Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G109150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VWT3
Pfam PF01915
Panther DB PTHR30620 PTHR30620:SF23
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005975; carbohydrate metabolic process GO:0004553hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G04885 : Glycosyl hydrolase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g53800.1 : periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G223800 membrane-associated salt-inducible protein like, putative, expressed -
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3 Sobic.010G235100 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
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18 Sobic.007G182300 Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G200400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
20 Sobic.010G163666 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic003G109150--Sobic004G223800 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic003G109150--Sobic001G250750 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic003G109150--Sobic010G235100 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic003G109150--Sobic002G009000 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G109150--Sobic008G132500 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic003G109150--Sobic010G169950 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic003G109150--Sobic002G074900 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic003G109150--Sobic001G340100 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic003G109150--Sobic006G111000 Sobic004G223800--Sobic003G109150 Sobic004G223800--Sobic001G340100 Sobic004G223800--Sobic001G250750 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic004G223800--Sobic001G400601 Sobic004G223800--Sobic010G235100 Sobic004G223800--Sobic002G009000 Sobic004G223800--Sobic002G074900 Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic004G223800--Sobic010G100600 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic004G223800--Sobic002G067900 Sobic001G250750--Sobic010G235100 Sobic001G250750--Sobic002G009000 Sobic001G250750--Sobic008G132500 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic001G250750--Sobic007G182300 Sobic001G250750--Sobic003G109150 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic001G250750--Sobic003G232600 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic002G067900 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic001G250750--Sobic005G090800 Sobic010G235100--Sobic001G250750 Sobic010G235100--Sobic008G132500 Sobic010G235100--Sobic003G232600 Sobic010G235100--Sobic002G009000 Sobic010G235100--Sobic002G067900 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic010G235100--Sobic005G118800 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic002G074900 Sobic010G235100--Sobic005G090800 Sobic002G009000--Sobic001G250750 Sobic002G009000--Sobic008G132500 Sobic002G009000--Sobic010G235100 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic002G009000--Sobic009G210250 Sobic002G009000--Sobic002G074900 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic002G009000--Sobic007G141900 Sobic002G009000--Sobic005G118800 Sobic002G009000--Sobic002G067900 Sobic002G009000--Sobic003G109150 Sobic008G132500--Sobic002G009000 Sobic008G132500--Sobic001G250750 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic008G132500--Sobic004G209100 Sobic008G132500--Sobic010G235100 Sobic008G132500--Sobic005G118800 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic008G132500--Sobic003G312900 Sobic008G132500--Sobic003G219300 Sobic008G132500--Sobic003G109150 Sobic008G132500--Sobic003G232600 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic010G169950--Sobic001G037033 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic010G169950--Sobic009G257000 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic010G169950--Sobic007G113000 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic010G169950--Sobic002G401533 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic010G169950--Sobic006G107700 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic010G169950--Sobic004G133201 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic010G169950--Sobic001G373850 Sobic010G169950--Sobic009G210250 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic010G169950--Sobic008G100900 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic002G256250 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic002G074900--Sobic007G004400 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic007G046700 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic002G074900--Sobic008G115200 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic002G074900--Sobic003G335100 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic001G340100 Sobic002G074900--Sobic004G133201 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic002G074900--Sobic003G169550 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic001G340100--Sobic004G274300 Sobic001G340100--Sobic001G400601 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic001G340100--Sobic007G132650 Sobic001G340100--Sobic002G067900 Sobic001G340100--Sobic002G074900 Sobic001G340100--Sobic004G223800 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic001G340100--Sobic003G187600 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic001G340100--Sobic006G107766 Sobic001G340100--Sobic001G373850 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic006G111000--Sobic006G041200 Sobic006G111000--Sobic008G100900 Sobic006G111000--Sobic007G182300 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic006G111000--Sobic004G117850 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic006G111000--Sobic004G084600 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic006G111000--Sobic004G255550 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic006G111000--Sobic002G171901 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic006G111000--Sobic003G336550 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic006G111000--Sobic009G176100
Octagon: transcription factors


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