Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G136500.2
Synonym NOK, MYB106, Sb07g021210, AtMYB106
Functional annotation MYB family transcription factor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RAP0
Pfam PF00249
Panther DB PTHR10641 PTHR10641:SF546
NCBI CDD -
KEGG Orthology K09422; transcription factor MYB, plant
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G01140 : myb domain protein 106
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g33660.1 : MYB family transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031141 , Zm00025a029106 , Zm00025a005940 , Zm00025a034111 , Zm00025a027136
Brachypodium KQJ98396 , KQJ87177 , KQK21312 , KQJ82982 , PNT68155
Barley HORVU2Hr1G120340.21 , HORVU2Hr1G120340.20 , HORVU2Hr1G120340.23 , HORVU2Hr1G120340.22 , HORVU2Hr1G120340.25 , HORVU2Hr1G120340.24 , HORVU2Hr1G120340.26 , HORVU2Hr1G120340.29 , HORVU2Hr1G120340.28 , HORVU2Hr1G120340.36 , HORVU2Hr1G120340.37 , HORVU2Hr1G120340.34 , HORVU2Hr1G120340.35 , HORVU2Hr1G120340.32 , HORVU2Hr1G120340.33 , HORVU2Hr1G120340.30 , HORVU2Hr1G120340.38 , HORVU2Hr1G120340.39 , HORVU2Hr1G120340.43 , HORVU2Hr1G120340.42 , HORVU2Hr1G120340.41 , HORVU2Hr1G120340.40 , HORVU2Hr1G120340.47 , HORVU2Hr1G120340.46 , HORVU2Hr1G120340.45 , HORVU2Hr1G120340.44 , HORVU2Hr1G120340.48 , HORVU3Hr1G100500.1 , HORVU2Hr1G120340.50 , HORVU2Hr1G120340.51 , HORVU2Hr1G120340.52 , HORVU2Hr1G120340.53 , HORVU2Hr1G120340.18 , HORVU2Hr1G120340.19 , HORVU2Hr1G120340.14 , HORVU2Hr1G120340.15 , HORVU2Hr1G120340.16 , HORVU2Hr1G120340.17 , HORVU2Hr1G120340.10 , HORVU2Hr1G120340.11 , HORVU2Hr1G120340.12 , HORVU2Hr1G120340.13 , HORVU2Hr1G120340.6 , HORVU2Hr1G120340.7 , HORVU2Hr1G120340.4 , HORVU2Hr1G120340.5 , HORVU2Hr1G120340.2 , HORVU2Hr1G120340.3 , HORVU2Hr1G120340.1 , HORVU2Hr1G120340.8 , HORVU2Hr1G120340.9
Wheat TraesCS2B02G343800 , TraesCS5B02G556300 , TraesCS2A02G552400 , TraesCS2B02G583800 , TraesCS6A02G137800 , TraesCS3B02G515900 , TraesCS7D02G026900 , TraesCS3D02G468400 , TraesCS3B02G416400 , TraesCS7D02G027000 , TraesCS2D02G324800 , TraesCS2A02G338200 , TraesCS4A02G322200 , TraesCS6D02G126900
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G038050 - -
2 Sobic.004G270900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G154600 - -
4 Sobic.007G190600 - -
5 Sobic.006G261650 - -
6 Sobic.006G037800 - -
7 Sobic.007G134700 formin, putative, expressed -
8 Sobic.003G251000 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
9 Sobic.002G154450 - -
10 Sobic.010G149000 - -
11 Sobic.009G011050 - -
12 Sobic.003G311300 GRF zinc finger family protein, expressed -
13 Sobic.002G246100 - -
14 Sobic.004G260250 - -
15 Sobic.004G276600 expressed protein -
16 Sobic.005G176300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
17 Sobic.001G175200 expressed protein -
18 Sobic.010G132400 Os6bglu24 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
19 Sobic.002G149500 ELF protein, expressed -
20 Sobic.005G109101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G136500 Sobic007G136500 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic007G136500--Sobic006G038050 Sobic004G270900 Sobic004G270900 Sobic007G136500--Sobic004G270900 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic007G136500--Sobic005G154600 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic007G136500--Sobic007G190600 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic007G136500--Sobic006G261650 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic007G136500--Sobic006G037800 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic007G136500--Sobic007G134700 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic007G136500--Sobic003G251000 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic007G136500--Sobic002G154450 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic006G038050--Sobic003G311300 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic006G038050--Sobic010G149000 Sobic006G038050--Sobic006G037800 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic006G038050--Sobic001G208133 Sobic002G149500 Sobic002G149500 Sobic006G038050--Sobic002G149500 