Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G134700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P8D0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G041150 - -
2 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
3 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
4 Sobic.003G261766 - -
5 Sobic.006G083050 - -
6 Sobic.005G216833 - -
7 Sobic.007G179100 - -
8 Sobic.002G319900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AAA family ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
9 Sobic.004G313000 leucine rich repeat containing protein, expressed -
10 Sobic.008G108100 - -
11 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
12 Sobic.005G116800 - -
13 Sobic.003G267150 - -
14 Sobic.005G165300 cyclin-dependent kinase G-1, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
15 Sobic.008G041500 - -
16 Sobic.004G248000 expressed protein -
17 Sobic.009G035000 expressed protein -
18 Sobic.010G166850 - -
19 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
20 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1


Gene co-expression network
sample Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic009G134700--Sobic005G041150 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic009G134700--Sobic006G159500 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic009G134700--Sobic009G115800 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic009G134700--Sobic003G261766 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic009G134700--Sobic006G083050 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic009G134700--Sobic005G216833 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic009G134700--Sobic007G179100 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic009G134700--Sobic002G319900 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic009G134700--Sobic004G313000 Sobic005G041150--Sobic009G115800 Sobic005G041150--Sobic003G261766 Sobic005G041150--Sobic009G134700 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic005G041150--Sobic006G099400 Sobic005G041150--Sobic006G159500 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic005G041150--Sobic005G116800 Sobic005G041150--Sobic006G083050 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic005G041150--Sobic008G108100 Sobic006G135550 Sobic006G135550 Sobic005G041150--Sobic006G135550 Sobic006G159500--Sobic009G115800 Sobic006G159500--Sobic003G261766 Sobic006G159500--Sobic004G313000 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic006G159500--Sobic003G267150 Sobic006G159500--Sobic005G216833 Sobic006G159500--Sobic002G319900 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic006G159500--Sobic002G160500 Sobic009G115800--Sobic003G261766 Sobic009G115800--Sobic006G159500 Sobic009G115800--Sobic005G216833 Sobic009G115800--Sobic008G108100 Sobic009G115800--Sobic005G041150 Sobic009G115800--Sobic004G313000 Sobic009G115800--Sobic003G267150 Sobic009G115800--Sobic002G319900 Sobic009G115800--Sobic002G160500 Sobic003G261766--Sobic009G115800 Sobic003G261766--Sobic006G159500 Sobic003G261766--Sobic005G216833 Sobic003G261766--Sobic005G041150 Sobic003G261766--Sobic008G108100 Sobic003G261766--Sobic006G135550 Sobic003G261766--Sobic004G313000 Sobic003G261766--Sobic006G099400 Sobic003G261766--Sobic003G267150 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic009G115800 Sobic005G216833--Sobic004G313000 Sobic005G216833--Sobic009G115800 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic005G216833--Sobic009G236150 Sobic005G216833--Sobic003G261766 Sobic005G216833--Sobic003G267150 Sobic005G216833--Sobic006G159500 Sobic005G216833--Sobic008G108100 Sobic005G216833--Sobic002G160500 Sobic007G179100--Sobic010G156300 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic007G179100--Sobic010G166850 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic007G179100--Sobic008G041500 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic007G179100--Sobic010G207175 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic007G179100--Sobic001G163500 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic007G179100--Sobic007G045750 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic007G179100--Sobic003G282400 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic007G179100--Sobic009G035000 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic007G179100--Sobic002G022500 Sobic002G319900--Sobic003G267150 Sobic002G319900--Sobic002G160500 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic002G319900--Sobic004G262550 Sobic002G319900--Sobic004G313000 Sobic009G091940 Sobic009G091940 Sobic002G319900--Sobic009G091940 Sobic004G313000--Sobic003G267150 Sobic004G313000--Sobic002G160500 Sobic004G313000--Sobic004G262550 Sobic004G313000--Sobic009G091940 Sobic003G389150 Sobic003G389150 Sobic004G313000--Sobic003G389150
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.