Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G205000.1
Synonym Sb03g026650, ATOFP14, OFP14
Functional annotation DUF623 domain containing protein, expressed
UniProt C5XPK1
Pfam PF04844
Panther DB PTHR33057 PTHR33057:SF29
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G79960 : ovate family protein 14
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g40970.1 : DUF623 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G006440.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G215100 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G053550 - -
3 Sobic.002G199300 - -
4 Sobic.002G334700 - -
5 Sobic.004G310350 - -
6 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
7 Sobic.001G224500 - -
8 Sobic.K031400 ATP synthase protein YMF19, putative, expressed K02109: ATPF0B, F-type H+-transporting ATPase subunit b
9 Sobic.002G094100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G166201 - -
11 Sobic.008G129500 - -
12 Sobic.002G073000 - -
13 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G174050 - K12662: PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP4
15 Sobic.005G176300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
16 Sobic.003G436100 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G268100 - -
18 Sobic.010G098800 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed K03884: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
19 Sobic.010G266400 - -
20 Sobic.005G019250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic003G205000--Sobic009G215100 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic003G205000--Sobic006G053550 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic003G205000--Sobic002G199300 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic003G205000--Sobic002G334700 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic003G205000--Sobic004G310350 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic003G205000--Sobic003G173200 Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic003G205000--Sobic001G224500 SobicK031400 SobicK031400 Sobic003G205000--SobicK031400 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic003G205000--Sobic002G094100 Sobic009G215100--Sobic006G053550 Sobic009G215100--Sobic003G173200 Sobic009G215100--Sobic003G205000 Sobic009G215100--SobicK031400 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic009G215100--Sobic003G268100 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic009G215100--Sobic010G098800 Sobic009G215100--Sobic001G224500 SobicK031900 SobicK031900 Sobic009G215100--SobicK031900 Sobic009G215100--Sobic004G310350 Sobic006G053550--Sobic009G215100 Sobic006G053550--Sobic004G310350 Sobic006G053550--Sobic003G205000 Sobic006G053550--Sobic001G224500 Sobic006G053550--SobicK031400 Sobic006G053550--Sobic003G173200 Sobic006G053550--SobicK031900 Sobic006G053550--Sobic003G268100 Sobic006G053550--Sobic002G334700 Sobic002G199300--Sobic003G205000 Sobic002G199300--Sobic002G334700 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic002G199300--Sobic010G266400 Sobic002G199300--Sobic009G215100 Sobic002G199300--Sobic006G053550 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic002G199300--Sobic001G443400 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic002G199300--Sobic006G174050 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic002G199300--Sobic005G192350 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic002G199300--Sobic010G166201 Sobic002G334700--Sobic003G205000 Sobic002G334700--Sobic002G199300 Sobic002G334700--Sobic009G215100 Sobic002G334700--Sobic006G053550 Sobic003G436100 Sobic003G436100 Sobic002G334700--Sobic003G436100 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic002G334700--Sobic003G059450 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic002G334700--Sobic009G188200 Sobic002G334700--Sobic002G094100 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic002G334700--Sobic003G031300 Sobic004G310350--Sobic006G053550 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic004G310350--Sobic005G019250 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G310350--Sobic002G214000 Sobic004G310350--Sobic001G224500 Sobic004G310350--SobicK031900 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic004G310350--Sobic008G129500 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic004G310350--Sobic005G154600 Sobic004G310350--Sobic009G215100 Sobic004G310350--Sobic003G268100 Sobic003G173200--Sobic003G268100 Sobic003G173200--Sobic009G215100 Sobic003G173200--SobicK031400 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic003G173200--Sobic007G116150 Sobic003G173200--Sobic010G098800 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic003G173200--Sobic010G143700 Sobic003G173200--Sobic006G053550 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic003G173200--Sobic004G223700 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic003G173200--Sobic002G073000 Sobic001G224500--Sobic006G053550 Sobic001G224500--SobicK031400 Sobic001G224500--Sobic003G268100 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic001G224500--Sobic010G247750 Sobic001G224500--Sobic008G129500 Sobic001G224500--Sobic010G143700 Sobic001G224500--SobicK031900 Sobic001G224500--Sobic009G215100 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic001G224500--Sobic002G112500 SobicK031400--Sobic003G268100 SobicK031400--Sobic003G173200 SobicK031400--Sobic010G143700 SobicK031400--SobicK031900 SobicK031400--Sobic009G215100 SobicK031400--Sobic001G224500 SobicK031400--Sobic007G116150 SobicK031400--Sobic006G053550 SobicK031400--Sobic010G098800 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic002G094100--Sobic002G094000 Sobic002G094100--Sobic002G073000 Sobic002G094100--Sobic001G443400 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic002G094100--Sobic003G142500 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic002G094100--Sobic005G024500 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic002G094100--Sobic004G278800 Sobic002G094100--Sobic010G166201 Sobic002G094100--Sobic002G334700 Sobic005G019300 Sobic005G019300 Sobic002G094100--Sobic005G019300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.