Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G224500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QKE1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.001G224500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G053550 - -
2 Sobic.K031400 ATP synthase protein YMF19, putative, expressed K02109: ATPF0B, F-type H+-transporting ATPase subunit b
3 Sobic.003G268100 - -
4 Sobic.010G247750 - -
5 Sobic.008G129500 - -
6 Sobic.010G143700 - -
7 Sobic.K031900 - -
8 Sobic.009G215100 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G112500 - -
10 Sobic.008G100201 - -
11 Sobic.004G310350 - -
12 Sobic.003G260500 - -
13 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
14 Sobic.007G116150 - -
15 Sobic.004G115100 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
16 Sobic.007G200700 pyridoxamine 5\'-phosphate oxidase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G208200 - -
18 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
19 Sobic.008G093300 - -
20 Sobic.010G098800 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed K03884: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6


Gene co-expression network
sample Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic001G224500--Sobic006G053550 SobicK031400 SobicK031400 Sobic001G224500--SobicK031400 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic001G224500--Sobic003G268100 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic001G224500--Sobic010G247750 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic001G224500--Sobic008G129500 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic001G224500--Sobic010G143700 SobicK031900 SobicK031900 Sobic001G224500--SobicK031900 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic001G224500--Sobic009G215100 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic001G224500--Sobic002G112500 Sobic006G053550--Sobic009G215100 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic006G053550--Sobic004G310350 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic006G053550--Sobic003G205000 Sobic006G053550--Sobic001G224500 Sobic006G053550--SobicK031400 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic006G053550--Sobic003G173200 Sobic006G053550--SobicK031900 Sobic006G053550--Sobic003G268100 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic006G053550--Sobic002G334700 SobicK031400--Sobic003G268100 SobicK031400--Sobic003G173200 SobicK031400--Sobic010G143700 SobicK031400--SobicK031900 SobicK031400--Sobic009G215100 SobicK031400--Sobic001G224500 Sobic007G116150 Sobic007G116150 SobicK031400--Sobic007G116150 SobicK031400--Sobic006G053550 Sobic010G098800 Sobic010G098800 SobicK031400--Sobic010G098800 Sobic003G268100--Sobic010G143700 Sobic003G268100--Sobic007G116150 Sobic003G268100--Sobic003G173200 Sobic003G268100--SobicK031400 Sobic003G268100--SobicK031900 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic003G268100--Sobic004G130500 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic003G268100--Sobic009G094100 Sobic003G268100--Sobic010G247750 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic003G268100--Sobic006G035350 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic010G247750--Sobic007G127200 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic010G247750--Sobic003G260500 Sobic010G247750--Sobic006G035350 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic010G247750--Sobic008G093300 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic010G247750--Sobic004G134400 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic010G247750--Sobic007G103200 Sobic010G247750--Sobic010G143700 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic010G247750--Sobic010G052100 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic010G247750--Sobic009G079600 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic008G129500--Sobic004G072300 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic008G129500--Sobic002G000350 Sobic008G129500--Sobic001G224500 Sobic008G129500--Sobic004G310350 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic008G129500--Sobic003G085533 Sobic008G129500--Sobic002G112500 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic008G129500--Sobic001G497400 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic008G129500--Sobic003G368550 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic008G129500--Sobic007G023000 Sobic010G143700--Sobic003G268100 Sobic010G143700--Sobic007G116150 Sobic010G143700--Sobic004G130500 Sobic010G143700--SobicK031900 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic010G143700--Sobic008G100201 Sobic010G143700--Sobic006G035350 SobicK032400 SobicK032400 Sobic010G143700--SobicK032400 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic010G143700--Sobic009G209650 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic010G143700--Sobic004G115100 SobicK031900--Sobic008G100201 SobicK031900--Sobic010G143700 SobicK031900--Sobic003G268100 SobicK031900--Sobic004G115100 Sobic007G200700 Sobic007G200700 SobicK031900--Sobic007G200700 SobicK031900--Sobic007G116150 SobicK031900--SobicK031400 SobicK031900--Sobic006G035350 Sobic001G383350 Sobic001G383350 SobicK031900--Sobic001G383350 Sobic009G215100--Sobic006G053550 Sobic009G215100--Sobic003G173200 Sobic009G215100--Sobic003G205000 Sobic009G215100--SobicK031400 Sobic009G215100--Sobic003G268100 Sobic009G215100--Sobic010G098800 Sobic009G215100--Sobic001G224500 Sobic009G215100--SobicK031900 Sobic009G215100--Sobic004G310350 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic002G112500--Sobic001G081450 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic002G112500--Sobic009G145200 Sobic002G112500--Sobic001G383350 Sobic002G112500--SobicK032400 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic002G112500--Sobic001G471050 SobicK032600 SobicK032600 Sobic002G112500--SobicK032600 Sobic002G112500--Sobic002G000350 Sobic002G112500--Sobic007G116150 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic002G112500--Sobic007G098050
Octagon: transcription factors


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