Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G150300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YQY9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G352633 - -
2 Sobic.002G200400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
3 Sobic.001G406200 - -
4 Sobic.002G009000 - -
5 Sobic.001G250750 - -
6 Sobic.006G205300 - -
7 Sobic.006G016950 - -
8 Sobic.001G278900 - -
9 Sobic.004G183701 - -
10 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
11 Sobic.003G219300 leaf senescence related protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G023450 - -
13 Sobic.004G072300 - -
14 Sobic.006G128150 - -
15 Sobic.007G108600 - -
16 Sobic.003G085533 - -
17 Sobic.004G098100 expressed protein -
18 Sobic.010G235100 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G141900 resistance protein SlVe1 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.007G182300 Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G150300 Sobic004G150300 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic004G150300--Sobic001G352633 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic004G150300--Sobic002G200400 Sobic001G406200 Sobic001G406200 Sobic004G150300--Sobic001G406200 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic004G150300--Sobic002G009000 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic004G150300--Sobic001G250750 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic004G150300--Sobic006G205300 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic004G150300--Sobic006G016950 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic004G150300--Sobic001G278900 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic004G150300--Sobic004G183701 Sobic001G352633--Sobic004G150300 Sobic001G352633--Sobic002G200400 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic001G352633--Sobic007G182300 Sobic001G352633--Sobic001G250750 Sobic001G352633--Sobic006G205300 Sobic001G352633--Sobic004G183701 Sobic001G352633--Sobic006G016950 Sobic003G272000 Sobic003G272000 Sobic001G352633--Sobic003G272000 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic001G352633--Sobic003G219300 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic002G200400--Sobic004G180950 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic002G200400--Sobic001G283400 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic002G200400--Sobic009G199750 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic002G200400--Sobic010G155000 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic002G200400--Sobic004G072300 Sobic002G200400--Sobic006G205300 Sobic002G200400--Sobic004G183701 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic002G200400--Sobic003G085533 Sobic002G200400--Sobic001G352633 Sobic010G154801 Sobic010G154801 Sobic001G406200--Sobic010G154801 Sobic001G406200--Sobic004G150300 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic001G406200--Sobic006G128150 Sobic001G406200--Sobic001G352633 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic001G406200--Sobic008G132550 Sobic008G082550 Sobic008G082550 Sobic001G406200--Sobic008G082550 Sobic002G172800 Sobic002G172800 Sobic001G406200--Sobic002G172800 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic001G406200--Sobic009G192400 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic001G406200--Sobic003G253100 Sobic002G009000--Sobic001G250750 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic002G009000--Sobic008G132500 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic002G009000--Sobic010G235100 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic002G009000--Sobic009G210250 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic002G009000--Sobic002G074900 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic002G009000--Sobic007G141900 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic002G009000--Sobic005G118800 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic002G009000--Sobic002G067900 Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic002G009000--Sobic003G109150 Sobic001G250750--Sobic010G235100 Sobic001G250750--Sobic002G009000 Sobic001G250750--Sobic008G132500 Sobic001G250750--Sobic007G182300 Sobic001G250750--Sobic003G109150 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic001G250750--Sobic003G232600 Sobic001G250750--Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic002G067900 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic001G250750--Sobic005G090800 Sobic006G205300--Sobic004G183701 Sobic006G205300--Sobic002G200400 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic006G205300--Sobic002G358450 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic006G205300--Sobic001G261444 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic006G205300--Sobic001G475950 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic006G205300--Sobic010G169950 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic006G205300--Sobic006G107700 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic006G205300--Sobic001G383350 SobicK032200 SobicK032200 Sobic006G205300--SobicK032200 Sobic006G016950--Sobic002G358450 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic006G016950--Sobic001G502801 Sobic007G108600 Sobic007G108600 Sobic006G016950--Sobic007G108600 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic006G016950--Sobic007G183200 Sobic006G016950--Sobic001G352633 Sobic006G016950--Sobic006G205300 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic006G016950--Sobic001G182700 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic006G016950--Sobic009G143750 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic006G016950--Sobic002G401533 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic001G278900--Sobic001G497400 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic001G278900--Sobic007G042700 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic001G278900--Sobic001G471050 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic001G278900--Sobic002G000350 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic001G278900--Sobic002G112500 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic001G278900--Sobic009G077000 Sobic001G278900--Sobic004G072300 Sobic001G278900--Sobic002G358450 Sobic001G278900--Sobic003G085533 Sobic004G183701--Sobic006G205300 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic004G183701--Sobic010G219200 Sobic004G183701--Sobic001G383350 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic004G183701--Sobic002G134800 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic004G183701--Sobic006G029850 SobicK032400 SobicK032400 Sobic004G183701--SobicK032400 Sobic004G183701--Sobic004G072300 Sobic010G201332 Sobic010G201332 Sobic004G183701--Sobic010G201332 Sobic004G183701--Sobic002G200400
Octagon: transcription factors


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