Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G168900.1
Synonym Sb05g022910
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y5D0
Pfam PF03478
Panther DB PTHR11102 PTHR11102:SF101
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G68960 : Protein of unknown function (DUF295)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g38070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G170050 - -
2 Sobic.002G062400 - -
3 Sobic.001G516400 - -
4 Sobic.002G178900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K08506: syntaxin of plants SYP7
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9 Sobic.007G226900 ELF protein, expressed -
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11 Sobic.010G166201 - -
12 Sobic.006G053601 - -
13 Sobic.001G163500 - -
14 Sobic.001G050650 - -
15 Sobic.009G025750 - -
16 Sobic.009G145200 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@ethylene-responsive transcription factor("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@AP2 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.006G097600 - -
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19 Sobic.001G217850 - -
20 Sobic.010G098800 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed K03884: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6


Gene co-expression network
sample Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic005G168900--Sobic009G170050 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic005G168900--Sobic002G062400 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic005G168900--Sobic001G516400 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic005G168900--Sobic002G178900 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic005G168900--Sobic009G158150 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic005G168900--Sobic003G129700 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic005G168900--Sobic007G045750 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic005G168900--Sobic006G174050 Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic005G168900--Sobic007G226900 Sobic009G170050--Sobic005G168900 Sobic009G170050--Sobic006G174050 Sobic009G170050--Sobic002G178900 Sobic009G170050--Sobic009G158150 Sobic009G170050--Sobic003G129700 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic009G170050--Sobic006G097600 Sobic009G170050--Sobic007G226900 Sobic009G170050--Sobic001G516400 Sobic009G170050--Sobic002G062400 Sobic002G062400--Sobic003G129700 Sobic002G062400--Sobic007G045750 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic002G062400--Sobic001G163500 Sobic002G062400--Sobic009G158150 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic002G062400--Sobic003G282400 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic002G062400--Sobic009G035000 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic002G062400--Sobic006G009200 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic002G062400--Sobic001G050650 Sobic002G062400--Sobic005G168900 Sobic001G516400--Sobic009G158150 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic001G516400--Sobic010G166201 Sobic001G516400--Sobic002G178900 Sobic001G516400--Sobic005G168900 Sobic001G516400--Sobic007G045750 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic001G516400--Sobic006G053601 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic001G516400--Sobic010G098800 Sobic001G516400--Sobic003G129700 Sobic001G516400--Sobic006G174050 Sobic002G178900--Sobic009G170050 Sobic002G178900--Sobic001G516400 Sobic002G178900--Sobic005G168900 Sobic002G178900--Sobic007G226900 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic002G178900--Sobic001G471050 Sobic002G178900--Sobic003G129700 Sobic002G178900--Sobic009G158150 Sobic002G178900--Sobic006G097600 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic002G178900--Sobic009G145200 Sobic009G158150--Sobic003G129700 Sobic009G158150--Sobic007G045750 Sobic009G158150--Sobic001G163500 Sobic009G158150--Sobic002G062400 Sobic009G158150--Sobic010G166201 Sobic009G158150--Sobic001G516400 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic009G158150--Sobic004G249950 Sobic009G158150--Sobic005G168900 Sobic009G158150--Sobic001G050650 Sobic003G129700--Sobic002G062400 Sobic003G129700--Sobic009G158150 Sobic003G129700--Sobic001G163500 Sobic003G129700--Sobic007G045750 Sobic003G129700--Sobic003G282400 Sobic003G129700--Sobic009G035000 Sobic003G129700--Sobic006G009200 Sobic003G129700--Sobic005G168900 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic003G129700--Sobic008G041500 Sobic007G045750--Sobic002G062400 Sobic007G045750--Sobic003G129700 Sobic007G045750--Sobic001G050650 Sobic007G045750--Sobic009G158150 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic007G045750--Sobic009G025750 Sobic007G045750--Sobic001G163500 Sobic007G045750--Sobic006G009200 Sobic007G045750--Sobic009G035000 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic007G045750--Sobic002G112200 Sobic006G174050--Sobic009G170050 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic006G174050--Sobic003G205000 Sobic006G174050--Sobic009G158150 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic006G174050--Sobic010G266400 Sobic006G174050--Sobic010G166201 Sobic006G174050--Sobic005G168900 Sobic006G174050--Sobic001G516400 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic006G174050--Sobic002G199300 Sobic006G174050--Sobic002G178900 Sobic007G226900--Sobic009G145200 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic007G226900--Sobic007G098050 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic007G226900--Sobic002G112500 Sobic007G226900--Sobic001G471050 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic007G226900--Sobic004G206000 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic007G226900--Sobic004G223700 SobicK032600 SobicK032600 Sobic007G226900--SobicK032600 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic007G226900--Sobic006G264400 SobicK032400 SobicK032400 Sobic007G226900--SobicK032400
Octagon: transcription factors


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