Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G175200.1
Synonym Sb01g015230
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WTA6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g39980.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G061100 - -
2 Sobic.004G079400 FAR1 family protein, expressed -
3 Sobic.006G038050 - -
4 Sobic.006G261650 - -
5 Sobic.010G228800 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
6 Sobic.001G509901 - -
7 Sobic.003G311300 GRF zinc finger family protein, expressed -
8 Sobic.007G190600 - -
9 Sobic.003G257650 - -
10 Sobic.001G397550 - -
11 Sobic.003G340200 - -
12 Sobic.006G224600 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G166200 MTN26L5 - MtN26 family protein precursor, expressed -
14 Sobic.002G367000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed K01126: E3.1.4.46, glpQ, glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
15 Sobic.004G233100 - -
16 Sobic.009G011050 - -
17 Sobic.005G198150 - -
18 Sobic.006G241500 - -
19 Sobic.007G136500 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
20 Sobic.006G239200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic001G175200--Sobic004G061100 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic001G175200--Sobic004G079400 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic001G175200--Sobic006G038050 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic001G175200--Sobic006G261650 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic001G175200--Sobic010G228800 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic001G175200--Sobic001G509901 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic001G175200--Sobic003G311300 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic001G175200--Sobic007G190600 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic001G175200--Sobic003G257650 Sobic004G061100--Sobic001G175200 Sobic004G061100--Sobic004G079400 Sobic004G061100--Sobic001G509901 Sobic004G061100--Sobic003G311300 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic004G061100--Sobic004G233100 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic004G061100--Sobic006G224600 Sobic004G061100--Sobic006G038050 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic004G061100--Sobic006G239200 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic004G061100--Sobic003G340200 Sobic004G079400--Sobic003G311300 Sobic004G079400--Sobic004G061100 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic004G079400--Sobic003G031300 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic004G079400--Sobic003G030100 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic004G079400--Sobic001G208133 Sobic004G079400--Sobic006G239200 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic004G079400--Sobic010G227600 Sobic004G079400--Sobic001G175200 Sobic004G079400--Sobic004G233100 Sobic006G038050--Sobic003G311300 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic006G038050--Sobic010G149000 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic006G038050--Sobic006G037800 Sobic006G038050--Sobic001G208133 Sobic002G149500 Sobic002G149500 Sobic006G038050--Sobic002G149500 Sobic006G038050--Sobic006G239200 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic009G011050 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic006G038050--Sobic007G134700 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic006G038050--Sobic003G383000 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic006G261650--Sobic005G154600 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic006G261650--Sobic004G276600 Sobic002G337400 Sobic002G337400 Sobic006G261650--Sobic002G337400 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic006G261650--Sobic003G169700 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic006G261650--Sobic002G154450 Sobic006G261650--Sobic007G190600 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic006G261650--Sobic001G420150 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic006G261650--Sobic007G085400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G261650--Sobic007G127200 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic010G228800--Sobic005G198150 Sobic010G228800--Sobic001G175200 Sobic006G241500 Sobic006G241500 Sobic010G228800--Sobic006G241500 Sobic010G228800--Sobic001G509901 Sobic010G228800--Sobic006G224600 Sobic010G228800--Sobic004G061100 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic010G228800--Sobic001G486400 Sobic010G228800--Sobic003G340200 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic010G228800--Sobic005G166200 Sobic001G509901--Sobic005G166200 Sobic001G509901--Sobic004G061100 Sobic001G509901--Sobic004G233100 Sobic001G509901--Sobic006G224600 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic001G509901--Sobic009G248200 Sobic001G509901--Sobic003G340200 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic001G509901--Sobic002G025200 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic001G509901--Sobic009G206900 Sobic001G509901--Sobic001G175200 Sobic003G311300--Sobic001G208133 Sobic003G311300--Sobic006G239200 Sobic003G311300--Sobic004G079400 Sobic003G311300--Sobic003G031300 Sobic003G311300--Sobic006G038050 Sobic003G311300--Sobic009G011050 Sobic003G311300--Sobic004G061100 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic003G311300--Sobic001G202800 Sobic003G311300--Sobic003G030100 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic007G190600--Sobic007G190466 Sobic007G190600--Sobic004G276600 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic007G190600--Sobic004G127766 Sobic007G190600--Sobic005G154600 Sobic007G190600--Sobic006G261650 Sobic007G190600--Sobic001G420150 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic007G190600--Sobic002G246100 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic007G190600--Sobic006G059150 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic007G190600--Sobic004G332200 Sobic002G367000 Sobic002G367000 Sobic003G257650--Sobic002G367000 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic003G257650--Sobic003G394150 Sobic003G257650--Sobic001G175200 Sobic010G226100 Sobic010G226100 Sobic003G257650--Sobic010G226100 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic003G257650--Sobic010G020000 Sobic005G078600 Sobic005G078600 Sobic003G257650--Sobic005G078600 Sobic003G257650--Sobic007G190600 Sobic003G257650--Sobic006G038050 Sobic003G257650--Sobic006G241500
Octagon: transcription factors


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