Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G099400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PL79
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK18166
Barley -
Wheat TraesCS7B02G338000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
2 Sobic.005G041150 - -
3 Sobic.003G261766 - -
4 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
5 Sobic.004G264900 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K00817: histidinol-phosphate aminotransferase
6 Sobic.005G116800 - -
7 Sobic.006G135550 - -
8 Sobic.008G108100 - -
9 Sobic.003G267150 - -
10 Sobic.002G319900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AAA family ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
11 Sobic.003G411150 - -
12 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
13 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
14 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
15 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
16 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
17 Sobic.004G262550 - -
18 Sobic.009G091940 - -
19 Sobic.006G083050 - -
20 Sobic.003G389150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic006G099400--Sobic009G115800 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic006G099400--Sobic005G041150 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic006G099400--Sobic003G261766 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic006G099400--Sobic006G159500 Sobic004G264900 Sobic004G264900 Sobic006G099400--Sobic004G264900 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic006G099400--Sobic005G116800 Sobic006G135550 Sobic006G135550 Sobic006G099400--Sobic006G135550 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic006G099400--Sobic008G108100 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic006G099400--Sobic003G267150 Sobic009G115800--Sobic003G261766 Sobic009G115800--Sobic006G159500 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic009G115800--Sobic005G216833 Sobic009G115800--Sobic008G108100 Sobic009G115800--Sobic005G041150 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic009G115800--Sobic004G313000 Sobic009G115800--Sobic003G267150 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic009G115800--Sobic002G319900 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic009G115800--Sobic002G160500 Sobic005G041150--Sobic009G115800 Sobic005G041150--Sobic003G261766 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic005G041150--Sobic009G134700 Sobic005G041150--Sobic006G099400 Sobic005G041150--Sobic006G159500 Sobic005G041150--Sobic005G116800 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic005G041150--Sobic006G083050 Sobic005G041150--Sobic008G108100 Sobic005G041150--Sobic006G135550 Sobic003G261766--Sobic009G115800 Sobic003G261766--Sobic006G159500 Sobic003G261766--Sobic005G216833 Sobic003G261766--Sobic005G041150 Sobic003G261766--Sobic008G108100 Sobic003G261766--Sobic006G135550 Sobic003G261766--Sobic004G313000 Sobic003G261766--Sobic006G099400 Sobic003G261766--Sobic003G267150 Sobic006G159500--Sobic009G115800 Sobic006G159500--Sobic003G261766 Sobic006G159500--Sobic004G313000 Sobic006G159500--Sobic003G267150 Sobic006G159500--Sobic005G216833 Sobic006G159500--Sobic002G319900 Sobic006G159500--Sobic002G160500 Sobic004G264900--Sobic006G099400 Sobic004G264900--Sobic009G115800 Sobic004G264900--Sobic006G159500 Sobic004G264900--Sobic003G261766 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic004G264900--Sobic004G262550 Sobic004G264900--Sobic005G041150 Sobic004G264900--Sobic002G160500 Sobic005G116800--Sobic006G083050 Sobic005G116800--Sobic005G041150 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic003G261766 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic005G116800--Sobic008G142500 Sobic005G116800--Sobic006G099400 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G115800 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic005G116800--Sobic003G068100 Sobic006G135550--Sobic003G261766 Sobic006G135550--Sobic009G115800 Sobic006G135550--Sobic008G108100 Sobic006G135550--Sobic006G099400 Sobic006G135550--Sobic006G159500 Sobic006G135550--Sobic005G041150 Sobic006G135550--Sobic005G216833 Sobic006G135550--Sobic004G313000 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic006G135550--Sobic009G236150 Sobic008G108100--Sobic003G267150 Sobic008G108100--Sobic009G115800 Sobic008G108100--Sobic002G160500 Sobic008G108100--Sobic004G313000 Sobic008G108100--Sobic004G262550 Sobic003G267150--Sobic002G160500 Sobic003G267150--Sobic004G262550 Sobic009G091940 Sobic009G091940 Sobic003G267150--Sobic009G091940 Sobic003G267150--Sobic004G313000 Sobic003G389150 Sobic003G389150 Sobic003G267150--Sobic003G389150
Octagon: transcription factors


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