Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G443400.2
Synonym
Functional annotation conserved hypothetical protein
UniProt A0A1Z5SB01
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g48590.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.001G443400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G081100 - -
2 Sobic.002G094100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.010G166201 - -
4 Sobic.010G259800 - -
5 Sobic.006G250350 - -
6 Sobic.008G174200 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.010G266400 - -
8 Sobic.002G073000 - -
9 Sobic.005G192350 - -
10 Sobic.009G025750 - -
11 Sobic.007G050650 - -
12 Sobic.002G199300 - -
13 Sobic.002G334700 - -
14 Sobic.010G033750 - -
15 Sobic.003G205000 DUF623 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G094000 expressed protein -
17 Sobic.004G278800 - -
18 Sobic.003G059450 - -
19 Sobic.005G024500 expressed protein -
20 Sobic.003G357900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@strictosidine synthase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic008G081100 Sobic008G081100 Sobic001G443400--Sobic008G081100 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic001G443400--Sobic002G094100 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic001G443400--Sobic010G166201 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic001G443400--Sobic010G259800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic001G443400--Sobic006G250350 Sobic008G174200 Sobic008G174200 Sobic001G443400--Sobic008G174200 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic001G443400--Sobic010G266400 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic001G443400--Sobic002G073000 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic001G443400--Sobic005G192350 Sobic008G081100--Sobic001G443400 Sobic008G081100--Sobic008G174200 Sobic008G081100--Sobic005G192350 Sobic008G081100--Sobic010G166201 Sobic008G081100--Sobic010G259800 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic008G081100--Sobic009G258800 Sobic008G081100--Sobic006G250350 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic008G081100--Sobic002G022500 Sobic010G033750 Sobic010G033750 Sobic008G081100--Sobic010G033750 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic002G094100--Sobic002G094000 Sobic002G094100--Sobic002G073000 Sobic002G094100--Sobic001G443400 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic002G094100--Sobic003G142500 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic002G094100--Sobic005G024500 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic002G094100--Sobic004G278800 Sobic002G094100--Sobic010G166201 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic002G094100--Sobic002G334700 Sobic005G019300 Sobic005G019300 Sobic002G094100--Sobic005G019300 Sobic010G166201--Sobic002G073000 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic010G166201--Sobic009G158150 Sobic010G166201--Sobic010G259800 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic010G166201--Sobic001G050650 Sobic010G166201--Sobic001G443400 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic010G166201--Sobic006G053601 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic010G166201--Sobic010G098800 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic010G166201--Sobic001G516400 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic010G166201--Sobic007G045750 Sobic010G259800--Sobic010G166201 Sobic010G259800--Sobic002G073000 Sobic010G259800--Sobic001G443400 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G259800--Sobic009G025750 Sobic010G259800--Sobic003G142500 Sobic010G259800--Sobic002G022500 Sobic010G259800--Sobic002G094100 SobicK032500 SobicK032500 Sobic010G259800--SobicK032500 Sobic010G259800--Sobic008G081100 Sobic006G250350--Sobic001G443400 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic006G250350--Sobic006G113301 Sobic001G042100 Sobic001G042100 Sobic006G250350--Sobic001G042100 Sobic006G250350--Sobic008G081100 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic006G250350--Sobic002G018800 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic006G250350--Sobic005G165300 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic006G250350--Sobic007G050650 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic006G250350--Sobic001G112550 Sobic006G250350--Sobic008G174200 Sobic008G174200--Sobic008G081100 Sobic009G078401 Sobic009G078401 Sobic008G174200--Sobic009G078401 Sobic009G078300 Sobic009G078300 Sobic008G174200--Sobic009G078300 Sobic008G174200--Sobic001G443400 Sobic008G138850 Sobic008G138850 Sobic008G174200--Sobic008G138850 Sobic008G174200--Sobic010G033750 Sobic001G235600 Sobic001G235600 Sobic008G174200--Sobic001G235600 Sobic008G174200--Sobic004G278800 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic008G174200--Sobic003G059450 Sobic010G266400--Sobic007G050650 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic010G266400--Sobic002G199300 Sobic010G266400--Sobic001G443400 Sobic010G266400--Sobic005G192350 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic010G266400--Sobic003G205000 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic010G266400--Sobic006G174050 Sobic007G020400 Sobic007G020400 Sobic010G266400--Sobic007G020400 Sobic010G266400--Sobic002G334700 Sobic010G064300 Sobic010G064300 Sobic010G266400--Sobic010G064300 Sobic002G073000--Sobic002G094000 Sobic002G073000--Sobic010G166201 Sobic002G073000--Sobic005G024500 Sobic002G073000--Sobic010G098800 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic002G073000--Sobic003G173200 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic002G073000--Sobic004G223700 Sobic002G073000--Sobic002G094100 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic002G073000--Sobic004G334501 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic002G073000--Sobic002G121050 Sobic005G192350--Sobic008G081100 Sobic005G192350--Sobic009G258800 Sobic005G192350--Sobic010G266400 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic005G192350--Sobic003G013300 Sobic005G192350--Sobic001G443400 Sobic005G192350--Sobic010G166201 Sobic005G192350--Sobic002G199300 Sobic005G192350--Sobic010G259800 Sobic005G192350--Sobic007G020400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.