Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G077000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P737
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G51340 : MATE efflux family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g13940.1 : MATE efflux protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G214000 protein Kinase, putative, expressed -
2 Sobic.001G202450 - -
3 Sobic.005G045250 - -
4 Sobic.001G107550 - -
5 Sobic.003G161900 - -
6 Sobic.001G373850 - -
7 Sobic.002G401533 - -
8 Sobic.001G261444 - -
9 Sobic.006G107700 OsMADS27 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
10 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G056200 - -
12 Sobic.009G210250 - -
13 Sobic.002G358450 - -
14 Sobic.001G475950 - -
15 Sobic.003G208200 - -
16 Sobic.007G200700 pyridoxamine 5\'-phosphate oxidase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.K031900 - -
18 Sobic.003G172966 - K05582: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K
19 Sobic.001G383350 - -
20 Sobic.001G497400 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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