Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G174500.1
Synonym Sb07g024640
Functional annotation carrier, putative, expressed
UniProt C5YNC7
Pfam PF03087
Panther DB PTHR33070 PTHR33070:SF22
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17080 : Arabidopsis protein of unknown function (DUF241)
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g43870.1 : carrier, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005659 , Zm00025a005663 , Zm00025a052049 , Zm00025a005658
Brachypodium PNT68554 , KQJ99301
Barley HORVU7Hr1G057870.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G085800 - -
2 Sobic.010G142501 - -
3 Sobic.010G274700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@receptor kinase, putative, expressed -
4 Sobic.003G329300 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
5 Sobic.002G375500 protein kinase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G208500 glutamate receptor 2.6 precursor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
7 Sobic.004G138100 expressed protein -
8 Sobic.001G431600 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
9 Sobic.005G231000 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G176100 - -
11 Sobic.007G137100 - -
12 Sobic.007G038100 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
13 Sobic.006G223101 - -
14 Sobic.006G111000 expressed protein -
15 Sobic.003G399200 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
16 Sobic.009G011100 SCARECROW, putative, expressed -
17 Sobic.008G100900 - -
18 Sobic.004G117850 - -
19 Sobic.008G165500 - -
20 Sobic.002G212900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic007G174500--Sobic008G085800 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic007G174500--Sobic010G142501 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic007G174500--Sobic010G274700 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic007G174500--Sobic003G329300 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic007G174500--Sobic002G375500 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic007G174500--Sobic002G208500 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic007G174500--Sobic004G138100 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic007G174500--Sobic001G431600 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic007G174500--Sobic005G231000 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic008G085800--Sobic002G171901 Sobic008G085800--Sobic007G174500 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic003G329300 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic008G085800--Sobic009G176100 Sobic008G085800--Sobic004G138100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G085800--Sobic007G004400 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic008G085800--Sobic003G335100 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic008G085800--Sobic003G334400 Sobic010G142501--Sobic007G174500 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic010G142501--Sobic006G111000 Sobic010G142501--Sobic003G329300 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic010G142501--Sobic008G100900 Sobic010G142501--Sobic009G176100 Sobic010G142501--Sobic008G085800 Sobic010G142501--Sobic010G274700 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic010G142501--Sobic004G117850 Sobic009G011100 Sobic009G011100 Sobic010G142501--Sobic009G011100 Sobic010G274700--Sobic003G329300 Sobic010G274700--Sobic007G174500 Sobic010G274700--Sobic002G375500 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic010G274700--Sobic006G248450 Sobic006G145300 Sobic006G145300 Sobic010G274700--Sobic006G145300 Sobic010G274700--Sobic010G142501 Sobic010G274700--Sobic001G431600 Sobic007G175100 Sobic007G175100 Sobic010G274700--Sobic007G175100 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic010G274700--Sobic001G229850 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic008G085800 Sobic003G329300--Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic009G176100 Sobic003G329300--Sobic007G174500 Sobic003G329300--Sobic002G171901 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic003G329300--Sobic005G182100 Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic003G329300--Sobic003G358150 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic003G329300--Sobic002G033200 Sobic002G375500--Sobic007G175100 Sobic007G038100 Sobic007G038100 Sobic002G375500--Sobic007G038100 Sobic002G375500--Sobic002G208500 Sobic002G375500--Sobic007G174500 Sobic002G375500--Sobic010G274700 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic002G375500--Sobic001G145550 Sobic006G054200 Sobic006G054200 Sobic002G375500--Sobic006G054200 Sobic005G168200 Sobic005G168200 Sobic002G375500--Sobic005G168200 Sobic001G174100 Sobic001G174100 Sobic002G375500--Sobic001G174100 Sobic002G208500--Sobic002G375500 Sobic002G208500--Sobic007G174500 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic002G208500--Sobic002G226200 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic002G208500--Sobic009G247200 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic002G208500--Sobic003G230800 Sobic002G208500--Sobic010G142501 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic002G208500--Sobic003G219300 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic002G208500--Sobic002G129900 Sobic002G208500--Sobic005G168200 Sobic004G138100--Sobic008G085800 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic004G138100--Sobic004G127766 Sobic004G138100--Sobic005G231000 Sobic004G138100--Sobic001G431600 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic004G138100--Sobic007G190600 Sobic004G138100--Sobic007G174500 Sobic004G310800 Sobic004G310800 Sobic004G138100--Sobic004G310800 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic004G138100--Sobic002G154450 Sobic010G254401 Sobic010G254401 Sobic004G138100--Sobic010G254401 Sobic001G431600--Sobic007G004400 Sobic001G431600--Sobic006G223101 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic001G431600--Sobic008G119600 Sobic001G431600--Sobic003G335100 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic001G431600--Sobic002G074900 Sobic002G053300 Sobic002G053300 Sobic001G431600--Sobic002G053300 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic001G431600--Sobic007G190466 Sobic001G431600--Sobic004G138100 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic001G431600--Sobic002G256250 SobicK043700 SobicK043700 Sobic005G231000--SobicK043700 Sobic005G231000--Sobic010G254401 Sobic005G231000--Sobic004G138100 Sobic005G231000--Sobic004G310800 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic005G231000--Sobic001G499350 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic005G231000--Sobic002G142950 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic005G231000--Sobic001G521800 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic005G231000--Sobic010G155000 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic005G231000--Sobic004G180950
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.