Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G223800.1
Synonym Sb04g026810
Functional annotation membrane-associated salt-inducible protein like, putative, expressed
UniProt C5XY60
Pfam PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF816
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G18520 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g42210.1 : membrane-associated salt-inducible protein like, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021053
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
20 Sobic.002G200400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic004G223800--Sobic003G109150 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic004G223800--Sobic001G340100 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic004G223800--Sobic001G250750 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic004G223800--Sobic001G400601 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic004G223800--Sobic010G235100 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic004G223800--Sobic002G009000 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic004G223800--Sobic002G074900 Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic004G223800--Sobic010G100600 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic004G223800--Sobic002G067900 Sobic003G109150--Sobic004G223800 Sobic003G109150--Sobic001G250750 Sobic003G109150--Sobic010G235100 Sobic003G109150--Sobic002G009000 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G109150--Sobic008G132500 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic003G109150--Sobic010G169950 Sobic003G109150--Sobic002G074900 Sobic003G109150--Sobic001G340100 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic003G109150--Sobic006G111000 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic001G340100--Sobic004G274300 Sobic001G340100--Sobic001G400601 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic001G340100--Sobic007G132650 Sobic001G340100--Sobic002G067900 Sobic001G340100--Sobic002G074900 Sobic001G340100--Sobic004G223800 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic001G340100--Sobic003G187600 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic001G340100--Sobic006G107766 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic001G340100--Sobic001G373850 Sobic001G250750--Sobic010G235100 Sobic001G250750--Sobic002G009000 Sobic001G250750--Sobic008G132500 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic001G250750--Sobic007G182300 Sobic001G250750--Sobic003G109150 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic001G250750--Sobic003G232600 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic002G067900 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic001G250750--Sobic005G090800 Sobic001G400601--Sobic001G340100 Sobic001G400601--Sobic002G067900 Sobic003G322600 Sobic003G322600 Sobic001G400601--Sobic003G322600 Sobic001G400601--Sobic004G223800 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic001G400601--Sobic002G134800 Sobic001G400601--Sobic006G107766 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G400601--Sobic009G257000 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic001G400601--Sobic003G394701 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic001G400601--Sobic007G004400 Sobic010G235100--Sobic001G250750 Sobic010G235100--Sobic008G132500 Sobic010G235100--Sobic003G232600 Sobic010G235100--Sobic002G009000 Sobic010G235100--Sobic002G067900 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic010G235100--Sobic005G118800 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic002G074900 Sobic010G235100--Sobic005G090800 Sobic002G009000--Sobic001G250750 Sobic002G009000--Sobic008G132500 Sobic002G009000--Sobic010G235100 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic002G009000--Sobic009G210250 Sobic002G009000--Sobic002G074900 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic002G009000--Sobic007G141900 Sobic002G009000--Sobic005G118800 Sobic002G009000--Sobic002G067900 Sobic002G009000--Sobic003G109150 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic007G004400 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic007G046700 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic002G074900--Sobic008G115200 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic002G074900--Sobic003G335100 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic001G340100 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic002G074900--Sobic004G133201 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic002G074900--Sobic003G169550 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic010G100600--Sobic006G235801 Sobic010G100600--Sobic010G235100 Sobic010G100600--Sobic001G250750 Sobic010G100600--Sobic004G223800 Sobic010G100600--Sobic003G109150 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic010G100600--Sobic001G100300 Sobic010G100600--Sobic008G132500 Sobic010G100600--Sobic004G072300 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic010G100600--Sobic002G000350 Sobic002G067900--Sobic005G090800 Sobic002G067900--Sobic003G232600 Sobic002G067900--Sobic001G340100 Sobic002G067900--Sobic007G004400 Sobic002G067900--Sobic001G400601 Sobic002G067900--Sobic010G235100 Sobic002G067900--Sobic002G074900 Sobic002G067900--Sobic001G250750 Sobic002G067900--Sobic008G115200
Octagon: transcription factors


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