Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G258800.1,Sobic.009G258800.3,Sobic.009G258800.4,Sobic.009G258800.5,Sobic.009G258800.6
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PAG5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G022500 - -
2 Sobic.005G192350 - -
3 Sobic.010G166850 - -
4 Sobic.010G166201 - -
5 Sobic.K032500 - K10908: POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial
6 Sobic.008G081100 - -
7 Sobic.010G259800 - -
8 Sobic.009G158150 - -
9 Sobic.007G179100 - -
10 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
11 Sobic.001G180950 - -
12 Sobic.009G077901 - -
13 Sobic.001G443400 conserved hypothetical protein -
14 Sobic.001G516400 - -
15 Sobic.006G243300 expressed protein -
16 Sobic.003G013300 expressed protein -
17 Sobic.010G207175 - -
18 Sobic.001G163500 - -
19 Sobic.001G050650 - -
20 Sobic.009G025750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic009G258800--Sobic002G022500 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic009G258800--Sobic005G192350 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic009G258800--Sobic010G166850 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic009G258800--Sobic010G166201 SobicK032500 SobicK032500 Sobic009G258800--SobicK032500 Sobic008G081100 Sobic008G081100 Sobic009G258800--Sobic008G081100 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic009G258800--Sobic010G259800 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic009G258800--Sobic009G158150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic009G258800--Sobic007G179100 Sobic002G022500--SobicK032500 Sobic002G022500--Sobic010G166850 Sobic002G022500--Sobic009G258800 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic002G022500--Sobic010G156300 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic002G022500--Sobic001G050650 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic002G022500--Sobic001G527550 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic002G022500--Sobic001G180950 Sobic002G022500--Sobic010G166201 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic002G022500--Sobic002G018200 Sobic005G192350--Sobic008G081100 Sobic005G192350--Sobic009G258800 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic005G192350--Sobic010G266400 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic005G192350--Sobic003G013300 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic005G192350--Sobic001G443400 Sobic005G192350--Sobic010G166201 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic005G192350--Sobic002G199300 Sobic005G192350--Sobic010G259800 Sobic007G020400 Sobic007G020400 Sobic005G192350--Sobic007G020400 Sobic010G166850--Sobic002G022500 Sobic010G166850--Sobic010G156300 Sobic010G166850--SobicK032500 Sobic010G166850--Sobic007G179100 Sobic010G166850--Sobic009G258800 Sobic010G166850--Sobic001G050650 Sobic010G166850--Sobic001G180950 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic010G166850--Sobic007G045750 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G166850--Sobic009G025750 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic010G166201--Sobic002G073000 Sobic010G166201--Sobic009G158150 Sobic010G166201--Sobic010G259800 Sobic010G166201--Sobic001G050650 Sobic010G166201--Sobic001G443400 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic010G166201--Sobic006G053601 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic010G166201--Sobic010G098800 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic010G166201--Sobic001G516400 Sobic010G166201--Sobic007G045750 SobicK032500--Sobic002G022500 SobicK032500--Sobic010G166850 SobicK032500--Sobic001G527550 SobicK032500--Sobic002G018200 Sobic004G334501 Sobic004G334501 SobicK032500--Sobic004G334501 SobicK032500--Sobic001G050650 SobicK032500--Sobic001G180950 SobicK032500--Sobic010G156300 SobicK032500--Sobic010G166201 Sobic008G081100--Sobic001G443400 Sobic008G174200 Sobic008G174200 Sobic008G081100--Sobic008G174200 Sobic008G081100--Sobic005G192350 Sobic008G081100--Sobic010G166201 Sobic008G081100--Sobic010G259800 Sobic008G081100--Sobic009G258800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic008G081100--Sobic006G250350 Sobic008G081100--Sobic002G022500 Sobic010G033750 Sobic010G033750 Sobic008G081100--Sobic010G033750 Sobic010G259800--Sobic010G166201 Sobic010G259800--Sobic002G073000 Sobic010G259800--Sobic001G443400 Sobic010G259800--Sobic009G025750 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic010G259800--Sobic003G142500 Sobic010G259800--Sobic002G022500 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic010G259800--Sobic002G094100 Sobic010G259800--SobicK032500 Sobic010G259800--Sobic008G081100 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic009G158150--Sobic003G129700 Sobic009G158150--Sobic007G045750 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic009G158150--Sobic001G163500 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic009G158150--Sobic002G062400 Sobic009G158150--Sobic010G166201 Sobic009G158150--Sobic001G516400 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic009G158150--Sobic004G249950 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic009G158150--Sobic005G168900 Sobic009G158150--Sobic001G050650 Sobic007G179100--Sobic010G156300 Sobic007G179100--Sobic010G166850 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic007G179100--Sobic008G041500 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic007G179100--Sobic010G207175 Sobic007G179100--Sobic001G163500 Sobic007G179100--Sobic007G045750 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic007G179100--Sobic003G282400 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic007G179100--Sobic009G035000 Sobic007G179100--Sobic002G022500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.