Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G097600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PL69
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056162
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G471050 - -
2 Sobic.007G042700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20528920)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
3 Sobic.003G129700 - -
4 Sobic.009G145200 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@ethylene-responsive transcription factor("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@AP2 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G018400 NB-ARC domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G053601 - -
7 Sobic.002G178900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K08506: syntaxin of plants SYP7
8 Sobic.009G170050 - -
9 Sobic.007G226900 ELF protein, expressed -
10 Sobic.001G278900 - -
11 Sobic.007G108600 - -
12 Sobic.004G249950 - -
13 Sobic.002G112500 - -
14 Sobic.009G139100 - -
15 Sobic.007G183200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K18486: heart-and neural crest derivatives-expressed protein 2
16 Sobic.002G062400 - -
17 Sobic.002G000350 - -
18 Sobic.007G167600 expressed protein -
19 Sobic.009G158150 - -
20 Sobic.007G045750 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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