Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G399200.1
Synonym NRT1.6
Functional annotation peptide transporter PTR2, putative, expressed
UniProt A0A1W0W172
Pfam PF00854
Panther DB PTHR11654 PTHR11654:SF20
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0006810transport GO:0005215transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G27080 : nitrate transporter 1.6
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g68510.1 : peptide transporter PTR2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT73442
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G137100 - -
2 Sobic.007G174500 carrier, putative, expressed -
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Gene co-expression network
sample Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic003G399200--Sobic007G137100 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic003G399200--Sobic007G174500 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic003G399200--Sobic004G118300 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic003G399200--Sobic001G521800 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic003G399200--Sobic007G096833 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic003G399200--Sobic008G085800 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic003G399200--Sobic003G329300 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic003G399200--Sobic004G117850 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic003G399200--Sobic007G174000 Sobic007G137100--Sobic003G329300 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic007G137100--Sobic005G182100 Sobic007G137100--Sobic008G085800 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic007G137100--Sobic002G171901 Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic007G137100--Sobic003G358150 Sobic007G137100--Sobic007G174500 Sobic007G137100--Sobic003G399200 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic007G137100--Sobic003G335000 Sobic007G137100--Sobic004G118300 Sobic007G174500--Sobic008G085800 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic007G174500--Sobic010G142501 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic007G174500--Sobic010G274700 Sobic007G174500--Sobic003G329300 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic007G174500--Sobic002G375500 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic007G174500--Sobic002G208500 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic007G174500--Sobic004G138100 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic007G174500--Sobic001G431600 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic007G174500--Sobic005G231000 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic004G118300--Sobic002G033200 Sobic004G118300--Sobic004G117850 Sobic004G118300--Sobic003G329300 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic004G118300--Sobic007G203800 Sobic004G118300--Sobic007G137100 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic004G118300--Sobic006G111000 Sobic004G118300--Sobic002G171901 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic004G118300--Sobic007G225050 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic004G118300--Sobic009G176100 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic001G521800--Sobic001G154450 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic001G521800--Sobic003G368550 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic001G521800--Sobic001G499350 Sobic001G521800--Sobic005G231000 SobicK043700 SobicK043700 Sobic001G521800--SobicK043700 Sobic001G521800--Sobic009G176100 Sobic003G445750 Sobic003G445750 Sobic001G521800--Sobic003G445750 Sobic001G521800--Sobic003G399200 Sobic010G254401 Sobic010G254401 Sobic001G521800--Sobic010G254401 Sobic007G096833--Sobic009G176100 Sobic006G000200 Sobic006G000200 Sobic007G096833--Sobic006G000200 Sobic007G096833--Sobic003G399200 Sobic007G096833--Sobic004G117850 Sobic007G096833--Sobic006G111000 Sobic002G302800 Sobic002G302800 Sobic007G096833--Sobic002G302800 Sobic007G096833--Sobic010G142501 Sobic007G056300 Sobic007G056300 Sobic007G096833--Sobic007G056300 Sobic007G096833--Sobic004G118300 Sobic008G085800--Sobic002G171901 Sobic008G085800--Sobic007G174500 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic003G329300 Sobic008G085800--Sobic009G176100 Sobic008G085800--Sobic004G138100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G085800--Sobic007G004400 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic008G085800--Sobic003G335100 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic008G085800--Sobic003G334400 Sobic003G329300--Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic008G085800 Sobic003G329300--Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic009G176100 Sobic003G329300--Sobic007G174500 Sobic003G329300--Sobic002G171901 Sobic003G329300--Sobic005G182100 Sobic003G329300--Sobic003G358150 Sobic003G329300--Sobic002G033200 Sobic004G117850--Sobic006G111000 Sobic004G117850--Sobic002G171901 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic004G117850--Sobic008G100900 Sobic004G117850--Sobic008G085800 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic004G117850--Sobic004G084600 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic004G117850--Sobic003G368450 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic004G117850--Sobic010G163666 Sobic004G117850--Sobic007G203800 Sobic004G117850--Sobic003G329300 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic007G174000--Sobic008G078500 Sobic004G203633 Sobic004G203633 Sobic007G174000--Sobic004G203633 Sobic007G174000--Sobic003G399200 Sobic007G155950 Sobic007G155950 Sobic007G174000--Sobic007G155950 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic007G174000--Sobic004G357600 Sobic007G174000--Sobic005G182100 Sobic007G174000--Sobic007G225050 Sobic007G174000--Sobic007G137100 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic007G174000--Sobic001G093732
Octagon: transcription factors


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