Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G118300.2
Synonym
Functional annotation OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RLY2
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF74
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G51370 : F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g31340.1 : OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1B02G344600 , TraesCS1A02G330800 , TraesCS1D02G333700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G118300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G033200 ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type, putative, expressed -
2 Sobic.004G117850 - -
3 Sobic.003G329300 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
4 Sobic.007G203800 - -
5 Sobic.007G137100 - -
6 Sobic.006G111000 expressed protein -
7 Sobic.002G171901 - -
8 Sobic.007G225050 - -
9 Sobic.009G176100 - -
10 Sobic.006G021100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@L-ascorbate peroxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@OsAPx3 - Peroxisomal Ascorbate Peroxidase encoding gene 5,8, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
11 Sobic.004G030850 - -
12 Sobic.003G399200 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
13 Sobic.004G084600 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@AP2 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G182100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
15 Sobic.002G208900 glutamate receptor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
16 Sobic.008G085800 - -
17 Sobic.003G336550 - -
18 Sobic.010G088100 ADP-ribosylation factor 1, putative, expressed K07977: Arf/Sar family, other
19 Sobic.006G041200 - -
20 Sobic.002G208700 glutamate receptor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant


Gene co-expression network
sample Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic004G118300--Sobic002G033200 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic004G118300--Sobic004G117850 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic004G118300--Sobic003G329300 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic004G118300--Sobic007G203800 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic004G118300--Sobic007G137100 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic004G118300--Sobic006G111000 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic004G118300--Sobic002G171901 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic004G118300--Sobic007G225050 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic004G118300--Sobic009G176100 Sobic002G033200--Sobic004G118300 Sobic002G033200--Sobic003G329300 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic002G033200--Sobic004G030850 Sobic002G033200--Sobic004G117850 Sobic002G033200--Sobic006G111000 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic002G033200--Sobic009G137401 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic002G033200--Sobic008G113200 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic002G033200--Sobic010G088100 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic002G033200--Sobic001G090700 Sobic004G117850--Sobic006G111000 Sobic004G117850--Sobic002G171901 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic004G117850--Sobic008G100900 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic004G117850--Sobic008G085800 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic004G117850--Sobic004G084600 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic004G117850--Sobic003G368450 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic004G117850--Sobic010G163666 Sobic004G117850--Sobic007G203800 Sobic004G117850--Sobic003G329300 Sobic003G329300--Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic008G085800 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic009G176100 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic003G329300--Sobic007G174500 Sobic003G329300--Sobic002G171901 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic003G329300--Sobic005G182100 Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic003G329300--Sobic003G358150 Sobic003G329300--Sobic002G033200 Sobic007G203800--Sobic002G171901 Sobic007G203800--Sobic004G084600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic007G203800--Sobic009G192400 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic007G203800--Sobic006G041200 Sobic007G203800--Sobic007G225050 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic007G203800--Sobic007G206400 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic007G203800--Sobic003G336550 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic007G203800--Sobic006G021100 Sobic007G203800--Sobic008G085800 Sobic007G137100--Sobic003G329300 Sobic007G137100--Sobic005G182100 Sobic007G137100--Sobic008G085800 Sobic007G137100--Sobic002G171901 Sobic007G137100--Sobic003G358150 Sobic007G137100--Sobic007G174500 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic007G137100--Sobic003G399200 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic007G137100--Sobic003G335000 Sobic007G137100--Sobic004G118300 Sobic006G111000--Sobic006G041200 Sobic006G111000--Sobic008G100900 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic006G111000--Sobic007G182300 Sobic006G111000--Sobic004G117850 Sobic006G111000--Sobic004G084600 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic006G111000--Sobic004G255550 Sobic006G111000--Sobic002G171901 Sobic006G111000--Sobic003G336550 Sobic006G111000--Sobic009G176100 Sobic002G171901--Sobic004G084600 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic002G171901--Sobic003G334400 Sobic002G171901--Sobic008G085800 Sobic002G171901--Sobic007G203800 Sobic002G171901--Sobic004G117850 Sobic002G171901--Sobic006G041200 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic002G171901--Sobic006G072701 Sobic002G171901--Sobic006G111000 Sobic002G171901--Sobic010G163666 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic007G225050--Sobic006G045301 Sobic007G225050--Sobic007G203800 Sobic003G015800 Sobic003G015800 Sobic007G225050--Sobic003G015800 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic007G225050--Sobic008G078500 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic007G225050--Sobic007G203850 Sobic007G225050--Sobic004G118300 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic007G225050--Sobic007G081400 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic007G225050--Sobic002G380150 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic007G225050--Sobic003G305250 Sobic009G176100--Sobic008G085800 Sobic009G176100--Sobic006G111000 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic009G176100--Sobic007G096833 Sobic009G176100--Sobic003G329300 Sobic009G176100--Sobic002G171901 Sobic009G176100--Sobic008G100900 Sobic009G176100--Sobic007G174500 Sobic009G176100--Sobic004G117850 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic009G176100--Sobic010G142501
Octagon: transcription factors


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