Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G217850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S739
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G168900 expressed protein -
2 Sobic.009G170050 - -
3 Sobic.010G241400 expressed protein -
4 Sobic.004G176550 - -
5 Sobic.003G357900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@strictosidine synthase, putative, expressed -
6 Sobic.006G192900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
7 Sobic.006G174050 - K12662: PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP4
8 Sobic.002G062400 - -
9 Sobic.006G009200 expressed protein -
10 Sobic.003G129700 - -
11 Sobic.001G134150 - -
12 Sobic.007G045750 - -
13 Sobic.003G034350 - -
14 Sobic.009G158150 - -
15 Sobic.002G000900 lachrymatory factor synthase, putative, expressed -
16 Sobic.003G282400 OsMADS32 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
17 Sobic.001G334800 - -
18 Sobic.002G178900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K08506: syntaxin of plants SYP7
19 Sobic.001G516400 - -
20 Sobic.005G165300 cyclin-dependent kinase G-1, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like


Gene co-expression network
sample Sobic001G217850 Sobic001G217850 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic001G217850--Sobic005G168900 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic001G217850--Sobic009G170050 Sobic010G241400 Sobic010G241400 Sobic001G217850--Sobic010G241400 Sobic004G176550 Sobic004G176550 Sobic001G217850--Sobic004G176550 Sobic003G357900 Sobic003G357900 Sobic001G217850--Sobic003G357900 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic001G217850--Sobic006G192900 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic001G217850--Sobic006G174050 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic001G217850--Sobic002G062400 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic001G217850--Sobic006G009200 Sobic005G168900--Sobic009G170050 Sobic005G168900--Sobic002G062400 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic005G168900--Sobic001G516400 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic005G168900--Sobic002G178900 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic005G168900--Sobic009G158150 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic005G168900--Sobic003G129700 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic005G168900--Sobic007G045750 Sobic005G168900--Sobic006G174050 Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic005G168900--Sobic007G226900 Sobic009G170050--Sobic005G168900 Sobic009G170050--Sobic006G174050 Sobic009G170050--Sobic002G178900 Sobic009G170050--Sobic009G158150 Sobic009G170050--Sobic003G129700 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic009G170050--Sobic006G097600 Sobic009G170050--Sobic007G226900 Sobic009G170050--Sobic001G516400 Sobic009G170050--Sobic002G062400 Sobic010G241400--Sobic006G192900 Sobic010G241400--Sobic006G009200 Sobic010G241400--Sobic002G062400 Sobic010G241400--Sobic005G168900 Sobic010G241400--Sobic001G217850 Sobic010G241400--Sobic004G176550 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic010G241400--Sobic009G035000 Sobic010G241400--Sobic009G170050 Sobic001G134150 Sobic001G134150 Sobic010G241400--Sobic001G134150 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic004G176550--Sobic005G119400 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic004G176550--Sobic003G261766 Sobic004G176550--Sobic006G009200 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic004G176550--Sobic009G115800 Sobic004G176550--Sobic007G045750 Sobic004G176550--Sobic002G062400 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic004G176550--Sobic010G124100 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic004G176550--Sobic009G025750 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic004G176550--Sobic006G083050 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic003G357900--Sobic001G443400 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic003G357900--Sobic005G165300 Sobic003G357900--Sobic009G025750 Sobic003G357900--Sobic005G168900 Sobic003G357900--Sobic006G174050 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic003G357900--Sobic001G334800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic003G357900--Sobic006G250350 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic003G357900--Sobic002G018800 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic003G357900--Sobic010G166201 Sobic006G192900--Sobic010G241400 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic006G192900--Sobic010G002600 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic006G192900--Sobic002G307500 Sobic006G192900--Sobic009G035000 Sobic006G192900--Sobic006G009200 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic006G192900--Sobic008G041500 Sobic004G181400 Sobic004G181400 Sobic006G192900--Sobic004G181400 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic006G192900--Sobic004G093800 Sobic006G192900--Sobic002G062400 Sobic006G174050--Sobic009G170050 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic006G174050--Sobic003G205000 Sobic006G174050--Sobic009G158150 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic006G174050--Sobic010G266400 Sobic006G174050--Sobic010G166201 Sobic006G174050--Sobic005G168900 Sobic006G174050--Sobic001G516400 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic006G174050--Sobic002G199300 Sobic006G174050--Sobic002G178900 Sobic002G062400--Sobic003G129700 Sobic002G062400--Sobic007G045750 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic002G062400--Sobic001G163500 Sobic002G062400--Sobic009G158150 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic002G062400--Sobic003G282400 Sobic002G062400--Sobic009G035000 Sobic002G062400--Sobic006G009200 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic002G062400--Sobic001G050650 Sobic002G062400--Sobic005G168900 Sobic006G009200--Sobic002G062400 Sobic006G009200--Sobic007G045750 Sobic006G009200--Sobic003G282400 Sobic006G009200--Sobic009G035000 Sobic006G009200--Sobic003G129700 Sobic006G009200--Sobic009G158150 Sobic006G009200--Sobic009G025750 Sobic006G009200--Sobic008G041500 Sobic006G009200--Sobic001G050650
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.