Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G174000.1
Synonym Sb07g024610
Functional annotation carrier, putative, expressed
UniProt A0A1B6PIA6
Pfam PF03087
Panther DB PTHR33070 PTHR33070:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17080 : Arabidopsis protein of unknown function (DUF241)
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g43980.1 : carrier, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G078500 - -
2 Sobic.004G203633 - -
3 Sobic.003G399200 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
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6 Sobic.005G182100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
7 Sobic.007G225050 - -
8 Sobic.007G137100 - -
9 Sobic.001G093732 - -
10 Sobic.007G203850 - -
11 Sobic.006G027800 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
12 Sobic.006G154900 mitochondrial carrier protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G249200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K03883: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
14 Sobic.004G118300 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G045100 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
16 Sobic.003G329300 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
17 Sobic.007G203800 - -
18 Sobic.008G085800 - -
19 Sobic.006G045301 - -
20 Sobic.008G042400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic007G174000--Sobic008G078500 Sobic004G203633 Sobic004G203633 Sobic007G174000--Sobic004G203633 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic007G174000--Sobic003G399200 Sobic007G155950 Sobic007G155950 Sobic007G174000--Sobic007G155950 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic007G174000--Sobic004G357600 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic007G174000--Sobic005G182100 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic007G174000--Sobic007G225050 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic007G174000--Sobic007G137100 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic007G174000--Sobic001G093732 Sobic008G078500--Sobic007G225050 Sobic008G078500--Sobic007G174000 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic008G078500--Sobic007G203850 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic008G078500--Sobic006G045301 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic008G078500--Sobic003G241600 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic008G078500--Sobic004G223350 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic008G078500--Sobic002G380150 Sobic008G078500--Sobic001G093732 Sobic006G154900 Sobic006G154900 Sobic008G078500--Sobic006G154900 Sobic004G203633--Sobic007G155950 Sobic004G203633--Sobic007G174000 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic004G203633--Sobic003G329300 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic004G203633--Sobic010G274700 Sobic004G203633--Sobic005G182100 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic004G203633--Sobic008G085800 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic004G203633--Sobic003G335000 Sobic004G203633--Sobic007G137100 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic004G203633--Sobic007G174500 Sobic003G399200--Sobic007G137100 Sobic003G399200--Sobic007G174500 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic003G399200--Sobic004G118300 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic003G399200--Sobic001G521800 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic003G399200--Sobic007G096833 Sobic003G399200--Sobic008G085800 Sobic003G399200--Sobic003G329300 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic003G399200--Sobic004G117850 Sobic003G399200--Sobic007G174000 Sobic007G155950--Sobic004G203633 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic007G155950--Sobic003G177350 Sobic007G155950--Sobic003G335000 Sobic007G155950--Sobic003G329300 Sobic007G155950--Sobic007G174000 Sobic007G155950--Sobic007G137100 Sobic006G257400 Sobic006G257400 Sobic007G155950--Sobic006G257400 Sobic007G155950--Sobic005G182100 Sobic007G155950--Sobic008G085800 Sobic004G249200 Sobic004G249200 Sobic004G357600--Sobic004G249200 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic004G357600--Sobic001G296600 Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic004G357600--Sobic001G104050 Sobic005G222000 Sobic005G222000 Sobic004G357600--Sobic005G222000 Sobic004G357600--Sobic007G174500 Sobic004G357600--Sobic007G174000 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic004G357600--Sobic004G138100 Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic004G357600--Sobic010G265400 Sobic009G011100 Sobic009G011100 Sobic004G357600--Sobic009G011100 Sobic005G182100--Sobic007G137100 Sobic005G182100--Sobic003G329300 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic005G182100--Sobic007G016200 Sobic005G182100--Sobic004G203633 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic005G182100--Sobic002G033200 Sobic005G182100--Sobic004G118300 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic005G182100--Sobic001G090700 Sobic005G182100--Sobic010G274700 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic005G182100--Sobic009G137401 Sobic007G225050--Sobic006G045301 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic007G225050--Sobic007G203800 Sobic003G015800 Sobic003G015800 Sobic007G225050--Sobic003G015800 Sobic007G225050--Sobic008G078500 Sobic007G225050--Sobic007G203850 Sobic007G225050--Sobic004G118300 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic007G225050--Sobic007G081400 Sobic007G225050--Sobic002G380150 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic007G225050--Sobic003G305250 Sobic007G137100--Sobic003G329300 Sobic007G137100--Sobic005G182100 Sobic007G137100--Sobic008G085800 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic007G137100--Sobic002G171901 Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic007G137100--Sobic003G358150 Sobic007G137100--Sobic007G174500 Sobic007G137100--Sobic003G399200 Sobic007G137100--Sobic003G335000 Sobic007G137100--Sobic004G118300 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic001G093732--Sobic009G252600 Sobic010G201444 Sobic010G201444 Sobic001G093732--Sobic010G201444 Sobic003G251900 Sobic003G251900 Sobic001G093732--Sobic003G251900 Sobic005G014400 Sobic005G014400 Sobic001G093732--Sobic005G014400 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic001G093732--Sobic008G007200 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic001G093732--Sobic001G483001 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic001G093732--Sobic007G046600 Sobic001G093732--Sobic006G154900 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic001G093732--Sobic006G279100
Octagon: transcription factors


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