Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G011000.2,Sobic.009G011000.4,Sobic.009G011000.3
Synonym GRAS2, SCL14, ATGRAS2
Functional annotation SCARECROW, putative, expressed
UniProt A0A1B6P5S0
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF63
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G07530 : SCARECROW-like 14
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g48450.3,LOC_Os03g48450.4 : SCARECROW, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040953
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G011100 SCARECROW, putative, expressed -
2 Sobic.009G011200 SCARECROW, putative, expressed -
3 Sobic.001G208133 - -
4 Sobic.007G174500 carrier, putative, expressed -
5 Sobic.010G142501 - -
6 Sobic.004G138100 expressed protein -
7 Sobic.003G311300 GRF zinc finger family protein, expressed -
8 Sobic.007G190600 - -
9 Sobic.004G079400 FAR1 family protein, expressed -
10 Sobic.006G108900 pentatricopeptide, putative, expressed -
11 Sobic.005G231000 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
12 Sobic.006G038050 - -
13 Sobic.004G061100 - -
14 Sobic.003G031300 - -
15 Sobic.006G239200 expressed protein -
16 Sobic.009G011050 - -
17 Sobic.004G352750 - -
18 Sobic.004G249200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K03883: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
19 Sobic.007G038200 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
20 Sobic.001G175200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G011000 Sobic009G011000 Sobic009G011100 Sobic009G011100 Sobic009G011000--Sobic009G011100 Sobic009G011200 Sobic009G011200 Sobic009G011000--Sobic009G011200 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic009G011000--Sobic001G208133 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic009G011000--Sobic007G174500 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic009G011000--Sobic010G142501 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic009G011000--Sobic004G138100 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic009G011000--Sobic003G311300 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic009G011000--Sobic007G190600 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic009G011000--Sobic004G079400 Sobic009G011100--Sobic009G011000 Sobic009G011100--Sobic010G142501 Sobic009G011100--Sobic004G138100 Sobic009G011100--Sobic007G174500 Sobic009G011100--Sobic009G011200 Sobic009G011100--Sobic007G190600 Sobic004G249200 Sobic004G249200 Sobic009G011100--Sobic004G249200 Sobic006G108900 Sobic006G108900 Sobic009G011100--Sobic006G108900 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic009G011100--Sobic007G190466 Sobic009G011200--Sobic009G011000 Sobic009G011200--Sobic009G011100 Sobic001G372400 Sobic001G372400 Sobic009G011200--Sobic001G372400 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic009G011200--Sobic008G187450 Sobic009G011200--Sobic001G208133 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic009G011200--Sobic002G117800 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic009G011200--Sobic007G043050 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic009G011200--Sobic005G198150 Sobic004G352750 Sobic004G352750 Sobic009G011200--Sobic004G352750 Sobic001G208133--Sobic003G311300 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic001G208133--Sobic006G239200 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic001G208133--Sobic009G011050 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic001G208133--Sobic003G031300 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic001G208133--Sobic006G038050 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic001G208133--Sobic001G202800 Sobic001G208133--Sobic004G079400 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic001G208133--Sobic007G134700 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic001G208133--Sobic004G039000 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic007G174500--Sobic008G085800 Sobic007G174500--Sobic010G142501 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic007G174500--Sobic010G274700 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic007G174500--Sobic003G329300 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic007G174500--Sobic002G375500 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic007G174500--Sobic002G208500 Sobic007G174500--Sobic004G138100 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic007G174500--Sobic001G431600 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic007G174500--Sobic005G231000 Sobic010G142501--Sobic007G174500 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic010G142501--Sobic006G111000 Sobic010G142501--Sobic003G329300 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic010G142501--Sobic008G100900 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic010G142501--Sobic009G176100 Sobic010G142501--Sobic008G085800 Sobic010G142501--Sobic010G274700 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic010G142501--Sobic004G117850 Sobic010G142501--Sobic009G011100 Sobic004G138100--Sobic008G085800 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic004G138100--Sobic004G127766 Sobic004G138100--Sobic005G231000 Sobic004G138100--Sobic001G431600 Sobic004G138100--Sobic007G190600 Sobic004G138100--Sobic007G174500 Sobic004G310800 Sobic004G310800 Sobic004G138100--Sobic004G310800 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic004G138100--Sobic002G154450 Sobic010G254401 Sobic010G254401 Sobic004G138100--Sobic010G254401 Sobic003G311300--Sobic001G208133 Sobic003G311300--Sobic006G239200 Sobic003G311300--Sobic004G079400 Sobic003G311300--Sobic003G031300 Sobic003G311300--Sobic006G038050 Sobic003G311300--Sobic009G011050 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic003G311300--Sobic004G061100 Sobic003G311300--Sobic001G202800 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic003G311300--Sobic003G030100 Sobic007G190600--Sobic007G190466 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic007G190600--Sobic004G276600 Sobic007G190600--Sobic004G127766 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic007G190600--Sobic005G154600 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic007G190600--Sobic006G261650 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic007G190600--Sobic001G420150 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic007G190600--Sobic002G246100 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic007G190600--Sobic006G059150 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic007G190600--Sobic004G332200 Sobic004G079400--Sobic003G311300 Sobic004G079400--Sobic004G061100 Sobic004G079400--Sobic003G031300 Sobic004G079400--Sobic003G030100 Sobic004G079400--Sobic001G208133 Sobic004G079400--Sobic006G239200 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic004G079400--Sobic010G227600 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic004G079400--Sobic001G175200 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic004G079400--Sobic004G233100
Octagon: transcription factors


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