Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G166201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VTH7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g37600.1 : glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G073000 - -
2 Sobic.009G158150 - -
3 Sobic.010G259800 - -
4 Sobic.001G050650 - -
5 Sobic.001G443400 conserved hypothetical protein -
6 Sobic.006G053601 - -
7 Sobic.010G098800 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed K03884: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
8 Sobic.001G516400 - -
9 Sobic.007G045750 - -
10 Sobic.009G025750 - -
11 Sobic.009G215100 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G094100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
14 Sobic.002G022500 - -
15 Sobic.004G249950 - -
16 Sobic.003G205000 DUF623 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.009G148400 - -
18 Sobic.004G223700 - -
19 Sobic.K032500 - K10908: POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial
20 Sobic.009G258800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic010G166201--Sobic002G073000 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic010G166201--Sobic009G158150 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic010G166201--Sobic010G259800 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic010G166201--Sobic001G050650 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic010G166201--Sobic001G443400 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic010G166201--Sobic006G053601 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic010G166201--Sobic010G098800 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic010G166201--Sobic001G516400 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic010G166201--Sobic007G045750 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic002G073000--Sobic002G094000 Sobic002G073000--Sobic010G166201 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic002G073000--Sobic005G024500 Sobic002G073000--Sobic010G098800 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic002G073000--Sobic003G173200 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic002G073000--Sobic004G223700 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic002G073000--Sobic002G094100 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic002G073000--Sobic004G334501 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic002G073000--Sobic002G121050 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic009G158150--Sobic003G129700 Sobic009G158150--Sobic007G045750 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic009G158150--Sobic001G163500 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic009G158150--Sobic002G062400 Sobic009G158150--Sobic010G166201 Sobic009G158150--Sobic001G516400 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic009G158150--Sobic004G249950 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic009G158150--Sobic005G168900 Sobic009G158150--Sobic001G050650 Sobic010G259800--Sobic010G166201 Sobic010G259800--Sobic002G073000 Sobic010G259800--Sobic001G443400 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G259800--Sobic009G025750 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic010G259800--Sobic003G142500 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic010G259800--Sobic002G022500 Sobic010G259800--Sobic002G094100 SobicK032500 SobicK032500 Sobic010G259800--SobicK032500 Sobic008G081100 Sobic008G081100 Sobic010G259800--Sobic008G081100 Sobic001G050650--Sobic007G045750 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic001G050650--Sobic002G112200 Sobic001G050650--Sobic009G025750 Sobic001G050650--Sobic002G073000 Sobic001G050650--Sobic010G166201 Sobic001G050650--SobicK032500 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic001G050650--Sobic005G119400 Sobic001G050650--Sobic002G062400 Sobic001G050650--Sobic004G223700 Sobic001G443400--Sobic008G081100 Sobic001G443400--Sobic002G094100 Sobic001G443400--Sobic010G166201 Sobic001G443400--Sobic010G259800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic001G443400--Sobic006G250350 Sobic008G174200 Sobic008G174200 Sobic001G443400--Sobic008G174200 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic001G443400--Sobic010G266400 Sobic001G443400--Sobic002G073000 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic001G443400--Sobic005G192350 Sobic006G053601--Sobic002G073000 Sobic006G053601--Sobic010G098800 Sobic006G053601--Sobic004G223700 Sobic006G053601--Sobic010G166201 Sobic006G053601--Sobic001G050650 Sobic006G053601--Sobic007G045750 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic006G053601--Sobic001G081450 Sobic006G053601--Sobic003G173200 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic006G053601--Sobic009G148400 Sobic010G098800--Sobic004G223700 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic010G098800--Sobic007G116150 Sobic010G098800--Sobic001G081450 Sobic010G098800--Sobic003G173200 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic010G098800--Sobic004G206000 SobicK032600 SobicK032600 Sobic010G098800--SobicK032600 Sobic010G098800--Sobic009G148400 SobicK032400 SobicK032400 Sobic010G098800--SobicK032400 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic010G098800--Sobic003G268100 Sobic001G516400--Sobic009G158150 Sobic001G516400--Sobic010G166201 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic001G516400--Sobic002G178900 Sobic001G516400--Sobic005G168900 Sobic001G516400--Sobic007G045750 Sobic001G516400--Sobic006G053601 Sobic001G516400--Sobic010G098800 Sobic001G516400--Sobic003G129700 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic001G516400--Sobic006G174050 Sobic007G045750--Sobic002G062400 Sobic007G045750--Sobic003G129700 Sobic007G045750--Sobic001G050650 Sobic007G045750--Sobic009G158150 Sobic007G045750--Sobic009G025750 Sobic007G045750--Sobic001G163500 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic007G045750--Sobic006G009200 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic007G045750--Sobic009G035000 Sobic007G045750--Sobic002G112200
Octagon: transcription factors


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