Sobic010G207175 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic007G179100--Sobic001G163500 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic007G179100--Sobic007G045750 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic007G179100--Sobic003G282400 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic007G179100--Sobic009G035000 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic007G179100--Sobic002G022500 Sobic010G156300--Sobic007G179100 Sobic010G156300--Sobic010G166850 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic010G156300--Sobic006G083050 Sobic010G156300--Sobic002G022500 Sobic010G156300--Sobic008G041500 SobicK032500 SobicK032500 Sobic010G156300--SobicK032500 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic010G156300--Sobic001G050650 Sobic010G156300--Sobic007G045750 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G156300--Sobic009G025750 Sobic010G166850--Sobic002G022500 Sobic010G166850--Sobic010G156300 Sobic010G166850--SobicK032500 Sobic010G166850--Sobic007G179100 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic010G166850--Sobic009G258800 Sobic010G166850--Sobic001G050650 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic010G166850--Sobic001G180950 Sobic010G166850--Sobic007G045750 Sobic010G166850--Sobic009G025750 Sobic008G041500--Sobic009G035000 Sobic008G041500--Sobic003G282400 Sobic008G041500--Sobic007G179100 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic008G041500--Sobic010G002600 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic008G041500--Sobic002G062400 Sobic008G041500--Sobic001G163500 Sobic008G041500--Sobic010G156300 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic008G041500--Sobic003G129700 Sobic008G041500--Sobic007G045750 Sobic010G207175--Sobic007G179100 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic010G207175--Sobic006G243300 Sobic010G207175--Sobic001G163500 Sobic010G207175--Sobic010G166850 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic010G207175--Sobic006G210266 Sobic010G207175--Sobic010G156300 Sobic010G207175--Sobic009G258800 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic010G207175--Sobic009G158150 Sobic010G207175--Sobic008G041500 Sobic001G163500--Sobic003G129700 Sobic001G163500--Sobic009G158150 Sobic001G163500--Sobic002G062400 Sobic001G163500--Sobic003G282400 Sobic001G163500--Sobic007G045750 Sobic001G163500--Sobic007G179100 Sobic001G163500--Sobic008G041500 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic001G163500--Sobic002G312550 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic001G163500--Sobic006G193801 Sobic007G045750--Sobic002G062400 Sobic007G045750--Sobic003G129700 Sobic007G045750--Sobic001G050650 Sobic007G045750--Sobic009G158150 Sobic007G045750--Sobic009G025750 Sobic007G045750--Sobic001G163500 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic007G045750--Sobic006G009200 Sobic007G045750--Sobic009G035000 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic007G045750--Sobic002G112200 Sobic003G282400--Sobic002G062400 Sobic003G282400--Sobic001G163500 Sobic003G282400--Sobic003G129700 Sobic003G282400--Sobic006G009200 Sobic003G282400--Sobic008G041500 Sobic003G282400--Sobic009G035000 Sobic003G282400--Sobic007G045750 Sobic003G282400--Sobic006G193801 Sobic003G282400--Sobic009G158150 Sobic009G035000--Sobic008G041500 Sobic009G035000--Sobic002G062400 Sobic009G035000--Sobic007G045750 Sobic009G035000--Sobic003G129700 Sobic009G035000--Sobic006G009200 Sobic009G035000--Sobic003G282400 Sobic009G035000--Sobic006G193801 Sobic009G035000--Sobic010G002600 Sobic009G035000--Sobic001G163500 Sobic002G022500--SobicK032500 Sobic002G022500--Sobic010G166850 Sobic002G022500--Sobic009G258800 Sobic002G022500--Sobic010G156300 Sobic002G022500--Sobic001G050650 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic002G022500--Sobic001G527550 Sobic002G022500--Sobic001G180950 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic002G022500--Sobic010G166201 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic002G022500--Sobic002G018200
Octagon: transcription factors


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