Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G226900.1
Synonym
Functional annotation ELF protein, expressed
UniProt A0A1B6PJ96
Pfam PF03317
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g33944.1 : ELF protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G145200 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@ethylene-responsive transcription factor("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@AP2 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.007G098050 - -
3 Sobic.002G112500 - -
4 Sobic.001G471050 - -
5 Sobic.004G206000 - -
6 Sobic.004G223700 - -
7 Sobic.K032600 - -
8 Sobic.006G264400 co-chaperone GrpE protein, putative, expressed -
9 Sobic.K032400 - -
10 Sobic.010G098800 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed K03884: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
11 Sobic.002G178900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K08506: syntaxin of plants SYP7
12 Sobic.001G081450 - -
13 Sobic.001G401750 - -
14 Sobic.001G383350 - -
15 Sobic.009G095720 - -
16 Sobic.007G183200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K18486: heart-and neural crest derivatives-expressed protein 2
17 Sobic.006G029850 - -
18 Sobic.002G000350 - -
19 Sobic.010G201332 - -
20 Sobic.007G116150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic007G226900--Sobic009G145200 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic007G226900--Sobic007G098050 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic007G226900--Sobic002G112500 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic007G226900--Sobic001G471050 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic007G226900--Sobic004G206000 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic007G226900--Sobic004G223700 SobicK032600 SobicK032600 Sobic007G226900--SobicK032600 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic007G226900--Sobic006G264400 SobicK032400 SobicK032400 Sobic007G226900--SobicK032400 Sobic009G145200--Sobic002G112500 Sobic009G145200--Sobic007G098050 Sobic009G145200--Sobic007G226900 Sobic009G145200--Sobic001G471050 Sobic009G145200--Sobic004G206000 Sobic009G145200--SobicK032600 Sobic009G145200--SobicK032400 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic009G145200--Sobic001G081450 Sobic009G145200--Sobic004G223700 Sobic007G098050--Sobic006G264400 Sobic009G095720 Sobic009G095720 Sobic007G098050--Sobic009G095720 Sobic007G098050--SobicK032400 Sobic007G098050--SobicK032600 Sobic007G098050--Sobic004G206000 Sobic007G098050--Sobic009G145200 Sobic007G098050--Sobic002G112500 Sobic007G098050--Sobic001G081450 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic007G098050--Sobic006G029850 Sobic002G112500--Sobic001G081450 Sobic002G112500--Sobic009G145200 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic002G112500--Sobic001G383350 Sobic002G112500--SobicK032400 Sobic002G112500--Sobic001G471050 Sobic002G112500--SobicK032600 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic002G112500--Sobic002G000350 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic002G112500--Sobic007G116150 Sobic002G112500--Sobic007G098050 Sobic001G471050--Sobic002G112500 Sobic001G471050--Sobic009G145200 Sobic001G471050--Sobic002G000350 Sobic001G471050--Sobic007G098050 Sobic001G471050--Sobic007G226900 Sobic001G471050--Sobic001G383350 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic001G471050--Sobic001G278900 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic001G471050--Sobic007G183200 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic001G471050--Sobic004G072300 Sobic004G206000--SobicK032600 Sobic004G206000--SobicK032400 Sobic004G206000--Sobic001G081450 Sobic004G206000--Sobic007G098050 Sobic004G206000--Sobic007G116150 Sobic004G206000--Sobic004G223700 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic004G206000--Sobic010G098800 Sobic004G206000--Sobic006G264400 Sobic007G134300 Sobic007G134300 Sobic004G206000--Sobic007G134300 Sobic004G223700--Sobic010G098800 Sobic004G223700--Sobic001G081450 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic004G223700--Sobic004G272950 Sobic004G223700--Sobic007G116150 Sobic004G223700--Sobic004G206000 Sobic004G223700--SobicK032600 Sobic004G223700--SobicK032400 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic004G223700--Sobic003G168600 SobicK031300 SobicK031300 Sobic004G223700--SobicK031300 SobicK032600--SobicK032400 SobicK032600--Sobic004G206000 SobicK032600--Sobic007G116150 SobicK032600--Sobic001G081450 SobicK032350 SobicK032350 SobicK032600--SobicK032350 SobicK032600--Sobic001G383350 SobicK032600--Sobic007G098050 SobicK032600--Sobic007G134300 Sobic009G209650 Sobic009G209650 SobicK032600--Sobic009G209650 Sobic006G264400--Sobic009G095720 Sobic006G264400--Sobic007G098050 Sobic006G264400--SobicK032400 Sobic006G264400--SobicK032600 Sobic006G264400--Sobic003G168600 Sobic006G264400--Sobic004G206000 Sobic006G264400--SobicK032350 Sobic005G173100 Sobic005G173100 Sobic006G264400--Sobic005G173100 Sobic006G264400--SobicK031300 SobicK032400--SobicK032600 SobicK032400--Sobic004G206000 SobicK032400--Sobic007G116150 SobicK032400--SobicK032350 SobicK032400--Sobic009G209650 SobicK032400--Sobic001G383350 SobicK032400--Sobic006G029850 SobicK032400--Sobic009G095720 SobicK032400--Sobic001G081450
Octagon: transcription factors


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