Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G079400.1
Synonym FRS5
Functional annotation FAR1 family protein, expressed
UniProt A0A1Z5RLL7
Pfam PF04434 PF10551
Panther DB PTHR31669 PTHR31669:SF52
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G38180 : FAR1-related sequence 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g39480.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G311300 GRF zinc finger family protein, expressed -
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19 Sobic.001G202800 - -
20 Sobic.006G261650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic004G079400--Sobic003G311300 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic004G079400--Sobic004G061100 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic004G079400--Sobic003G031300 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic004G079400--Sobic003G030100 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic004G079400--Sobic001G208133 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic004G079400--Sobic006G239200 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic004G079400--Sobic010G227600 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic004G079400--Sobic001G175200 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic004G079400--Sobic004G233100 Sobic003G311300--Sobic001G208133 Sobic003G311300--Sobic006G239200 Sobic003G311300--Sobic004G079400 Sobic003G311300--Sobic003G031300 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic003G311300--Sobic006G038050 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic003G311300--Sobic009G011050 Sobic003G311300--Sobic004G061100 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic003G311300--Sobic001G202800 Sobic003G311300--Sobic003G030100 Sobic004G061100--Sobic001G175200 Sobic004G061100--Sobic004G079400 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic004G061100--Sobic001G509901 Sobic004G061100--Sobic003G311300 Sobic004G061100--Sobic004G233100 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic004G061100--Sobic006G224600 Sobic004G061100--Sobic006G038050 Sobic004G061100--Sobic006G239200 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic004G061100--Sobic003G340200 Sobic003G031300--Sobic003G311300 Sobic003G031300--Sobic006G239200 Sobic003G031300--Sobic001G208133 Sobic003G031300--Sobic004G079400 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic003G031300--Sobic003G059450 Sobic004G352750 Sobic004G352750 Sobic003G031300--Sobic004G352750 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic003G031300--Sobic002G334700 Sobic002G400700 Sobic002G400700 Sobic003G031300--Sobic002G400700 Sobic003G031300--Sobic009G011050 Sobic003G030100--Sobic010G227600 Sobic003G030100--Sobic004G079400 Sobic003G030100--Sobic003G311300 Sobic003G030100--Sobic004G233100 Sobic003G030100--Sobic001G208133 Sobic003G030100--Sobic006G038050 Sobic003G030100--Sobic004G352750 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic003G030100--Sobic001G519500 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic003G030100--Sobic007G043050 Sobic001G208133--Sobic003G311300 Sobic001G208133--Sobic006G239200 Sobic001G208133--Sobic009G011050 Sobic001G208133--Sobic003G031300 Sobic001G208133--Sobic006G038050 Sobic001G208133--Sobic001G202800 Sobic001G208133--Sobic004G079400 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic001G208133--Sobic007G134700 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic001G208133--Sobic004G039000 Sobic006G239200--Sobic003G311300 Sobic006G239200--Sobic009G011050 Sobic006G239200--Sobic001G208133 Sobic006G239200--Sobic003G031300 Sobic006G239200--Sobic001G202800 Sobic002G142400 Sobic002G142400 Sobic006G239200--Sobic002G142400 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic006G239200--Sobic006G037800 Sobic006G239200--Sobic007G134700 Sobic006G239200--Sobic006G038050 Sobic010G227600--Sobic004G233100 Sobic010G227600--Sobic003G030100 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic010G227600--Sobic009G206900 Sobic010G227600--Sobic004G079400 Sobic006G090450 Sobic006G090450 Sobic010G227600--Sobic006G090450 Sobic010G227600--Sobic001G519500 Sobic010G227600--Sobic007G043050 Sobic001G372400 Sobic001G372400 Sobic010G227600--Sobic001G372400 Sobic001G257600 Sobic001G257600 Sobic010G227600--Sobic001G257600 Sobic001G175200--Sobic004G061100 Sobic001G175200--Sobic004G079400 Sobic001G175200--Sobic006G038050 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic001G175200--Sobic006G261650 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic001G175200--Sobic010G228800 Sobic001G175200--Sobic001G509901 Sobic001G175200--Sobic003G311300 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic001G175200--Sobic007G190600 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic001G175200--Sobic003G257650 Sobic004G233100--Sobic010G227600 Sobic004G233100--Sobic001G509901 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic004G233100--Sobic009G248200 Sobic004G233100--Sobic003G030100 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic004G233100--Sobic001G115200 Sobic004G233100--Sobic004G061100 Sobic004G233100--Sobic004G079400 Sobic006G115532 Sobic006G115532 Sobic004G233100--Sobic006G115532 Sobic004G233100--Sobic009G206900
Octagon: transcription factors


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