Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G278900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QLH4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G497400 - -
2 Sobic.007G042700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20528920)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
3 Sobic.001G471050 - -
4 Sobic.002G000350 - -
5 Sobic.002G112500 - -
6 Sobic.009G077000 - -
7 Sobic.004G072300 - -
8 Sobic.002G358450 - -
9 Sobic.003G085533 - -
10 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G373850 - -
12 Sobic.004G150300 - -
13 Sobic.001G081450 - -
14 Sobic.001G383350 - -
15 Sobic.009G145200 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@ethylene-responsive transcription factor("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@AP2 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G219200 - -
17 Sobic.001G475950 - -
18 Sobic.004G183701 - -
19 Sobic.007G183200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K18486: heart-and neural crest derivatives-expressed protein 2
20 Sobic.006G097600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic001G278900--Sobic001G497400 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic001G278900--Sobic007G042700 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic001G278900--Sobic001G471050 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic001G278900--Sobic002G000350 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic001G278900--Sobic002G112500 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic001G278900--Sobic009G077000 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic001G278900--Sobic004G072300 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic001G278900--Sobic002G358450 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic001G278900--Sobic003G085533 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic001G497400--Sobic004G252300 Sobic001G497400--Sobic007G042700 Sobic001G497400--Sobic002G000350 Sobic001G497400--Sobic001G278900 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic001G497400--Sobic008G129500 Sobic001G497400--Sobic003G085533 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic001G497400--Sobic004G310350 Sobic001G497400--Sobic009G077000 Sobic001G497400--Sobic004G072300 Sobic007G042700--Sobic001G497400 Sobic007G042700--Sobic002G000350 Sobic007G042700--Sobic001G278900 Sobic007G042700--Sobic003G085533 Sobic007G042700--Sobic004G252300 Sobic007G042700--Sobic004G072300 Sobic007G042700--Sobic001G471050 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic007G042700--Sobic004G249950 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic007G042700--Sobic006G097600 Sobic001G471050--Sobic002G112500 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic001G471050--Sobic009G145200 Sobic001G471050--Sobic002G000350 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic001G471050--Sobic007G098050 Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic001G471050--Sobic007G226900 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic001G471050--Sobic001G383350 Sobic001G471050--Sobic001G278900 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic001G471050--Sobic007G183200 Sobic001G471050--Sobic004G072300 Sobic002G000350--Sobic004G072300 Sobic002G000350--Sobic002G112500 Sobic002G000350--Sobic003G085533 Sobic002G000350--Sobic008G129500 Sobic002G000350--Sobic001G471050 Sobic002G000350--Sobic007G042700 Sobic002G000350--Sobic001G497400 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic002G000350--Sobic010G219200 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic002G000350--Sobic001G081450 Sobic002G112500--Sobic001G081450 Sobic002G112500--Sobic009G145200 Sobic002G112500--Sobic001G383350 SobicK032400 SobicK032400 Sobic002G112500--SobicK032400 Sobic002G112500--Sobic001G471050 SobicK032600 SobicK032600 Sobic002G112500--SobicK032600 Sobic002G112500--Sobic002G000350 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic002G112500--Sobic007G116150 Sobic002G112500--Sobic007G098050 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic009G077000--Sobic002G214000 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic009G077000--Sobic001G202450 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic009G077000--Sobic005G045250 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic009G077000--Sobic001G107550 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic009G077000--Sobic003G161900 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic009G077000--Sobic001G373850 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic009G077000--Sobic002G401533 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic009G077000--Sobic001G261444 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic009G077000--Sobic006G107700 Sobic004G072300--Sobic003G085533 Sobic004G072300--Sobic002G000350 Sobic004G072300--Sobic010G219200 Sobic004G072300--Sobic008G129500 Sobic004G072300--Sobic002G112500 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic004G072300--Sobic002G200400 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic004G072300--Sobic002G134800 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic004G072300--Sobic004G183701 Sobic004G072300--Sobic001G373850 Sobic010G201332 Sobic010G201332 Sobic002G358450--Sobic010G201332 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic002G358450--Sobic001G475950 Sobic002G358450--Sobic007G183200 SobicK032200 SobicK032200 Sobic002G358450--SobicK032200 Sobic005G065800 Sobic005G065800 Sobic002G358450--Sobic005G065800 Sobic004G126050 Sobic004G126050 Sobic002G358450--Sobic004G126050 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic002G358450--Sobic003G056200 Sobic002G358450--Sobic001G261444 Sobic002G358450--Sobic002G401533 Sobic003G085533--Sobic004G072300 Sobic003G085533--Sobic010G219200 Sobic003G085533--Sobic002G000350 Sobic003G085533--Sobic008G129500 Sobic003G085533--Sobic004G310350 Sobic003G085533--Sobic002G200400 Sobic003G085533--Sobic001G497400 Sobic003G085533--Sobic004G183701 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic003G085533--Sobic009G247200
Octagon: transcription factors


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