Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G011100.2,Sobic.009G011100.4,Sobic.009G011100.3,Sobic.009G011100.5
Synonym Sb09g001140, SCL14, ATGRAS2, GRAS2
Functional annotation SCARECROW, putative, expressed
UniProt A0A1B6P5S1
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF63
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G07530 : SCARECROW-like 14
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g48450.3,LOC_Os03g48450.4,LOC_Os03g48450.1 : SCARECROW, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040953 , Zm00025a038271
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus PNT17671


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G011000 SCARECROW, putative, expressed -
2 Sobic.010G142501 - -
3 Sobic.004G138100 expressed protein -
4 Sobic.007G174500 carrier, putative, expressed -
5 Sobic.009G011200 SCARECROW, putative, expressed -
6 Sobic.007G190600 - -
7 Sobic.004G249200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K03883: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
8 Sobic.006G108900 pentatricopeptide, putative, expressed -
9 Sobic.007G190466 - -
10 Sobic.002G053300 mla1, putative, expressed -
11 Sobic.006G233200 - -
12 Sobic.005G222000 protein transporter, putative, expressed -
13 Sobic.001G431600 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
14 Sobic.008G085800 - -
15 Sobic.005G231000 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
16 Sobic.006G038050 - -
17 Sobic.001G175200 expressed protein -
18 Sobic.001G208133 - -
19 Sobic.009G011050 - -
20 Sobic.006G261650 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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