Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G471050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SAX8
Pfam PF02519
Panther DB PTHR31374 PTHR31374:SF38
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009733; response to auxin


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G12830 : SAUR-like auxin-responsive protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g52670.1 : OsSAUR21 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G112500 - -
2 Sobic.009G145200 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@ethylene-responsive transcription factor("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@AP2 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G000350 - -
4 Sobic.007G098050 - -
5 Sobic.007G226900 ELF protein, expressed -
6 Sobic.001G383350 - -
7 Sobic.001G278900 - -
8 Sobic.007G183200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K18486: heart-and neural crest derivatives-expressed protein 2
9 Sobic.004G072300 - -
10 Sobic.004G206000 - -
11 Sobic.010G201332 - -
12 Sobic.001G081450 - -
13 Sobic.K032600 - -
14 Sobic.006G264400 co-chaperone GrpE protein, putative, expressed -
15 Sobic.K032400 - -
16 Sobic.002G358450 - -
17 Sobic.006G097600 - -
18 Sobic.006G029850 - -
19 Sobic.007G042700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20528920)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
20 Sobic.010G219200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic001G471050--Sobic002G112500 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic001G471050--Sobic009G145200 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic001G471050--Sobic002G000350 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic001G471050--Sobic007G098050 Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic001G471050--Sobic007G226900 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic001G471050--Sobic001G383350 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic001G471050--Sobic001G278900 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic001G471050--Sobic007G183200 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic001G471050--Sobic004G072300 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic002G112500--Sobic001G081450 Sobic002G112500--Sobic009G145200 Sobic002G112500--Sobic001G383350 SobicK032400 SobicK032400 Sobic002G112500--SobicK032400 Sobic002G112500--Sobic001G471050 SobicK032600 SobicK032600 Sobic002G112500--SobicK032600 Sobic002G112500--Sobic002G000350 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic002G112500--Sobic007G116150 Sobic002G112500--Sobic007G098050 Sobic009G145200--Sobic002G112500 Sobic009G145200--Sobic007G098050 Sobic009G145200--Sobic007G226900 Sobic009G145200--Sobic001G471050 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic009G145200--Sobic004G206000 Sobic009G145200--SobicK032600 Sobic009G145200--SobicK032400 Sobic009G145200--Sobic001G081450 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic009G145200--Sobic004G223700 Sobic002G000350--Sobic004G072300 Sobic002G000350--Sobic002G112500 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic002G000350--Sobic003G085533 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic002G000350--Sobic008G129500 Sobic002G000350--Sobic001G471050 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic002G000350--Sobic007G042700 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic002G000350--Sobic001G497400 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic002G000350--Sobic010G219200 Sobic002G000350--Sobic001G081450 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic007G098050--Sobic006G264400 Sobic009G095720 Sobic009G095720 Sobic007G098050--Sobic009G095720 Sobic007G098050--SobicK032400 Sobic007G098050--SobicK032600 Sobic007G098050--Sobic004G206000 Sobic007G098050--Sobic009G145200 Sobic007G098050--Sobic002G112500 Sobic007G098050--Sobic001G081450 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic007G098050--Sobic006G029850 Sobic007G226900--Sobic009G145200 Sobic007G226900--Sobic007G098050 Sobic007G226900--Sobic002G112500 Sobic007G226900--Sobic001G471050 Sobic007G226900--Sobic004G206000 Sobic007G226900--Sobic004G223700 Sobic007G226900--SobicK032600 Sobic007G226900--Sobic006G264400 Sobic007G226900--SobicK032400 Sobic001G383350--Sobic006G029850 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic001G383350--Sobic007G200700 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic001G383350--Sobic004G115100 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic001G383350--Sobic001G261444 Sobic001G383350--SobicK032400 SobicK032200 SobicK032200 Sobic001G383350--SobicK032200 Sobic001G383350--SobicK032600 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic001G383350--Sobic008G100201 Sobic001G383350--Sobic002G112500 Sobic001G278900--Sobic001G497400 Sobic001G278900--Sobic007G042700 Sobic001G278900--Sobic001G471050 Sobic001G278900--Sobic002G000350 Sobic001G278900--Sobic002G112500 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic001G278900--Sobic009G077000 Sobic001G278900--Sobic004G072300 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic001G278900--Sobic002G358450 Sobic001G278900--Sobic003G085533 Sobic007G183200--Sobic002G358450 Sobic010G201332 Sobic010G201332 Sobic007G183200--Sobic010G201332 Sobic007G183200--Sobic001G261444 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic007G183200--Sobic003G161900 Sobic005G065800 Sobic005G065800 Sobic007G183200--Sobic005G065800 Sobic007G183200--SobicK032200 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic007G183200--Sobic001G475950 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic007G183200--Sobic009G143750 Sobic007G183200--Sobic001G383350 Sobic004G072300--Sobic003G085533 Sobic004G072300--Sobic002G000350 Sobic004G072300--Sobic010G219200 Sobic004G072300--Sobic008G129500 Sobic004G072300--Sobic002G112500 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic004G072300--Sobic002G200400 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic004G072300--Sobic002G134800 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic004G072300--Sobic004G183701 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic004G072300--Sobic001G373850
Octagon: transcription factors


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