Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G011200.3,Sobic.009G011200.2
Synonym Sb09g001150
Functional annotation SCARECROW, putative, expressed
UniProt C5YYG6
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37650 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g48450.2,LOC_Os03g48450.3 : SCARECROW, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040950
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G011000 SCARECROW, putative, expressed -
2 Sobic.009G011100 SCARECROW, putative, expressed -
3 Sobic.001G372400 - -
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5 Sobic.001G208133 - -
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7 Sobic.007G043050 - -
8 Sobic.005G198150 - -
9 Sobic.004G352750 - -
10 Sobic.001G257600 - -
11 Sobic.006G224600 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G174200 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
13 Sobic.003G311300 GRF zinc finger family protein, expressed -
14 Sobic.010G227600 - -
15 Sobic.009G011050 - -
16 Sobic.001G509901 - -
17 Sobic.004G249200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K03883: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
18 Sobic.004G233100 - -
19 Sobic.007G203600 transferase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G079400 FAR1 family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G011200 Sobic009G011200 Sobic009G011000 Sobic009G011000 Sobic009G011200--Sobic009G011000 Sobic009G011100 Sobic009G011100 Sobic009G011200--Sobic009G011100 Sobic001G372400 Sobic001G372400 Sobic009G011200--Sobic001G372400 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic009G011200--Sobic008G187450 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic009G011200--Sobic001G208133 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic009G011200--Sobic002G117800 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic009G011200--Sobic007G043050 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic009G011200--Sobic005G198150 Sobic004G352750 Sobic004G352750 Sobic009G011200--Sobic004G352750 Sobic009G011000--Sobic009G011100 Sobic009G011000--Sobic009G011200 Sobic009G011000--Sobic001G208133 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic009G011000--Sobic007G174500 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic009G011000--Sobic010G142501 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic009G011000--Sobic004G138100 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic009G011000--Sobic003G311300 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic009G011000--Sobic007G190600 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic009G011000--Sobic004G079400 Sobic009G011100--Sobic009G011000 Sobic009G011100--Sobic010G142501 Sobic009G011100--Sobic004G138100 Sobic009G011100--Sobic007G174500 Sobic009G011100--Sobic009G011200 Sobic009G011100--Sobic007G190600 Sobic004G249200 Sobic004G249200 Sobic009G011100--Sobic004G249200 Sobic006G108900 Sobic006G108900 Sobic009G011100--Sobic006G108900 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic009G011100--Sobic007G190466 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic001G372400--Sobic009G206900 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic001G372400--Sobic004G233100 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic001G372400--Sobic009G248200 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic001G372400--Sobic010G227600 Sobic006G090450 Sobic006G090450 Sobic001G372400--Sobic006G090450 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic001G372400--Sobic001G115200 Sobic010G041301 Sobic010G041301 Sobic001G372400--Sobic010G041301 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic001G372400--Sobic001G509901 Sobic004G108600 Sobic004G108600 Sobic001G372400--Sobic004G108600 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic008G187450--Sobic004G007166 Sobic008G187450--Sobic005G198150 Sobic002G262250 Sobic002G262250 Sobic008G187450--Sobic002G262250 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic008G187450--Sobic007G203600 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic008G187450--Sobic001G387400 Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic008G187450--Sobic001G174200 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic008G187450--Sobic009G028650 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic008G187450--Sobic003G340500 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic008G187450--Sobic008G176266 Sobic001G208133--Sobic003G311300 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic001G208133--Sobic006G239200 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic001G208133--Sobic009G011050 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic001G208133--Sobic003G031300 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic001G208133--Sobic006G038050 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic001G208133--Sobic001G202800 Sobic001G208133--Sobic004G079400 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic001G208133--Sobic007G134700 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic001G208133--Sobic004G039000 Sobic002G117800--Sobic001G202800 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic002G117800--Sobic004G092950 Sobic002G290900 Sobic002G290900 Sobic002G117800--Sobic002G290900 Sobic010G023132 Sobic010G023132 Sobic002G117800--Sobic010G023132 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic002G117800--Sobic003G024450 Sobic002G117800--Sobic009G011050 Sobic002G117800--Sobic004G039000 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic002G117800--Sobic008G060800 Sobic002G117800--Sobic001G208133 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic007G043050--Sobic001G519500 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic007G043050--Sobic006G007700 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic007G043050--Sobic001G369701 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic007G043050--Sobic010G165925 Sobic007G043050--Sobic007G203600 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic007G043050--Sobic007G003250 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic007G043050--Sobic006G196800 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic007G043050--Sobic005G107250 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic007G043050--Sobic010G263151 SobicK004201 SobicK004201 Sobic005G198150--SobicK004201 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic005G198150--Sobic010G228800 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic005G198150--Sobic006G224600 Sobic005G198150--Sobic008G187450 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic005G198150--Sobic004G061100 Sobic005G198150--Sobic002G117800 Sobic005G198150--Sobic001G509901 Sobic005G198150--Sobic009G011050 Sobic005G198150--Sobic006G038050 Sobic004G352750--Sobic003G031300 Sobic004G352750--Sobic003G311300 Sobic004G352750--Sobic001G208133 Sobic004G352750--Sobic004G079400 Sobic004G352750--Sobic001G174200 Sobic001G257600 Sobic001G257600 Sobic004G352750--Sobic001G257600 Sobic004G352750--Sobic006G239200 Sobic004G352750--Sobic009G011050 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic004G352750--Sobic003G030100
Octagon: transcription factors


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