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic006G038050--Sobic006G239200 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic007G134700 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic006G038050--Sobic003G383000 Sobic004G270900--Sobic006G261650 Sobic004G270900--Sobic007G136500 Sobic004G270900--Sobic005G154600 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic004G270900--Sobic004G276600 Sobic006G212200 Sobic006G212200 Sobic004G270900--Sobic006G212200 Sobic004G270900--Sobic002G154450 Sobic004G270900--Sobic007G190600 Sobic002G337400 Sobic002G337400 Sobic004G270900--Sobic002G337400 Sobic004G270900--Sobic010G149000 Sobic005G154600--Sobic006G261650 Sobic005G154600--Sobic004G276600 Sobic005G154600--Sobic002G154450 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic005G154600--Sobic010G247750 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic005G154600--Sobic004G310350 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic005G154600--Sobic006G035350 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic005G154600--Sobic008G093300 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic005G154600--Sobic010G132400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic005G154600--Sobic007G127200 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic007G190600--Sobic007G190466 Sobic007G190600--Sobic004G276600 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic007G190600--Sobic004G127766 Sobic007G190600--Sobic005G154600 Sobic007G190600--Sobic006G261650 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic007G190600--Sobic001G420150 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic007G190600--Sobic002G246100 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic007G190600--Sobic006G059150 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic007G190600--Sobic004G332200 Sobic006G261650--Sobic005G154600 Sobic006G261650--Sobic004G276600 Sobic006G261650--Sobic002G337400 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic006G261650--Sobic003G169700 Sobic006G261650--Sobic002G154450 Sobic006G261650--Sobic007G190600 Sobic006G261650--Sobic001G420150 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic006G261650--Sobic007G085400 Sobic006G261650--Sobic007G127200 Sobic006G037800--Sobic010G149000 Sobic006G037800--Sobic007G134700 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic006G037800--Sobic010G052100 Sobic006G037800--Sobic002G154450 Sobic006G037800--Sobic003G251000 Sobic006G037800--Sobic006G239200 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic006G037800--Sobic001G202800 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic006G037800--Sobic005G176300 Sobic006G037800--Sobic009G011050 Sobic007G134700--Sobic006G037800 Sobic007G134700--Sobic010G149000 Sobic003G254850 Sobic003G254850 Sobic007G134700--Sobic003G254850 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic007G134700--Sobic008G056000 Sobic007G134700--Sobic010G052100 Sobic007G134700--Sobic003G251000 Sobic007G134700--Sobic001G202800 Sobic007G134700--Sobic009G011050 Sobic007G134700--Sobic006G239200 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic003G251000--Sobic006G149900 Sobic003G251000--Sobic002G154450 Sobic003G251000--Sobic010G052100 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic003G251000--Sobic009G094100 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic003G251000--Sobic004G127350 Sobic003G251000--Sobic005G176300 Sobic003G251000--Sobic006G037800 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic003G251000--Sobic004G072600 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic003G251000--Sobic007G103200 Sobic002G154450--Sobic010G052100 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic002G154450--Sobic004G127733 Sobic002G154450--Sobic007G127200 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic002G154450--Sobic006G176900 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic002G154450--Sobic001G045900 Sobic002G154450--Sobic003G251000 Sobic002G154450--Sobic006G149900 Sobic002G154450--Sobic010G149000 Sobic002G154450--Sobic005G154600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.