Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G383000.1
Synonym Sb03g042255
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q7F2
Pfam -
Panther DB PTHR35361 PTHR35361:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g34410.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033508
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G072100 OsFBX111 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G404950 - -
3 Sobic.003G198850 - -
4 Sobic.002G149500 ELF protein, expressed -
5 Sobic.006G233900 biotin--protein ligase, putative, expressed -
6 Sobic.006G038050 - -
7 Sobic.003G288700 expressed protein -
8 Sobic.002G168750 - -
9 Sobic.010G020000 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
10 Sobic.008G157400 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
11 Sobic.007G083700 - -
12 Sobic.001G440401 - -
13 Sobic.008G167900 - -
14 Sobic.002G168700 carotenoid cleavage dioxygenase, putative, expressed -
15 Sobic.002G367000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed K01126: E3.1.4.46, glpQ, glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
16 Sobic.004G115950 - -
17 Sobic.002G359500 - -
18 Sobic.007G013700 - -
19 Sobic.001G491500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.010G149000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic003G383000--Sobic001G072100 Sobic001G404950 Sobic001G404950 Sobic003G383000--Sobic001G404950 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic003G383000--Sobic003G198850 Sobic002G149500 Sobic002G149500 Sobic003G383000--Sobic002G149500 Sobic006G233900 Sobic006G233900 Sobic003G383000--Sobic006G233900 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic003G383000--Sobic006G038050 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic003G383000--Sobic003G288700 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic003G383000--Sobic002G168750 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic003G383000--Sobic010G020000 Sobic001G072100--Sobic003G383000 Sobic001G072100--Sobic003G288700 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic001G072100--Sobic008G167900 Sobic001G072100--Sobic006G233900 Sobic001G072100--Sobic002G168750 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic001G072100--Sobic001G440401 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic001G072100--Sobic007G083700 Sobic001G072100--Sobic003G198850 Sobic001G072100--Sobic002G149500 Sobic001G404950--Sobic003G383000 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic001G404950--Sobic008G157400 Sobic001G404950--Sobic003G198850 Sobic001G461101 Sobic001G461101 Sobic001G404950--Sobic001G461101 Sobic001G404950--Sobic001G072100 Sobic001G404950--Sobic003G288700 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic001G404950--Sobic004G115950 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic001G404950--Sobic003G340500 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic001G404950--Sobic009G190100 Sobic003G198850--Sobic003G383000 Sobic003G198850--Sobic001G404950 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic003G198850--Sobic008G053800 Sobic003G198850--Sobic004G115950 Sobic003G198850--Sobic001G072100 Sobic003G198850--Sobic003G288700 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic003G198850--Sobic004G023800 SobicK004201 SobicK004201 Sobic003G198850--SobicK004201 Sobic003G198850--Sobic002G149500 Sobic002G149500--Sobic006G038050 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic002G149500--Sobic010G149000 Sobic002G149500--Sobic003G383000 Sobic002G149500--Sobic001G440401 Sobic002G149500--Sobic002G168750 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic002G149500--Sobic006G037800 Sobic002G149500--Sobic007G083700 Sobic002G149500--Sobic003G288700 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic002G149500--Sobic007G134700 Sobic006G233900--Sobic002G168750 Sobic006G233900--Sobic007G083700 Sobic006G233900--Sobic001G072100 Sobic006G233900--Sobic003G383000 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic006G233900--Sobic002G168700 Sobic006G233900--Sobic001G440401 Sobic007G013700 Sobic007G013700 Sobic006G233900--Sobic007G013700 Sobic006G233900--Sobic008G167900 Sobic006G233900--Sobic003G288700 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic006G038050--Sobic003G311300 Sobic006G038050--Sobic010G149000 Sobic006G038050--Sobic006G037800 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic006G038050--Sobic001G208133 Sobic006G038050--Sobic002G149500 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic006G038050--Sobic006G239200 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic007G134700 Sobic006G038050--Sobic003G383000 Sobic003G288700--Sobic001G440401 Sobic003G288700--Sobic008G167900 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic003G288700--Sobic009G184450 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic003G288700--Sobic008G056000 Sobic003G288700--Sobic004G023800 Sobic003G288700--Sobic001G072100 Sobic003G288700--Sobic002G168750 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic003G288700--Sobic006G065000 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic003G288700--Sobic002G025900 Sobic002G168750--Sobic007G083700 Sobic002G168750--Sobic002G168700 Sobic002G168750--Sobic001G440401 Sobic002G168750--Sobic006G233900 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic002G168750--Sobic004G159866 Sobic002G168750--Sobic003G288700 Sobic002G168750--Sobic008G056000 Sobic002G168750--Sobic008G167900 Sobic002G168750--Sobic001G072100 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic010G020000--Sobic003G394150 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic010G020000--Sobic009G053700 Sobic010G020000--Sobic002G168700 Sobic010G020000--Sobic007G083700 Sobic010G020000--Sobic003G383000 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic010G020000--Sobic009G178650 Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic010G020000--Sobic004G216650 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic010G020000--Sobic003G257650 Sobic003G373050 Sobic003G373050 Sobic010G020000--Sobic003G373050
Octagon: transcription factors


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