Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G198150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RK13
Pfam PF04578
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45470 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g42080.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.K004201 - -
2 Sobic.010G228800 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
3 Sobic.006G224600 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G187450 - -
5 Sobic.004G061100 - -
6 Sobic.002G117800 - -
7 Sobic.001G509901 - -
8 Sobic.009G011050 - -
9 Sobic.006G038050 - -
10 Sobic.003G340200 - -
11 Sobic.001G175200 expressed protein -
12 Sobic.002G262250 - -
13 Sobic.002G314100 dimethyladenosine transferase, putative, expressed K14191: 18S rRNA (adenine1779-N6/adenine1780-N6)-dimethyltransferase
14 Sobic.001G208133 - -
15 Sobic.008G060800 expressed protein -
16 Sobic.003G311300 GRF zinc finger family protein, expressed -
17 Sobic.003G388201 - -
18 Sobic.004G233100 - -
19 Sobic.006G241500 - -
20 Sobic.001G486400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G198150 Sobic005G198150 SobicK004201 SobicK004201 Sobic005G198150--SobicK004201 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic005G198150--Sobic010G228800 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic005G198150--Sobic006G224600 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic005G198150--Sobic008G187450 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic005G198150--Sobic004G061100 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic005G198150--Sobic002G117800 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic005G198150--Sobic001G509901 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic005G198150--Sobic009G011050 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic005G198150--Sobic006G038050 Sobic008G133750 Sobic008G133750 SobicK004201--Sobic008G133750 SobicK004201--Sobic005G198150 Sobic003G198850 Sobic003G198850 SobicK004201--Sobic003G198850 Sobic003G388201 Sobic003G388201 SobicK004201--Sobic003G388201 Sobic006G241500 Sobic006G241500 SobicK004201--Sobic006G241500 SobicK004201--Sobic002G117800 Sobic002G314100 Sobic002G314100 SobicK004201--Sobic002G314100 Sobic002G367000 Sobic002G367000 SobicK004201--Sobic002G367000 SobicK004201--Sobic006G038050 Sobic010G228800--Sobic005G198150 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic010G228800--Sobic001G175200 Sobic010G228800--Sobic006G241500 Sobic010G228800--Sobic001G509901 Sobic010G228800--Sobic006G224600 Sobic010G228800--Sobic004G061100 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic010G228800--Sobic001G486400 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic010G228800--Sobic003G340200 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic010G228800--Sobic005G166200 Sobic006G224600--Sobic001G509901 Sobic006G224600--Sobic004G061100 Sobic006G224600--Sobic005G198150 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic006G224600--Sobic009G248200 Sobic006G224600--Sobic001G175200 Sobic001G037700 Sobic001G037700 Sobic006G224600--Sobic001G037700 Sobic006G224600--Sobic010G228800 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic006G224600--Sobic004G233100 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic006G224600--Sobic004G079400 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic008G187450--Sobic004G007166 Sobic008G187450--Sobic005G198150 Sobic002G262250 Sobic002G262250 Sobic008G187450--Sobic002G262250 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic008G187450--Sobic007G203600 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic008G187450--Sobic001G387400 Sobic001G174200 Sobic001G174200 Sobic008G187450--Sobic001G174200 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic008G187450--Sobic009G028650 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic008G187450--Sobic003G340500 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic008G187450--Sobic008G176266 Sobic004G061100--Sobic001G175200 Sobic004G061100--Sobic004G079400 Sobic004G061100--Sobic001G509901 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic004G061100--Sobic003G311300 Sobic004G061100--Sobic004G233100 Sobic004G061100--Sobic006G224600 Sobic004G061100--Sobic006G038050 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic004G061100--Sobic006G239200 Sobic004G061100--Sobic003G340200 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic002G117800--Sobic001G202800 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic002G117800--Sobic004G092950 Sobic002G290900 Sobic002G290900 Sobic002G117800--Sobic002G290900 Sobic010G023132 Sobic010G023132 Sobic002G117800--Sobic010G023132 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic002G117800--Sobic003G024450 Sobic002G117800--Sobic009G011050 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic002G117800--Sobic004G039000 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic002G117800--Sobic008G060800 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic002G117800--Sobic001G208133 Sobic001G509901--Sobic005G166200 Sobic001G509901--Sobic004G061100 Sobic001G509901--Sobic004G233100 Sobic001G509901--Sobic006G224600 Sobic001G509901--Sobic009G248200 Sobic001G509901--Sobic003G340200 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic001G509901--Sobic002G025200 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic001G509901--Sobic009G206900 Sobic001G509901--Sobic001G175200 Sobic009G011050--Sobic006G239200 Sobic009G011050--Sobic001G202800 Sobic009G011050--Sobic001G208133 Sobic009G011050--Sobic003G311300 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic009G011050--Sobic006G037800 Sobic002G142400 Sobic002G142400 Sobic009G011050--Sobic002G142400 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic009G011050--Sobic007G134700 Sobic009G011050--Sobic008G060800 Sobic009G011050--Sobic006G038050 Sobic006G038050--Sobic003G311300 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic006G038050--Sobic010G149000 Sobic006G038050--Sobic006G037800 Sobic006G038050--Sobic001G208133 Sobic002G149500 Sobic002G149500 Sobic006G038050--Sobic002G149500 Sobic006G038050--Sobic006G239200 Sobic006G038050--Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic007G134700 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic006G038050--Sobic003G383000
Octagon: transcription factors


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