Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G248200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PB33
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G115200 - -
2 Sobic.004G233100 - -
3 Sobic.001G509901 - -
4 Sobic.010G041301 - -
5 Sobic.001G369701 - -
6 Sobic.005G107250 - -
7 Sobic.007G043050 - -
8 Sobic.010G180300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G206900 - -
10 Sobic.001G372400 - -
11 Sobic.005G019650 - -
12 Sobic.002G142550 - -
13 Sobic.010G165925 - -
14 Sobic.006G185150 - -
15 Sobic.001G519500 - -
16 Sobic.006G224600 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.006G024101 - -
18 Sobic.007G003250 - -
19 Sobic.010G263051 - -
20 Sobic.003G025500 ZOS8-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic009G248200--Sobic001G115200 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic009G248200--Sobic004G233100 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic009G248200--Sobic001G509901 Sobic010G041301 Sobic010G041301 Sobic009G248200--Sobic010G041301 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic009G248200--Sobic001G369701 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic009G248200--Sobic005G107250 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic009G248200--Sobic007G043050 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic009G248200--Sobic010G180300 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic009G248200--Sobic009G206900 Sobic001G115200--Sobic005G107250 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic001G115200--Sobic005G019650 Sobic001G115200--Sobic010G180300 Sobic006G185150 Sobic006G185150 Sobic001G115200--Sobic006G185150 Sobic006G024101 Sobic006G024101 Sobic001G115200--Sobic006G024101 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic001G115200--Sobic002G142550 Sobic003G294550 Sobic003G294550 Sobic001G115200--Sobic003G294550 Sobic001G115200--Sobic001G369701 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic001G115200--Sobic010G263051 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic004G233100--Sobic010G227600 Sobic004G233100--Sobic001G509901 Sobic004G233100--Sobic009G248200 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic004G233100--Sobic003G030100 Sobic004G233100--Sobic001G115200 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic004G233100--Sobic004G061100 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic004G233100--Sobic004G079400 Sobic006G115532 Sobic006G115532 Sobic004G233100--Sobic006G115532 Sobic004G233100--Sobic009G206900 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic001G509901--Sobic005G166200 Sobic001G509901--Sobic004G061100 Sobic001G509901--Sobic004G233100 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic001G509901--Sobic006G224600 Sobic001G509901--Sobic009G248200 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic001G509901--Sobic003G340200 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic001G509901--Sobic002G025200 Sobic001G509901--Sobic009G206900 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic001G509901--Sobic001G175200 Sobic009G116832 Sobic009G116832 Sobic010G041301--Sobic009G116832 Sobic003G242400 Sobic003G242400 Sobic010G041301--Sobic003G242400 Sobic003G329100 Sobic003G329100 Sobic010G041301--Sobic003G329100 Sobic004G007550 Sobic004G007550 Sobic010G041301--Sobic004G007550 Sobic004G300400 Sobic004G300400 Sobic010G041301--Sobic004G300400 Sobic007G151900 Sobic007G151900 Sobic010G041301--Sobic007G151900 Sobic010G230100 Sobic010G230100 Sobic010G041301--Sobic010G230100 Sobic006G244900 Sobic006G244900 Sobic010G041301--Sobic006G244900 Sobic001G452800 Sobic001G452800 Sobic010G041301--Sobic001G452800 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic001G369701--Sobic010G165925 Sobic001G369701--Sobic005G107250 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic001G369701--Sobic007G003250 Sobic001G369701--Sobic002G142550 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic001G369701--Sobic006G007700 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic001G369701--Sobic001G519500 Sobic001G369701--Sobic001G115200 Sobic001G369701--Sobic007G043050 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic001G369701--Sobic003G025500 Sobic005G107250--Sobic002G142550 Sobic005G107250--Sobic010G165925 Sobic005G107250--Sobic010G180300 Sobic005G107250--Sobic001G115200 Sobic005G107250--Sobic005G019650 Sobic005G107250--Sobic001G369701 Sobic005G107250--Sobic007G003250 Sobic005G107250--Sobic006G185150 Sobic005G107250--Sobic006G024101 Sobic007G043050--Sobic001G519500 Sobic007G043050--Sobic006G007700 Sobic007G043050--Sobic001G369701 Sobic007G043050--Sobic010G165925 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic007G043050--Sobic007G203600 Sobic007G043050--Sobic007G003250 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic007G043050--Sobic006G196800 Sobic007G043050--Sobic005G107250 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic007G043050--Sobic010G263151 Sobic010G180300--Sobic005G019650 Sobic010G180300--Sobic005G107250 Sobic010G180300--Sobic006G024101 Sobic010G180300--Sobic006G185150 Sobic010G180300--Sobic001G115200 Sobic010G180300--Sobic003G294550 Sobic008G135401 Sobic008G135401 Sobic010G180300--Sobic008G135401 Sobic010G180300--Sobic002G142550 Sobic010G180300--Sobic010G263051 Sobic006G090450 Sobic006G090450 Sobic009G206900--Sobic006G090450 Sobic009G206900--Sobic001G452800 Sobic008G142450 Sobic008G142450 Sobic009G206900--Sobic008G142450 Sobic009G206900--Sobic010G227600 Sobic009G206900--Sobic010G041301 Sobic009G206900--Sobic010G230100 Sobic001G372400 Sobic001G372400 Sobic009G206900--Sobic001G372400 Sobic009G206900--Sobic004G233100 Sobic003G108050 Sobic003G108050 Sobic009G206900--Sobic003G108050
Octagon: transcription factors


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