Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G413700.1
Synonym Sb03g044790, HAK5, ATHAK5
Functional annotation potassium transporter, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q812
Pfam PF02705
Panther DB PTHR30540 PTHR30540:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology K03549; KUP system potassium uptake protein
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0015079potassium ion transmembrane transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G13420 : high affinity K+ transporter 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g70490.1 : potassium transporter, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026168 , Zm00025a039183
Brachypodium KQK11344 , KQK11345
Barley HORVU3Hr1G096860.30 , HORVU3Hr1G096860.31 , HORVU3Hr1G096860.32 , HORVU3Hr1G096860.4 , HORVU3Hr1G096860.5 , HORVU3Hr1G096860.6 , HORVU3Hr1G096860.1 , HORVU3Hr1G096860.2 , HORVU3Hr1G096860.8 , HORVU3Hr1G096860.9 , HORVU3Hr1G096860.17 , HORVU3Hr1G096860.14 , HORVU3Hr1G096860.15 , HORVU3Hr1G096860.12 , HORVU3Hr1G096860.10 , HORVU3Hr1G096860.11 , HORVU3Hr1G096860.18 , HORVU3Hr1G096860.29 , HORVU3Hr1G096860.28 , HORVU3Hr1G096860.27 , HORVU3Hr1G096860.26 , HORVU3Hr1G096860.25 , HORVU3Hr1G096860.24 , HORVU3Hr1G096860.23 , HORVU3Hr1G096860.22 , HORVU3Hr1G096860.21 , HORVU3Hr1G096860.20 , HORVU3Hr1G096860.16 , HORVU3Hr1G096860.13
Wheat TraesCS3D02G439200 , TraesCS3D02G439200 , TraesCS3A02G446600 , TraesCS3A02G446600 , TraesCS3A02G446700 , TraesCS3B02G482000 , TraesCS3B02G481800 , TraesCS3B02G481800 , TraesCS3D02G439300
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G235100 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G111000 expressed protein -
3 Sobic.003G109150 - -
4 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
5 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
6 Sobic.004G117850 - -
7 Sobic.002G171901 - -
8 Sobic.005G118800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G250750 - -
10 Sobic.010G163666 - -
11 Sobic.008G100900 - -
12 Sobic.008G115200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G009000 - -
14 Sobic.006G072701 - -
15 Sobic.006G041200 - -
16 Sobic.008G085800 - -
17 Sobic.009G176100 - -
18 Sobic.007G182300 Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G067900 - -
20 Sobic.004G209100 GRAM domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G413700 Sobic003G413700 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic003G413700--Sobic010G235100 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic003G413700--Sobic006G111000 Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic003G413700--Sobic003G109150 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic003G413700--Sobic003G232600 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G413700--Sobic008G132500 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic003G413700--Sobic004G117850 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic003G413700--Sobic002G171901 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G413700--Sobic005G118800 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic003G413700--Sobic001G250750 Sobic010G235100--Sobic001G250750 Sobic010G235100--Sobic008G132500 Sobic010G235100--Sobic003G232600 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic010G235100--Sobic002G009000 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic010G235100--Sobic002G067900 Sobic010G235100--Sobic005G118800 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic004G072300 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic010G235100--Sobic002G074900 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic010G235100--Sobic005G090800 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic006G111000--Sobic006G041200 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic006G111000--Sobic008G100900 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic006G111000--Sobic007G182300 Sobic006G111000--Sobic004G117850 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic006G111000--Sobic004G084600 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic006G111000--Sobic004G255550 Sobic006G111000--Sobic002G171901 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic006G111000--Sobic003G336550 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic006G111000--Sobic009G176100 Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic003G109150--Sobic004G223800 Sobic003G109150--Sobic001G250750 Sobic003G109150--Sobic010G235100 Sobic003G109150--Sobic002G009000 Sobic003G109150--Sobic008G132500 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic003G109150--Sobic010G169950 Sobic003G109150--Sobic002G074900 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic003G109150--Sobic001G340100 Sobic003G109150--Sobic006G111000 Sobic003G232600--Sobic010G235100 Sobic003G232600--Sobic002G067900 Sobic003G232600--Sobic001G250750 Sobic003G232600--Sobic005G090800 Sobic003G232600--Sobic008G132500 Sobic003G232600--Sobic002G009000 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic003G232600--Sobic004G209100 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic003G232600--Sobic003G312900 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic003G232600--Sobic010G136700 Sobic008G132500--Sobic002G009000 Sobic008G132500--Sobic001G250750 Sobic008G132500--Sobic004G209100 Sobic008G132500--Sobic010G235100 Sobic008G132500--Sobic005G118800 Sobic008G132500--Sobic003G312900 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic008G132500--Sobic003G219300 Sobic008G132500--Sobic003G109150 Sobic008G132500--Sobic003G232600 Sobic004G117850--Sobic006G111000 Sobic004G117850--Sobic002G171901 Sobic004G117850--Sobic008G100900 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic004G117850--Sobic008G085800 Sobic004G117850--Sobic004G084600 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic004G117850--Sobic003G368450 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic004G117850--Sobic010G163666 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic004G117850--Sobic007G203800 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic004G117850--Sobic003G329300 Sobic002G171901--Sobic004G084600 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic002G171901--Sobic003G334400 Sobic002G171901--Sobic008G085800 Sobic002G171901--Sobic007G203800 Sobic002G171901--Sobic004G117850 Sobic002G171901--Sobic006G041200 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic002G171901--Sobic006G072701 Sobic002G171901--Sobic006G111000 Sobic002G171901--Sobic010G163666 Sobic005G118800--Sobic008G132500 Sobic005G118800--Sobic004G209100 Sobic005G118800--Sobic010G235100 Sobic005G118800--Sobic002G009000 Sobic005G118800--Sobic001G250750 Sobic005G118800--Sobic003G312900 Sobic005G118800--Sobic003G219300 Sobic005G118800--Sobic006G072701 Sobic005G118800--Sobic003G232600 Sobic001G250750--Sobic010G235100 Sobic001G250750--Sobic002G009000 Sobic001G250750--Sobic008G132500 Sobic001G250750--Sobic007G182300 Sobic001G250750--Sobic003G109150 Sobic001G250750--Sobic003G232600 Sobic001G250750--Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic002G067900 Sobic001G250750--Sobic005G090800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.