Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G067900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q9N0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.002G067900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G090800 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
3 Sobic.001G340100 - -
4 Sobic.007G004400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
5 Sobic.001G400601 - -
6 Sobic.010G235100 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G074900 receptor kinase, putative, expressed -
8 Sobic.001G250750 - -
9 Sobic.008G115200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G406850 - -
11 Sobic.002G009000 - -
12 Sobic.001G016050 - -
13 Sobic.010G136700 - -
14 Sobic.001G162600 - -
15 Sobic.001G226401 - K06995: uncharacterized protein
16 Sobic.003G375500 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G335100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G163666 - -
19 Sobic.004G223800 membrane-associated salt-inducible protein like, putative, expressed -
20 Sobic.006G223101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic002G067900--Sobic005G090800 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic002G067900--Sobic003G232600 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic002G067900--Sobic001G340100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic002G067900--Sobic007G004400 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic002G067900--Sobic001G400601 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic002G067900--Sobic010G235100 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic002G067900--Sobic002G074900 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic002G067900--Sobic001G250750 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic002G067900--Sobic008G115200 Sobic001G226401 Sobic001G226401 Sobic005G090800--Sobic001G226401 Sobic005G090800--Sobic002G067900 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic005G090800--Sobic001G016050 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic005G090800--Sobic010G136700 Sobic005G090800--Sobic010G235100 Sobic005G090800--Sobic001G250750 Sobic005G090800--Sobic003G232600 Sobic005G090800--Sobic008G115200 Sobic005G090800--Sobic002G074900 Sobic003G232600--Sobic010G235100 Sobic003G232600--Sobic002G067900 Sobic003G232600--Sobic001G250750 Sobic003G232600--Sobic005G090800 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G232600--Sobic008G132500 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic003G232600--Sobic002G009000 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic003G232600--Sobic004G209100 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic003G232600--Sobic003G312900 Sobic003G232600--Sobic010G136700 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic001G340100--Sobic004G274300 Sobic001G340100--Sobic001G400601 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic001G340100--Sobic007G132650 Sobic001G340100--Sobic002G067900 Sobic001G340100--Sobic002G074900 Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic001G340100--Sobic004G223800 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic001G340100--Sobic003G187600 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic001G340100--Sobic006G107766 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic001G340100--Sobic001G373850 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic007G004400--Sobic003G335100 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic007G004400--Sobic008G119600 Sobic007G004400--Sobic008G115200 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic007G004400--Sobic006G223101 Sobic007G004400--Sobic002G074900 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic007G004400--Sobic003G406850 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic007G004400--Sobic006G176900 Sobic007G004400--Sobic010G136700 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic007G004400--Sobic006G223601 Sobic001G400601--Sobic001G340100 Sobic001G400601--Sobic002G067900 Sobic003G322600 Sobic003G322600 Sobic001G400601--Sobic003G322600 Sobic001G400601--Sobic004G223800 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic001G400601--Sobic002G134800 Sobic001G400601--Sobic006G107766 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G400601--Sobic009G257000 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic001G400601--Sobic003G394701 Sobic001G400601--Sobic007G004400 Sobic010G235100--Sobic001G250750 Sobic010G235100--Sobic008G132500 Sobic010G235100--Sobic003G232600 Sobic010G235100--Sobic002G009000 Sobic010G235100--Sobic002G067900 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic010G235100--Sobic005G118800 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic002G074900 Sobic010G235100--Sobic005G090800 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic007G004400 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic008G115200 Sobic002G074900--Sobic003G335100 Sobic002G074900--Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic001G340100 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic002G074900--Sobic004G133201 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic002G074900--Sobic003G169550 Sobic001G250750--Sobic010G235100 Sobic001G250750--Sobic002G009000 Sobic001G250750--Sobic008G132500 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic001G250750--Sobic007G182300 Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic001G250750--Sobic003G109150 Sobic001G250750--Sobic003G232600 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic002G067900 Sobic001G250750--Sobic005G090800 Sobic008G115200--Sobic004G133201 Sobic008G115200--Sobic007G004400 Sobic008G115200--Sobic010G136700 Sobic008G115200--Sobic006G107766 Sobic008G115200--Sobic006G176900 Sobic008G115200--Sobic008G119600 Sobic008G115200--Sobic003G394701 Sobic008G115200--Sobic006G223101 Sobic008G115200--Sobic002G074900
Octagon: transcription factors


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