Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G243300.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RFD9
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF96
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g25670.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G207175 - -
2 Sobic.006G210266 - -
3 Sobic.001G163500 - -
4 Sobic.001G314350 - -
5 Sobic.003G116200 expressed protein -
6 Sobic.009G258800 - -
7 Sobic.002G312550 - -
8 Sobic.005G192350 - -
9 Sobic.003G013300 expressed protein -
10 Sobic.009G158150 - -
11 Sobic.007G179100 - -
12 Sobic.010G166850 - -
13 Sobic.005G123300 rhamnogalacturonate lyase, putative, expressed K18195: RGL4, rhamnogalacturonan endolyase
14 Sobic.002G104450 - -
15 Sobic.003G129700 - -
16 Sobic.003G096750 - -
17 Sobic.002G022500 - -
18 Sobic.001G152150 - -
19 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
20 Sobic.010G166201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic006G243300--Sobic010G207175 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic006G243300--Sobic006G210266 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic006G243300--Sobic001G163500 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic006G243300--Sobic001G314350 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic006G243300--Sobic003G116200 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic006G243300--Sobic009G258800 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic006G243300--Sobic002G312550 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic006G243300--Sobic005G192350 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic006G243300--Sobic003G013300 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic010G207175--Sobic007G179100 Sobic010G207175--Sobic006G243300 Sobic010G207175--Sobic001G163500 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic010G207175--Sobic010G166850 Sobic010G207175--Sobic006G210266 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic010G207175--Sobic010G156300 Sobic010G207175--Sobic009G258800 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic010G207175--Sobic009G158150 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic010G207175--Sobic008G041500 Sobic006G210266--Sobic001G314350 Sobic006G210266--Sobic010G207175 Sobic006G210266--Sobic001G163500 Sobic006G210266--Sobic002G312550 Sobic006G210266--Sobic006G243300 Sobic001G152150 Sobic001G152150 Sobic006G210266--Sobic001G152150 Sobic006G210266--Sobic007G179100 Sobic006G210266--Sobic010G166850 Sobic008G040201 Sobic008G040201 Sobic006G210266--Sobic008G040201 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic001G163500--Sobic003G129700 Sobic001G163500--Sobic009G158150 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic001G163500--Sobic002G062400 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic001G163500--Sobic003G282400 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic001G163500--Sobic007G045750 Sobic001G163500--Sobic007G179100 Sobic001G163500--Sobic008G041500 Sobic001G163500--Sobic002G312550 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic001G163500--Sobic006G193801 Sobic001G314350--Sobic003G116200 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic001G314350--Sobic004G073232 Sobic001G314350--Sobic006G210266 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic001G314350--Sobic010G246800 Sobic001G314350--Sobic002G312550 Sobic002G104450 Sobic002G104450 Sobic001G314350--Sobic002G104450 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic001G314350--Sobic010G120900 Sobic001G314350--Sobic006G243300 Sobic001G314350--Sobic001G152150 Sobic003G116200--Sobic001G314350 Sobic003G116200--Sobic010G246800 Sobic003G116200--Sobic010G120900 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic003G116200--Sobic010G214150 Sobic003G116200--Sobic002G312550 Sobic003G116200--Sobic003G013300 Sobic001G308350 Sobic001G308350 Sobic003G116200--Sobic001G308350 Sobic005G122000 Sobic005G122000 Sobic003G116200--Sobic005G122000 Sobic003G116200--Sobic006G243300 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic009G258800--Sobic002G022500 Sobic009G258800--Sobic005G192350 Sobic009G258800--Sobic010G166850 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic009G258800--Sobic010G166201 SobicK032500 SobicK032500 Sobic009G258800--SobicK032500 Sobic008G081100 Sobic008G081100 Sobic009G258800--Sobic008G081100 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic009G258800--Sobic010G259800 Sobic009G258800--Sobic009G158150 Sobic009G258800--Sobic007G179100 Sobic002G312550--Sobic010G214150 Sobic005G123300 Sobic005G123300 Sobic002G312550--Sobic005G123300 Sobic002G312550--Sobic001G163500 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic002G312550--Sobic003G096750 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic002G312550--Sobic004G252300 Sobic002G312550--Sobic009G158150 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic003G013300 Sobic002G312550--Sobic001G314350 Sobic005G192350--Sobic008G081100 Sobic005G192350--Sobic009G258800 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic005G192350--Sobic010G266400 Sobic005G192350--Sobic003G013300 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic005G192350--Sobic001G443400 Sobic005G192350--Sobic010G166201 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic005G192350--Sobic002G199300 Sobic005G192350--Sobic010G259800 Sobic007G020400 Sobic007G020400 Sobic005G192350--Sobic007G020400 Sobic003G013300--Sobic005G192350 Sobic003G013300--Sobic004G252300 Sobic003G013300--Sobic002G312550 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic003G013300--Sobic009G077901 Sobic003G013300--Sobic005G123300 Sobic003G013300--Sobic003G116200 Sobic003G013300--Sobic010G214150 Sobic003G013300--Sobic002G199300 Sobic003G013300--Sobic010G246800
Octagon: transcription factors


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