Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G041150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RH19
Pfam PF06058
Panther DB PTHR16290 PTHR16290:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G08370 : decapping 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g05650.1 : mRNA-decapping enzyme, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033499 , Zm00025a012992
Brachypodium PNT65418
Barley HORVU4Hr1G021700.5 , HORVU4Hr1G021700.6 , HORVU4Hr1G021700.7 , HORVU4Hr1G021700.1 , HORVU4Hr1G021700.2 , HORVU4Hr1G021700.3
Wheat TraesCS4B02G117300 , TraesCS4D02G115100 , TraesCS5D02G134200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
2 Sobic.003G261766 - -
3 Sobic.009G134700 - -
4 Sobic.006G099400 - -
5 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
6 Sobic.005G116800 - -
7 Sobic.006G083050 - -
8 Sobic.008G108100 - -
9 Sobic.006G135550 - -
10 Sobic.004G313000 leucine rich repeat containing protein, expressed -
11 Sobic.005G216833 - -
12 Sobic.003G267150 - -
13 Sobic.002G319900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AAA family ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
14 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
15 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
16 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
17 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
18 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
19 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
20 Sobic.004G176550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic005G041150--Sobic009G115800 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic005G041150--Sobic003G261766 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic005G041150--Sobic009G134700 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic005G041150--Sobic006G099400 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic005G041150--Sobic006G159500 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic005G041150--Sobic005G116800 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic005G041150--Sobic006G083050 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic005G041150--Sobic008G108100 Sobic006G135550 Sobic006G135550 Sobic005G041150--Sobic006G135550 Sobic009G115800--Sobic003G261766 Sobic009G115800--Sobic006G159500 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic009G115800--Sobic005G216833 Sobic009G115800--Sobic008G108100 Sobic009G115800--Sobic005G041150 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic009G115800--Sobic004G313000 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic009G115800--Sobic003G267150 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic009G115800--Sobic002G319900 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic009G115800--Sobic002G160500 Sobic003G261766--Sobic009G115800 Sobic003G261766--Sobic006G159500 Sobic003G261766--Sobic005G216833 Sobic003G261766--Sobic005G041150 Sobic003G261766--Sobic008G108100 Sobic003G261766--Sobic006G135550 Sobic003G261766--Sobic004G313000 Sobic003G261766--Sobic006G099400 Sobic003G261766--Sobic003G267150 Sobic009G134700--Sobic005G041150 Sobic009G134700--Sobic006G159500 Sobic009G134700--Sobic009G115800 Sobic009G134700--Sobic003G261766 Sobic009G134700--Sobic006G083050 Sobic009G134700--Sobic005G216833 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic009G134700--Sobic007G179100 Sobic009G134700--Sobic002G319900 Sobic009G134700--Sobic004G313000 Sobic006G099400--Sobic009G115800 Sobic006G099400--Sobic005G041150 Sobic006G099400--Sobic003G261766 Sobic006G099400--Sobic006G159500 Sobic004G264900 Sobic004G264900 Sobic006G099400--Sobic004G264900 Sobic006G099400--Sobic005G116800 Sobic006G099400--Sobic006G135550 Sobic006G099400--Sobic008G108100 Sobic006G099400--Sobic003G267150 Sobic006G159500--Sobic009G115800 Sobic006G159500--Sobic003G261766 Sobic006G159500--Sobic004G313000 Sobic006G159500--Sobic003G267150 Sobic006G159500--Sobic005G216833 Sobic006G159500--Sobic002G319900 Sobic006G159500--Sobic002G160500 Sobic005G116800--Sobic006G083050 Sobic005G116800--Sobic005G041150 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic003G261766 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic005G116800--Sobic008G142500 Sobic005G116800--Sobic006G099400 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G115800 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic005G116800--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic009G115800 Sobic008G108100--Sobic003G267150 Sobic008G108100--Sobic009G115800 Sobic008G108100--Sobic002G160500 Sobic008G108100--Sobic004G313000 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic008G108100--Sobic004G262550 Sobic006G135550--Sobic003G261766 Sobic006G135550--Sobic009G115800 Sobic006G135550--Sobic008G108100 Sobic006G135550--Sobic006G099400 Sobic006G135550--Sobic006G159500 Sobic006G135550--Sobic005G041150 Sobic006G135550--Sobic005G216833 Sobic006G135550--Sobic004G313000 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic006G135550--Sobic009G236150
Octagon: transcription factors


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