Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G149500.1
Synonym Sb02g017571
Functional annotation ELF protein, expressed
UniProt A0A1B6QBE7
Pfam PF03317
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g33944.1 : ELF protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G038050 - -
2 Sobic.010G149000 - -
3 Sobic.003G383000 expressed protein -
4 Sobic.001G440401 - -
5 Sobic.002G168750 - -
6 Sobic.006G037800 - -
7 Sobic.007G083700 - -
8 Sobic.003G288700 expressed protein -
9 Sobic.007G134700 formin, putative, expressed -
10 Sobic.001G072100 OsFBX111 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G056000 nifU, putative, expressed -
12 Sobic.004G260250 - -
13 Sobic.003G198850 - -
14 Sobic.002G246100 - -
15 Sobic.003G244250 - -
16 Sobic.002G168700 carotenoid cleavage dioxygenase, putative, expressed -
17 Sobic.006G233900 biotin--protein ligase, putative, expressed -
18 Sobic.002G154450 - -
19 Sobic.007G013700 - -
20 Sobic.001G491500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G149500 Sobic002G149500 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic002G149500--Sobic006G038050 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic002G149500--Sobic010G149000 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic002G149500--Sobic003G383000 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic002G149500--Sobic001G440401 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic002G149500--Sobic002G168750 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic002G149500--Sobic006G037800 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic002G149500--Sobic007G083700 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic002G149500--Sobic003G288700 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic002G149500--Sobic007G134700 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic006G038050--Sobic003G311300 Sobic006G038050--Sobic010G149000 Sobic006G038050--Sobic006G037800 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic006G038050--Sobic001G208133 Sobic006G038050--Sobic002G149500 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic006G038050--Sobic006G239200 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic007G134700 Sobic006G038050--Sobic003G383000 Sobic010G149000--Sobic006G037800 Sobic010G149000--Sobic007G134700 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic010G149000--Sobic002G154450 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic010G149000--Sobic010G052100 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic010G149000--Sobic003G024450 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic010G149000--Sobic008G056000 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic010G149000--Sobic010G225175 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic010G149000--Sobic001G202800 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic010G149000--Sobic004G143550 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic003G383000--Sobic001G072100 Sobic001G404950 Sobic001G404950 Sobic003G383000--Sobic001G404950 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic003G383000--Sobic003G198850 Sobic003G383000--Sobic002G149500 Sobic006G233900 Sobic006G233900 Sobic003G383000--Sobic006G233900 Sobic003G383000--Sobic006G038050 Sobic003G383000--Sobic003G288700 Sobic003G383000--Sobic002G168750 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic003G383000--Sobic010G020000 Sobic001G440401--Sobic003G288700 Sobic001G440401--Sobic008G056000 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic001G440401--Sobic008G167900 Sobic001G440401--Sobic002G168750 Sobic001G440401--Sobic010G149000 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic001G440401--Sobic002G025900 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic001G440401--Sobic004G092950 Sobic001G440401--Sobic007G134700 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic001G440401--Sobic004G023800 Sobic002G168750--Sobic007G083700 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic002G168750--Sobic002G168700 Sobic002G168750--Sobic001G440401 Sobic002G168750--Sobic006G233900 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic002G168750--Sobic004G159866 Sobic002G168750--Sobic003G288700 Sobic002G168750--Sobic008G056000 Sobic002G168750--Sobic008G167900 Sobic002G168750--Sobic001G072100 Sobic006G037800--Sobic010G149000 Sobic006G037800--Sobic007G134700 Sobic006G037800--Sobic010G052100 Sobic006G037800--Sobic002G154450 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic006G037800--Sobic003G251000 Sobic006G037800--Sobic006G239200 Sobic006G037800--Sobic001G202800 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic006G037800--Sobic005G176300 Sobic006G037800--Sobic009G011050 Sobic007G083700--Sobic002G168750 Sobic007G083700--Sobic004G159866 Sobic007G083700--Sobic002G168700 Sobic002G075100 Sobic002G075100 Sobic007G083700--Sobic002G075100 Sobic007G083700--Sobic006G233900 Sobic007G013700 Sobic007G013700 Sobic007G083700--Sobic007G013700 Sobic007G083700--Sobic001G072100 Sobic007G083700--Sobic002G149500 Sobic007G083700--Sobic010G020000 Sobic003G288700--Sobic001G440401 Sobic003G288700--Sobic008G167900 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic003G288700--Sobic009G184450 Sobic003G288700--Sobic008G056000 Sobic003G288700--Sobic004G023800 Sobic003G288700--Sobic001G072100 Sobic003G288700--Sobic002G168750 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic003G288700--Sobic006G065000 Sobic003G288700--Sobic002G025900 Sobic007G134700--Sobic006G037800 Sobic007G134700--Sobic010G149000 Sobic003G254850 Sobic003G254850 Sobic007G134700--Sobic003G254850 Sobic007G134700--Sobic008G056000 Sobic007G134700--Sobic010G052100 Sobic007G134700--Sobic003G251000 Sobic007G134700--Sobic001G202800 Sobic007G134700--Sobic009G011050 Sobic007G134700--Sobic006G239200
Octagon: transcription factors


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