Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G174200.1
Synonym Sb08g021880, RPS3, RPM1
Functional annotation NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed
UniProt C5YSD7
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF614
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G07040 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g45930.1 : NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK03708
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G081100 - -
2 Sobic.009G078401 - -
3 Sobic.009G078300 expressed protein -
4 Sobic.001G443400 conserved hypothetical protein -
5 Sobic.008G138850 - -
6 Sobic.010G033750 - -
7 Sobic.001G235600 - -
8 Sobic.004G278800 - -
9 Sobic.003G059450 - -
10 Sobic.006G250350 - -
11 Sobic.002G094100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G094000 expressed protein -
13 Sobic.005G192350 - -
14 Sobic.002G334700 - -
15 Sobic.003G373050 - -
16 Sobic.002G018200 OsFBX209 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G024500 expressed protein -
18 Sobic.001G376332 - -
19 Sobic.002G168700 carotenoid cleavage dioxygenase, putative, expressed -
20 Sobic.003G031300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G174200 Sobic008G174200 Sobic008G081100 Sobic008G081100 Sobic008G174200--Sobic008G081100 Sobic009G078401 Sobic009G078401 Sobic008G174200--Sobic009G078401 Sobic009G078300 Sobic009G078300 Sobic008G174200--Sobic009G078300 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic008G174200--Sobic001G443400 Sobic008G138850 Sobic008G138850 Sobic008G174200--Sobic008G138850 Sobic010G033750 Sobic010G033750 Sobic008G174200--Sobic010G033750 Sobic001G235600 Sobic001G235600 Sobic008G174200--Sobic001G235600 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic008G174200--Sobic004G278800 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic008G174200--Sobic003G059450 Sobic008G081100--Sobic001G443400 Sobic008G081100--Sobic008G174200 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic008G081100--Sobic005G192350 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic008G081100--Sobic010G166201 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic008G081100--Sobic010G259800 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic008G081100--Sobic009G258800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic008G081100--Sobic006G250350 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic008G081100--Sobic002G022500 Sobic008G081100--Sobic010G033750 Sobic009G078401--Sobic009G078300 Sobic009G078401--Sobic008G138850 Sobic002G075400 Sobic002G075400 Sobic009G078401--Sobic002G075400 Sobic009G078401--Sobic004G278800 Sobic009G078401--Sobic008G174200 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic009G078401--Sobic002G168700 Sobic009G078401--Sobic003G059450 Sobic009G078401--Sobic001G235600 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic009G078401--Sobic001G325100 Sobic009G078300--Sobic009G078401 Sobic009G078300--Sobic008G138850 Sobic009G078300--Sobic001G235600 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic009G078300--Sobic002G018200 Sobic009G078300--Sobic008G174200 Sobic009G078300--Sobic002G168700 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic009G078300--Sobic003G263450 Sobic009G078300--Sobic004G278800 Sobic003G373050 Sobic003G373050 Sobic009G078300--Sobic003G373050 Sobic001G443400--Sobic008G081100 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic001G443400--Sobic002G094100 Sobic001G443400--Sobic010G166201 Sobic001G443400--Sobic010G259800 Sobic001G443400--Sobic006G250350 Sobic001G443400--Sobic008G174200 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic001G443400--Sobic010G266400 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic001G443400--Sobic002G073000 Sobic001G443400--Sobic005G192350 Sobic008G138850--Sobic009G078401 Sobic008G138850--Sobic009G078300 Sobic009G255400 Sobic009G255400 Sobic008G138850--Sobic009G255400 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic008G138850--Sobic005G024500 Sobic008G138850--Sobic001G325100 Sobic008G138850--Sobic004G278800 Sobic005G019300 Sobic005G019300 Sobic008G138850--Sobic005G019300 Sobic008G138850--Sobic002G075400 Sobic003G441301 Sobic003G441301 Sobic008G138850--Sobic003G441301 Sobic010G033750--Sobic004G278800 Sobic010G033750--Sobic003G059450 Sobic010G033750--Sobic008G174200 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic010G033750--Sobic002G094000 Sobic001G422001 Sobic001G422001 Sobic010G033750--Sobic001G422001 Sobic010G033750--Sobic002G094100 Sobic010G033750--Sobic008G138850 Sobic010G033750--Sobic009G078401 Sobic010G033750--Sobic001G443400 Sobic001G235600--Sobic003G373050 Sobic001G235600--Sobic002G168700 Sobic001G235600--Sobic009G078300 Sobic001G376332 Sobic001G376332 Sobic001G235600--Sobic001G376332 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic001G235600--Sobic009G077901 Sobic001G235600--Sobic002G018200 Sobic001G235600--Sobic009G078401 Sobic001G235600--Sobic008G174200 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic001G235600--Sobic009G178650 Sobic004G278800--Sobic002G094000 Sobic004G278800--Sobic009G078401 Sobic004G278800--Sobic010G033750 Sobic004G278800--Sobic002G094100 Sobic004G278800--Sobic001G422001 Sobic004G278800--Sobic008G138850 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic004G278800--Sobic003G142500 Sobic004G278800--Sobic005G019300 Sobic004G278800--Sobic009G078300 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic003G059450--Sobic009G188200 Sobic003G436100 Sobic003G436100 Sobic003G059450--Sobic003G436100 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic003G059450--Sobic003G031300 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic003G059450--Sobic002G334700 Sobic003G059450--Sobic010G033750 Sobic003G059450--Sobic009G078401 Sobic003G059450--Sobic004G278800 Sobic003G059450--Sobic002G094100 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic003G059450--Sobic006G239200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.