Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G357900.1
Synonym Sb03g040000
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
strictosidine synthase, putative, expressed
UniProt C5XPU6
Pfam PF03088
Panther DB PTHR10426 PTHR10426:SF34
NCBI CDD KOG1520; Predicted alkaloid synthase/Surface mucin Hemomucin
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016844; strictosidine synthase activity GO:0009058biosynthetic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G57030 : Calcium-dependent phosphotriesterase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g07810.1 : strictosidine synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039537 , Zm00025a039639 , Zm00025a039540 , Zm00025a039641
Brachypodium KQK10870 , KQJ91881
Barley HORVU5Hr1G093840.3 , HORVU5Hr1G093840.2 , HORVU5Hr1G093840.1 , HORVU2Hr1G012970.4 , HORVU2Hr1G012970.3 , HORVU2Hr1G012970.2 , HORVU3Hr1G065520.1 , HORVU3Hr1G065520.3 , HORVU3Hr1G065520.2
Wheat TraesCS2D02G076200 , TraesCS2D02G076000 , TraesCS5B02G383000 , TraesCS5B02G382800 , TraesCS5D02G389100 , TraesCS3A02G256600 , TraesCS2A02G078000 , TraesCS2B02G093000
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G443400 conserved hypothetical protein -
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16 Sobic.007G045750 - -
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Gene co-expression network
sample Sobic003G357900 Sobic003G357900 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic003G357900--Sobic001G443400 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic003G357900--Sobic005G165300 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic003G357900--Sobic009G025750 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic003G357900--Sobic005G168900 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic003G357900--Sobic006G174050 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic003G357900--Sobic001G334800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic003G357900--Sobic006G250350 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic003G357900--Sobic002G018800 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic003G357900--Sobic010G166201 Sobic008G081100 Sobic008G081100 Sobic001G443400--Sobic008G081100 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic001G443400--Sobic002G094100 Sobic001G443400--Sobic010G166201 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic001G443400--Sobic010G259800 Sobic001G443400--Sobic006G250350 Sobic008G174200 Sobic008G174200 Sobic001G443400--Sobic008G174200 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic001G443400--Sobic010G266400 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic001G443400--Sobic002G073000 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic001G443400--Sobic005G192350 Sobic005G165300--Sobic001G334800 Sobic005G165300--Sobic002G018800 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic005G165300--Sobic005G216833 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic005G165300--Sobic003G261766 Sobic010G003800 Sobic010G003800 Sobic005G165300--Sobic010G003800 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic005G165300--Sobic009G115800 Sobic005G165300--Sobic006G250350 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic005G165300--Sobic006G083050 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic005G165300--Sobic009G236150 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic009G025750--Sobic001G050650 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic009G025750--Sobic007G045750 Sobic009G025750--Sobic010G166201 Sobic009G025750--Sobic002G073000 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic009G025750--Sobic003G142500 Sobic009G025750--Sobic006G083050 Sobic009G025750--Sobic002G094100 Sobic009G025750--Sobic010G259800 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic009G025750--Sobic002G094000 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic005G168900--Sobic009G170050 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic005G168900--Sobic002G062400 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic005G168900--Sobic001G516400 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic005G168900--Sobic002G178900 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic005G168900--Sobic009G158150 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic005G168900--Sobic003G129700 Sobic005G168900--Sobic007G045750 Sobic005G168900--Sobic006G174050 Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic005G168900--Sobic007G226900 Sobic006G174050--Sobic009G170050 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic006G174050--Sobic003G205000 Sobic006G174050--Sobic009G158150 Sobic006G174050--Sobic010G266400 Sobic006G174050--Sobic010G166201 Sobic006G174050--Sobic005G168900 Sobic006G174050--Sobic001G516400 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic006G174050--Sobic002G199300 Sobic006G174050--Sobic002G178900 Sobic001G334800--Sobic005G165300 Sobic001G334800--Sobic002G018800 Sobic001G334800--Sobic010G003800 Sobic001G334800--Sobic005G216833 Sobic005G161750 Sobic005G161750 Sobic001G334800--Sobic005G161750 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic001G334800--Sobic001G112550 Sobic007G132300 Sobic007G132300 Sobic001G334800--Sobic007G132300 Sobic001G334800--Sobic006G250350 Sobic001G334800--Sobic009G236150 Sobic006G250350--Sobic001G443400 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic006G250350--Sobic006G113301 Sobic001G042100 Sobic001G042100 Sobic006G250350--Sobic001G042100 Sobic006G250350--Sobic008G081100 Sobic006G250350--Sobic002G018800 Sobic006G250350--Sobic005G165300 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic006G250350--Sobic007G050650 Sobic006G250350--Sobic001G112550 Sobic006G250350--Sobic008G174200 Sobic002G018800--Sobic001G334800 Sobic002G018800--Sobic010G003800 Sobic002G018800--Sobic001G112550 Sobic002G018800--Sobic005G165300 Sobic002G018800--Sobic005G161750 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic002G018800--Sobic007G050750 Sobic002G018800--Sobic006G250350 Sobic002G018800--Sobic001G042100 Sobic002G018800--Sobic007G050650 Sobic010G166201--Sobic002G073000 Sobic010G166201--Sobic009G158150 Sobic010G166201--Sobic010G259800 Sobic010G166201--Sobic001G050650 Sobic010G166201--Sobic001G443400 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic010G166201--Sobic006G053601 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic010G166201--Sobic010G098800 Sobic010G166201--Sobic001G516400 Sobic010G166201--Sobic007G045750
Octagon: transcription factors


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