Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G340100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QMM7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G400601 - -
3 Sobic.007G132650 - -
4 Sobic.002G067900 - -
5 Sobic.002G074900 receptor kinase, putative, expressed -
6 Sobic.004G223800 membrane-associated salt-inducible protein like, putative, expressed -
7 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
8 Sobic.006G107766 - -
9 Sobic.001G373850 - -
10 Sobic.009G257000 - -
11 Sobic.007G046700 - -
12 Sobic.002G134800 - -
13 Sobic.003G260500 - -
14 Sobic.003G394701 - -
15 Sobic.004G133201 - -
16 Sobic.010G039150 - -
17 Sobic.009G079600 - -
18 Sobic.007G004400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
19 Sobic.003G169550 - -
20 Sobic.008G115200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic001G340100--Sobic004G274300 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic001G340100--Sobic001G400601 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic001G340100--Sobic007G132650 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic001G340100--Sobic002G067900 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic001G340100--Sobic002G074900 Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic001G340100--Sobic004G223800 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic001G340100--Sobic003G187600 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic001G340100--Sobic006G107766 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic001G340100--Sobic001G373850 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic004G274300--Sobic004G134400 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic004G274300--Sobic009G079600 Sobic004G274300--Sobic003G187600 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic004G274300--Sobic003G260500 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G274300--Sobic004G133201 Sobic004G274300--Sobic007G132650 Sobic004G274300--Sobic006G107766 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic004G274300--Sobic007G127200 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic004G274300--Sobic003G394701 Sobic001G400601--Sobic001G340100 Sobic001G400601--Sobic002G067900 Sobic003G322600 Sobic003G322600 Sobic001G400601--Sobic003G322600 Sobic001G400601--Sobic004G223800 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic001G400601--Sobic002G134800 Sobic001G400601--Sobic006G107766 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G400601--Sobic009G257000 Sobic001G400601--Sobic003G394701 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic001G400601--Sobic007G004400 Sobic007G132650--Sobic003G260500 Sobic007G132650--Sobic004G274300 Sobic007G132650--Sobic003G187600 Sobic007G132650--Sobic009G079600 Sobic007G132650--Sobic006G107766 Sobic007G132650--Sobic004G134400 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic007G132650--Sobic001G323101 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic007G132650--Sobic010G039150 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic007G132650--Sobic006G149900 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic002G067900--Sobic005G090800 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic002G067900--Sobic003G232600 Sobic002G067900--Sobic001G340100 Sobic002G067900--Sobic007G004400 Sobic002G067900--Sobic001G400601 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic002G067900--Sobic010G235100 Sobic002G067900--Sobic002G074900 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic002G067900--Sobic001G250750 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic002G067900--Sobic008G115200 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic007G004400 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic008G115200 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic002G074900--Sobic003G335100 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic001G340100 Sobic002G074900--Sobic004G133201 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic002G074900--Sobic003G169550 Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic004G223800--Sobic003G109150 Sobic004G223800--Sobic001G340100 Sobic004G223800--Sobic001G250750 Sobic004G223800--Sobic001G400601 Sobic004G223800--Sobic010G235100 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic004G223800--Sobic002G009000 Sobic004G223800--Sobic002G074900 Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic004G223800--Sobic010G100600 Sobic004G223800--Sobic002G067900 Sobic003G187600--Sobic004G274300 Sobic003G187600--Sobic009G079600 Sobic003G187600--Sobic004G134400 Sobic003G187600--Sobic007G132650 Sobic003G187600--Sobic006G107766 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic003G187600--Sobic003G029150 Sobic003G187600--Sobic003G260500 Sobic003G187600--Sobic007G046700 Sobic003G187600--Sobic007G127200 Sobic006G107766--Sobic003G394701 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic006G107766--Sobic006G035350 Sobic006G107766--Sobic003G260500 Sobic006G107766--Sobic008G119600 Sobic006G107766--Sobic003G187600 Sobic006G107766--Sobic004G274300 Sobic006G107766--Sobic004G133201 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic006G107766--Sobic001G255866 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G107766--Sobic004G115100 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic001G373850--Sobic002G214000 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic001G373850--Sobic001G202450 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic001G373850--Sobic003G208200 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic001G373850--Sobic009G210250 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic001G373850--Sobic009G077000 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic001G373850--Sobic008G100201 Sobic001G373850--Sobic009G257000 Sobic001G373850--Sobic004G115100 Sobic001G373850--Sobic004G133201
Octagon: transcription factors


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