Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G117850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RLX1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G111000 expressed protein -
2 Sobic.002G171901 - -
3 Sobic.008G100900 - -
4 Sobic.008G085800 - -
5 Sobic.004G084600 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@AP2 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G368450 - -
7 Sobic.010G163666 - -
8 Sobic.007G203800 - -
9 Sobic.003G329300 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
10 Sobic.009G176100 - -
11 Sobic.006G041200 - -
12 Sobic.004G118300 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G033200 ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type, putative, expressed -
14 Sobic.003G413700 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
15 Sobic.010G142501 - -
16 Sobic.008G100801 - -
17 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
18 Sobic.007G174500 carrier, putative, expressed -
19 Sobic.009G192450 - -
20 Sobic.006G223101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic004G117850--Sobic006G111000 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic004G117850--Sobic002G171901 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic004G117850--Sobic008G100900 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic004G117850--Sobic008G085800 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic004G117850--Sobic004G084600 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic004G117850--Sobic003G368450 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic004G117850--Sobic010G163666 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic004G117850--Sobic007G203800 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic004G117850--Sobic003G329300 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic006G111000--Sobic006G041200 Sobic006G111000--Sobic008G100900 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic006G111000--Sobic007G182300 Sobic006G111000--Sobic004G117850 Sobic006G111000--Sobic004G084600 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic006G111000--Sobic004G255550 Sobic006G111000--Sobic002G171901 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic006G111000--Sobic003G336550 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic006G111000--Sobic009G176100 Sobic002G171901--Sobic004G084600 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic002G171901--Sobic003G334400 Sobic002G171901--Sobic008G085800 Sobic002G171901--Sobic007G203800 Sobic002G171901--Sobic004G117850 Sobic002G171901--Sobic006G041200 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic002G171901--Sobic006G072701 Sobic002G171901--Sobic006G111000 Sobic002G171901--Sobic010G163666 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic008G100900--Sobic002G142950 Sobic008G100801 Sobic008G100801 Sobic008G100900--Sobic008G100801 Sobic008G100900--Sobic006G111000 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic008G100900--Sobic004G133201 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic008G100900--Sobic004G127766 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic008G100900--Sobic008G115200 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic008G100900--Sobic007G113000 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic008G100900--Sobic010G169950 Sobic008G100900--Sobic004G117850 Sobic008G085800--Sobic002G171901 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic008G085800--Sobic007G174500 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic003G329300 Sobic008G085800--Sobic009G176100 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic008G085800--Sobic004G138100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G085800--Sobic007G004400 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic008G085800--Sobic003G335100 Sobic008G085800--Sobic003G334400 Sobic004G084600--Sobic002G171901 Sobic004G084600--Sobic006G072701 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic004G084600--Sobic004G030850 Sobic004G084600--Sobic006G041200 Sobic004G084600--Sobic006G111000 Sobic004G084600--Sobic003G336550 Sobic004G084600--Sobic007G203800 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G084600--Sobic010G088100 Sobic004G084600--Sobic004G117850 Sobic003G368450--Sobic004G117850 Sobic009G192450 Sobic009G192450 Sobic003G368450--Sobic009G192450 Sobic008G042400 Sobic008G042400 Sobic003G368450--Sobic008G042400 Sobic001G073550 Sobic001G073550 Sobic003G368450--Sobic001G073550 Sobic003G368450--Sobic008G100801 Sobic003G368450--Sobic008G100900 Sobic004G160350 Sobic004G160350 Sobic003G368450--Sobic004G160350 Sobic003G368450--Sobic010G163666 Sobic003G368450--Sobic004G084600 Sobic010G264150 Sobic010G264150 Sobic010G163666--Sobic010G264150 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic010G163666--Sobic007G054200 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic010G163666--Sobic007G046700 Sobic010G163666--Sobic002G171901 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic010G163666--Sobic002G009000 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic010G163666--Sobic002G074900 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic010G163666--Sobic002G067900 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic010G163666--Sobic003G069400 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic010G163666--Sobic001G250750 Sobic007G203800--Sobic002G171901 Sobic007G203800--Sobic004G084600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic007G203800--Sobic009G192400 Sobic007G203800--Sobic006G041200 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic007G203800--Sobic007G225050 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic007G203800--Sobic007G206400 Sobic007G203800--Sobic003G336550 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic007G203800--Sobic006G021100 Sobic007G203800--Sobic008G085800 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic008G085800 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic009G176100 Sobic003G329300--Sobic007G174500 Sobic003G329300--Sobic002G171901 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic003G329300--Sobic005G182100 Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic003G329300--Sobic003G358150 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic003G329300--Sobic002G033200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.