Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G176550.1,Sobic.004G176550.3,Sobic.004G176550.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMY5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G119400 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
2 Sobic.003G261766 - -
3 Sobic.006G009200 expressed protein -
4 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
5 Sobic.007G045750 - -
6 Sobic.002G062400 - -
7 Sobic.010G124100 - -
8 Sobic.009G025750 - -
9 Sobic.006G083050 - -
10 Sobic.001G050650 - -
11 Sobic.005G041150 - -
12 Sobic.010G241400 expressed protein -
13 Sobic.009G035000 expressed protein -
14 Sobic.010G061400 expressed protein -
15 Sobic.005G116800 - -
16 Sobic.008G108100 - -
17 Sobic.005G168900 expressed protein -
18 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
19 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
20 Sobic.003G282400 OsMADS32 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G176550 Sobic004G176550 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic004G176550--Sobic005G119400 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic004G176550--Sobic003G261766 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic004G176550--Sobic006G009200 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic004G176550--Sobic009G115800 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic004G176550--Sobic007G045750 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic004G176550--Sobic002G062400 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic004G176550--Sobic010G124100 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic004G176550--Sobic009G025750 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic004G176550--Sobic006G083050 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic005G119400--Sobic001G050650 Sobic005G119400--Sobic007G045750 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic005G119400--Sobic002G112200 Sobic005G119400--Sobic009G025750 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic005G119400--Sobic001G401750 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic005G119400--Sobic009G035000 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic005G119400--Sobic001G014600 Sobic005G119400--Sobic002G062400 Sobic005G119400--Sobic010G124100 Sobic003G261766--Sobic009G115800 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic003G261766--Sobic006G159500 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic003G261766--Sobic005G216833 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic003G261766--Sobic005G041150 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic003G261766--Sobic008G108100 Sobic006G135550 Sobic006G135550 Sobic003G261766--Sobic006G135550 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic003G261766--Sobic004G313000 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic003G261766--Sobic006G099400 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic003G261766--Sobic003G267150 Sobic006G009200--Sobic002G062400 Sobic006G009200--Sobic007G045750 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic006G009200--Sobic003G282400 Sobic006G009200--Sobic009G035000 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic006G009200--Sobic003G129700 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic006G009200--Sobic009G158150 Sobic006G009200--Sobic009G025750 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic006G009200--Sobic008G041500 Sobic006G009200--Sobic001G050650 Sobic009G115800--Sobic003G261766 Sobic009G115800--Sobic006G159500 Sobic009G115800--Sobic005G216833 Sobic009G115800--Sobic008G108100 Sobic009G115800--Sobic005G041150 Sobic009G115800--Sobic004G313000 Sobic009G115800--Sobic003G267150 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic009G115800--Sobic002G319900 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic009G115800--Sobic002G160500 Sobic007G045750--Sobic002G062400 Sobic007G045750--Sobic003G129700 Sobic007G045750--Sobic001G050650 Sobic007G045750--Sobic009G158150 Sobic007G045750--Sobic009G025750 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic007G045750--Sobic001G163500 Sobic007G045750--Sobic006G009200 Sobic007G045750--Sobic009G035000 Sobic007G045750--Sobic002G112200 Sobic002G062400--Sobic003G129700 Sobic002G062400--Sobic007G045750 Sobic002G062400--Sobic001G163500 Sobic002G062400--Sobic009G158150 Sobic002G062400--Sobic003G282400 Sobic002G062400--Sobic009G035000 Sobic002G062400--Sobic006G009200 Sobic002G062400--Sobic001G050650 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic002G062400--Sobic005G168900 Sobic010G124100--Sobic002G112200 Sobic010G124100--Sobic001G401750 Sobic010G124100--Sobic005G119400 SobicK043600 SobicK043600 Sobic010G124100--SobicK043600 Sobic010G061400 Sobic010G061400 Sobic010G124100--Sobic010G061400 Sobic010G124100--Sobic001G050650 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic010G124100--Sobic010G167700 Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic010G124100--Sobic003G301050 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic010G124100--Sobic003G168600 Sobic009G025750--Sobic001G050650 Sobic009G025750--Sobic007G045750 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic009G025750--Sobic010G166201 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic009G025750--Sobic002G073000 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic009G025750--Sobic003G142500 Sobic009G025750--Sobic006G083050 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic009G025750--Sobic002G094100 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic009G025750--Sobic010G259800 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic009G025750--Sobic002G094000 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic009G115800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.