Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G340200.1,Sobic.003G340200.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q6T0 , A0A1B6Q6U8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G088300 expressed protein -
2 Sobic.002G025200 - -
3 Sobic.001G509901 - -
4 Sobic.005G166200 MTN26L5 - MtN26 family protein precursor, expressed -
5 Sobic.004G061100 - -
6 Sobic.001G175200 expressed protein -
7 Sobic.005G198150 - -
8 Sobic.010G228800 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
9 Sobic.002G419550 - -
10 Sobic.K004201 - -
11 Sobic.004G233100 - -
12 Sobic.003G257650 - -
13 Sobic.006G241500 - -
14 Sobic.001G037700 OsFBX151 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G224600 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G028300 - -
17 Sobic.002G314100 dimethyladenosine transferase, putative, expressed K14191: 18S rRNA (adenine1779-N6/adenine1780-N6)-dimethyltransferase
18 Sobic.009G131032 - -
19 Sobic.004G079400 FAR1 family protein, expressed -
20 Sobic.002G367000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed K01126: E3.1.4.46, glpQ, glycerophosphoryl diester phosphodiesterase


Gene co-expression network
sample Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic003G340200--Sobic002G088300 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic003G340200--Sobic002G025200 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic003G340200--Sobic001G509901 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic003G340200--Sobic005G166200 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic003G340200--Sobic004G061100 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic003G340200--Sobic001G175200 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic003G340200--Sobic005G198150 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic003G340200--Sobic010G228800 Sobic002G419550 Sobic002G419550 Sobic003G340200--Sobic002G419550 Sobic002G088300--Sobic003G340200 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic002G088300--Sobic007G028300 Sobic002G088300--Sobic002G025200 Sobic002G088300--Sobic005G166200 Sobic009G131032 Sobic009G131032 Sobic002G088300--Sobic009G131032 Sobic002G088300--Sobic002G419550 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic002G088300--Sobic006G206600 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic002G088300--Sobic001G201933 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic002G088300--Sobic001G397550 Sobic002G025200--Sobic002G419550 Sobic001G038050 Sobic001G038050 Sobic002G025200--Sobic001G038050 Sobic002G025200--Sobic005G166200 Sobic002G025200--Sobic002G088300 Sobic002G025200--Sobic003G340200 Sobic002G025200--Sobic001G509901 Sobic002G314100 Sobic002G314100 Sobic002G025200--Sobic002G314100 Sobic004G193100 Sobic004G193100 Sobic002G025200--Sobic004G193100 Sobic002G025200--Sobic004G061100 Sobic001G509901--Sobic005G166200 Sobic001G509901--Sobic004G061100 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic001G509901--Sobic004G233100 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic001G509901--Sobic006G224600 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic001G509901--Sobic009G248200 Sobic001G509901--Sobic003G340200 Sobic001G509901--Sobic002G025200 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic001G509901--Sobic009G206900 Sobic001G509901--Sobic001G175200 Sobic005G166200--Sobic001G509901 Sobic005G166200--Sobic002G025200 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic005G166200--Sobic004G199100 Sobic005G166200--Sobic002G088300 Sobic005G166200--Sobic009G131032 Sobic005G166200--Sobic003G340200 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic005G166200--Sobic003G143600 Sobic008G123700 Sobic008G123700 Sobic005G166200--Sobic008G123700 Sobic005G166200--Sobic004G061100 Sobic004G061100--Sobic001G175200 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic004G061100--Sobic004G079400 Sobic004G061100--Sobic001G509901 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic004G061100--Sobic003G311300 Sobic004G061100--Sobic004G233100 Sobic004G061100--Sobic006G224600 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic004G061100--Sobic006G038050 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic004G061100--Sobic006G239200 Sobic004G061100--Sobic003G340200 Sobic001G175200--Sobic004G061100 Sobic001G175200--Sobic004G079400 Sobic001G175200--Sobic006G038050 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic001G175200--Sobic006G261650 Sobic001G175200--Sobic010G228800 Sobic001G175200--Sobic001G509901 Sobic001G175200--Sobic003G311300 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic001G175200--Sobic007G190600 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic001G175200--Sobic003G257650 SobicK004201 SobicK004201 Sobic005G198150--SobicK004201 Sobic005G198150--Sobic010G228800 Sobic005G198150--Sobic006G224600 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic005G198150--Sobic008G187450 Sobic005G198150--Sobic004G061100 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic005G198150--Sobic002G117800 Sobic005G198150--Sobic001G509901 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic005G198150--Sobic009G011050 Sobic005G198150--Sobic006G038050 Sobic010G228800--Sobic005G198150 Sobic010G228800--Sobic001G175200 Sobic006G241500 Sobic006G241500 Sobic010G228800--Sobic006G241500 Sobic010G228800--Sobic001G509901 Sobic010G228800--Sobic006G224600 Sobic010G228800--Sobic004G061100 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic010G228800--Sobic001G486400 Sobic010G228800--Sobic003G340200 Sobic010G228800--Sobic005G166200 Sobic002G419550--Sobic002G025200 Sobic002G419550--Sobic001G038050 Sobic002G419550--Sobic002G088300 Sobic002G419550--Sobic002G314100 Sobic002G419550--Sobic004G193100 Sobic004G073300 Sobic004G073300 Sobic002G419550--Sobic004G073300 Sobic002G419550--Sobic003G340200 Sobic002G419550--Sobic006G206600 Sobic010G091250 Sobic010G091250 Sobic002G419550--Sobic010G091250
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.