Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G145200.4,Sobic.009G145200.6,Sobic.009G145200.5,Sobic.009G145200.7,Sobic.009G145200.8,Sobic.009G145200.3
Synonym Sb09g021016,
Functional annotation Up-reguralion under drought (PubMedID : 24916767)
ethylene-responsive transcription factor( (PubMedID : 26759170,(PubMedID : 24597475)
AP2 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R2N5 , A0A1B6P8S2 , A0A1Z5R2R1
Pfam -
Panther DB PTHR31241 PTHR31241:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G31060 : Integrase-type DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g09170.1 : ethylene-responsive transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G112500 - -
2 Sobic.007G098050 - -
3 Sobic.007G226900 ELF protein, expressed -
4 Sobic.001G471050 - -
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7 Sobic.K032400 - -
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9 Sobic.004G223700 - -
10 Sobic.006G264400 co-chaperone GrpE protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G383350 - -
12 Sobic.007G167600 expressed protein -
13 Sobic.010G098800 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed K03884: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
14 Sobic.009G095720 - -
15 Sobic.006G029850 - -
16 Sobic.001G401750 - -
17 Sobic.002G000350 - -
18 Sobic.004G072300 - -
19 Sobic.007G116150 - -
20 Sobic.007G183200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K18486: heart-and neural crest derivatives-expressed protein 2


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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