Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G199300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QCG1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G205000 DUF623 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G334700 - -
3 Sobic.010G266400 - -
4 Sobic.009G215100 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G053550 - -
6 Sobic.001G443400 conserved hypothetical protein -
7 Sobic.006G174050 - K12662: PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP4
8 Sobic.005G192350 - -
9 Sobic.010G166201 - -
10 Sobic.003G031300 - -
11 Sobic.007G050650 - -
12 Sobic.004G310350 - -
13 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
14 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
15 Sobic.008G178600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G094100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G436100 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G013300 expressed protein -
19 Sobic.003G059450 - -
20 Sobic.K031400 ATP synthase protein YMF19, putative, expressed K02109: ATPF0B, F-type H+-transporting ATPase subunit b


Gene co-expression network
sample Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic002G199300--Sobic003G205000 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic002G199300--Sobic002G334700 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic002G199300--Sobic010G266400 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic002G199300--Sobic009G215100 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic002G199300--Sobic006G053550 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic002G199300--Sobic001G443400 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic002G199300--Sobic006G174050 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic002G199300--Sobic005G192350 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic002G199300--Sobic010G166201 Sobic003G205000--Sobic009G215100 Sobic003G205000--Sobic006G053550 Sobic003G205000--Sobic002G199300 Sobic003G205000--Sobic002G334700 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic003G205000--Sobic004G310350 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic003G205000--Sobic003G173200 Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic003G205000--Sobic001G224500 SobicK031400 SobicK031400 Sobic003G205000--SobicK031400 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic003G205000--Sobic002G094100 Sobic002G334700--Sobic003G205000 Sobic002G334700--Sobic002G199300 Sobic002G334700--Sobic009G215100 Sobic002G334700--Sobic006G053550 Sobic003G436100 Sobic003G436100 Sobic002G334700--Sobic003G436100 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic002G334700--Sobic003G059450 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic002G334700--Sobic009G188200 Sobic002G334700--Sobic002G094100 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic002G334700--Sobic003G031300 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic010G266400--Sobic007G050650 Sobic010G266400--Sobic002G199300 Sobic010G266400--Sobic001G443400 Sobic010G266400--Sobic005G192350 Sobic010G266400--Sobic003G205000 Sobic010G266400--Sobic006G174050 Sobic007G020400 Sobic007G020400 Sobic010G266400--Sobic007G020400 Sobic010G266400--Sobic002G334700 Sobic010G064300 Sobic010G064300 Sobic010G266400--Sobic010G064300 Sobic009G215100--Sobic006G053550 Sobic009G215100--Sobic003G173200 Sobic009G215100--Sobic003G205000 Sobic009G215100--SobicK031400 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic009G215100--Sobic003G268100 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic009G215100--Sobic010G098800 Sobic009G215100--Sobic001G224500 SobicK031900 SobicK031900 Sobic009G215100--SobicK031900 Sobic009G215100--Sobic004G310350 Sobic006G053550--Sobic009G215100 Sobic006G053550--Sobic004G310350 Sobic006G053550--Sobic003G205000 Sobic006G053550--Sobic001G224500 Sobic006G053550--SobicK031400 Sobic006G053550--Sobic003G173200 Sobic006G053550--SobicK031900 Sobic006G053550--Sobic003G268100 Sobic006G053550--Sobic002G334700 Sobic008G081100 Sobic008G081100 Sobic001G443400--Sobic008G081100 Sobic001G443400--Sobic002G094100 Sobic001G443400--Sobic010G166201 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic001G443400--Sobic010G259800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic001G443400--Sobic006G250350 Sobic008G174200 Sobic008G174200 Sobic001G443400--Sobic008G174200 Sobic001G443400--Sobic010G266400 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic001G443400--Sobic002G073000 Sobic001G443400--Sobic005G192350 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic006G174050--Sobic009G170050 Sobic006G174050--Sobic003G205000 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic006G174050--Sobic009G158150 Sobic006G174050--Sobic010G266400 Sobic006G174050--Sobic010G166201 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic006G174050--Sobic005G168900 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic006G174050--Sobic001G516400 Sobic006G174050--Sobic002G199300 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic006G174050--Sobic002G178900 Sobic005G192350--Sobic008G081100 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic005G192350--Sobic009G258800 Sobic005G192350--Sobic010G266400 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic005G192350--Sobic003G013300 Sobic005G192350--Sobic001G443400 Sobic005G192350--Sobic010G166201 Sobic005G192350--Sobic002G199300 Sobic005G192350--Sobic010G259800 Sobic005G192350--Sobic007G020400 Sobic010G166201--Sobic002G073000 Sobic010G166201--Sobic009G158150 Sobic010G166201--Sobic010G259800 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic010G166201--Sobic001G050650 Sobic010G166201--Sobic001G443400 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic010G166201--Sobic006G053601 Sobic010G166201--Sobic010G098800 Sobic010G166201--Sobic001G516400 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic010G166201--Sobic007G045750
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.