Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G235100.2
Synonym Sb10g027695
Functional annotation leucine rich repeat protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0VUE3
Pfam PF13855
Panther DB PTHR27004 PTHR27004:SF36
NCBI CDD KOG0472; Leucine-rich repeat protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G34930 : disease resistance family protein / LRR family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g41780.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.010G235100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G250750 - -
2 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
3 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
4 Sobic.002G009000 - -
5 Sobic.002G067900 - -
6 Sobic.005G118800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G072300 - -
8 Sobic.002G074900 receptor kinase, putative, expressed -
9 Sobic.005G090800 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G109150 - -
11 Sobic.003G085533 - -
12 Sobic.007G004400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
13 Sobic.003G219300 leaf senescence related protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G209100 GRAM domain containing protein, expressed -
15 Sobic.010G136700 - -
16 Sobic.002G134800 - -
17 Sobic.001G340100 - -
18 Sobic.005G180850 - -
19 Sobic.007G182300 Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed -
20 Sobic.010G100600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic010G235100--Sobic001G250750 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic010G235100--Sobic008G132500 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic010G235100--Sobic003G232600 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic010G235100--Sobic002G009000 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic010G235100--Sobic002G067900 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic010G235100--Sobic005G118800 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic004G072300 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic010G235100--Sobic002G074900 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic010G235100--Sobic005G090800 Sobic001G250750--Sobic010G235100 Sobic001G250750--Sobic002G009000 Sobic001G250750--Sobic008G132500 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic001G250750--Sobic007G182300 Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic001G250750--Sobic003G109150 Sobic001G250750--Sobic003G232600 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic002G067900 Sobic001G250750--Sobic005G090800 Sobic008G132500--Sobic002G009000 Sobic008G132500--Sobic001G250750 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic008G132500--Sobic004G209100 Sobic008G132500--Sobic010G235100 Sobic008G132500--Sobic005G118800 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic008G132500--Sobic003G312900 Sobic008G132500--Sobic003G219300 Sobic008G132500--Sobic003G109150 Sobic008G132500--Sobic003G232600 Sobic003G232600--Sobic010G235100 Sobic003G232600--Sobic002G067900 Sobic003G232600--Sobic001G250750 Sobic003G232600--Sobic005G090800 Sobic003G232600--Sobic008G132500 Sobic003G232600--Sobic002G009000 Sobic003G232600--Sobic004G209100 Sobic003G232600--Sobic003G312900 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic003G232600--Sobic010G136700 Sobic002G009000--Sobic001G250750 Sobic002G009000--Sobic008G132500 Sobic002G009000--Sobic010G235100 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic002G009000--Sobic009G210250 Sobic002G009000--Sobic002G074900 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic002G009000--Sobic007G141900 Sobic002G009000--Sobic005G118800 Sobic002G009000--Sobic002G067900 Sobic002G009000--Sobic003G109150 Sobic002G067900--Sobic005G090800 Sobic002G067900--Sobic003G232600 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic002G067900--Sobic001G340100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic002G067900--Sobic007G004400 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic002G067900--Sobic001G400601 Sobic002G067900--Sobic010G235100 Sobic002G067900--Sobic002G074900 Sobic002G067900--Sobic001G250750 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic002G067900--Sobic008G115200 Sobic005G118800--Sobic008G132500 Sobic005G118800--Sobic004G209100 Sobic005G118800--Sobic010G235100 Sobic005G118800--Sobic002G009000 Sobic005G118800--Sobic001G250750 Sobic005G118800--Sobic003G312900 Sobic005G118800--Sobic003G219300 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic005G118800--Sobic006G072701 Sobic005G118800--Sobic003G232600 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic004G072300--Sobic003G085533 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic004G072300--Sobic002G000350 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic004G072300--Sobic010G219200 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic004G072300--Sobic008G129500 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic004G072300--Sobic002G112500 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic004G072300--Sobic002G200400 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic004G072300--Sobic002G134800 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic004G072300--Sobic004G183701 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic004G072300--Sobic001G373850 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic007G004400 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic008G115200 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic002G074900--Sobic003G335100 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic001G340100 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic002G074900--Sobic004G133201 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic002G074900--Sobic003G169550 Sobic001G226401 Sobic001G226401 Sobic005G090800--Sobic001G226401 Sobic005G090800--Sobic002G067900 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic005G090800--Sobic001G016050 Sobic005G090800--Sobic010G136700 Sobic005G090800--Sobic010G235100 Sobic005G090800--Sobic001G250750 Sobic005G090800--Sobic003G232600 Sobic005G090800--Sobic008G115200 Sobic005G090800--Sobic002G074900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.