Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G137100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PI06
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.007G137100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G329300 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
2 Sobic.005G182100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
3 Sobic.008G085800 - -
4 Sobic.002G171901 - -
5 Sobic.003G358150 - -
6 Sobic.007G174500 carrier, putative, expressed -
7 Sobic.003G399200 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
8 Sobic.003G335000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G118300 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G208700 glutamate receptor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
11 Sobic.001G187900 disease resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G203800 - -
13 Sobic.010G274700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@receptor kinase, putative, expressed -
14 Sobic.004G117850 - -
15 Sobic.006G215650 - -
16 Sobic.007G016200 expressed protein -
17 Sobic.009G176100 - -
18 Sobic.004G203633 - -
19 Sobic.003G334400 verticillium wilt disease resistance protein precursor, putative, expressed -
20 Sobic.003G058300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic007G137100--Sobic003G329300 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic007G137100--Sobic005G182100 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic007G137100--Sobic008G085800 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic007G137100--Sobic002G171901 Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic007G137100--Sobic003G358150 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic007G137100--Sobic007G174500 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic007G137100--Sobic003G399200 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic007G137100--Sobic003G335000 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic007G137100--Sobic004G118300 Sobic003G329300--Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic008G085800 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic010G274700 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic003G329300--Sobic009G176100 Sobic003G329300--Sobic007G174500 Sobic003G329300--Sobic002G171901 Sobic003G329300--Sobic005G182100 Sobic003G329300--Sobic003G358150 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic003G329300--Sobic002G033200 Sobic005G182100--Sobic007G137100 Sobic005G182100--Sobic003G329300 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic005G182100--Sobic007G016200 Sobic004G203633 Sobic004G203633 Sobic005G182100--Sobic004G203633 Sobic005G182100--Sobic002G033200 Sobic005G182100--Sobic004G118300 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic005G182100--Sobic001G090700 Sobic005G182100--Sobic010G274700 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic005G182100--Sobic009G137401 Sobic008G085800--Sobic002G171901 Sobic008G085800--Sobic007G174500 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic003G329300 Sobic008G085800--Sobic009G176100 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic008G085800--Sobic004G138100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G085800--Sobic007G004400 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic008G085800--Sobic003G335100 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic008G085800--Sobic003G334400 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic002G171901--Sobic004G084600 Sobic002G171901--Sobic003G334400 Sobic002G171901--Sobic008G085800 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic002G171901--Sobic007G203800 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic002G171901--Sobic004G117850 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic002G171901--Sobic006G041200 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic002G171901--Sobic006G072701 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic002G171901--Sobic006G111000 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic002G171901--Sobic010G163666 Sobic003G358150--Sobic003G329300 Sobic003G358150--Sobic007G137100 Sobic003G358150--Sobic008G085800 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G358150--Sobic005G118800 Sobic002G053300 Sobic002G053300 Sobic003G358150--Sobic002G053300 Sobic003G358150--Sobic006G223101 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic003G358150--Sobic001G229850 Sobic003G358150--Sobic002G171901 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic003G358150--Sobic010G235100 Sobic007G174500--Sobic008G085800 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic007G174500--Sobic010G142501 Sobic007G174500--Sobic010G274700 Sobic007G174500--Sobic003G329300 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic007G174500--Sobic002G375500 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic007G174500--Sobic002G208500 Sobic007G174500--Sobic004G138100 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic007G174500--Sobic001G431600 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic007G174500--Sobic005G231000 Sobic003G399200--Sobic007G137100 Sobic003G399200--Sobic007G174500 Sobic003G399200--Sobic004G118300 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic003G399200--Sobic001G521800 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic003G399200--Sobic007G096833 Sobic003G399200--Sobic008G085800 Sobic003G399200--Sobic003G329300 Sobic003G399200--Sobic004G117850 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic003G399200--Sobic007G174000 Sobic003G335000--Sobic003G334400 Sobic003G335000--Sobic006G223101 Sobic003G335000--Sobic003G335100 Sobic003G335000--Sobic008G085800 Sobic003G335000--Sobic002G171901 Sobic003G335000--Sobic001G229850 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic003G335000--Sobic006G223601 Sobic003G335000--Sobic007G137100 Sobic003G335000--Sobic007G004400 Sobic004G118300--Sobic002G033200 Sobic004G118300--Sobic004G117850 Sobic004G118300--Sobic003G329300 Sobic004G118300--Sobic007G203800 Sobic004G118300--Sobic007G137100 Sobic004G118300--Sobic006G111000 Sobic004G118300--Sobic002G171901 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic004G118300--Sobic007G225050 Sobic004G118300--Sobic009G176100
Octagon: transcription factors


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